本發(fā)明屬于dna提取方法
技術(shù)領(lǐng)域:
,具體涉及一種花生組織的dna快速提取方法。
背景技術(shù):
:花生一直是我國傳統(tǒng)的農(nóng)作物種植品種之一,也是主要的油料作物,花生種含有豐富的油酸和亞油酸,營養(yǎng)豐富,由花生制備而成的花生壓榨油是人們的常用的食用油。傳統(tǒng)的花生育種過程為自然雜交、自交或者轉(zhuǎn)基因分子育種,分子育種首先涉及的就是花生dna的提取,轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)化體的鑒定篩選。大量的分子育種工作已經(jīng)很繁雜,簡便快速的dna提取方法一直是廣大科研工作者的需求。目前,由于花生組織包括根、莖、葉、種子等,干擾基因組dna的提取的因子也很多,傳統(tǒng)的基因組dna提取方法包括ctab和酚類法,這些方法提取dna過程中,步驟操作繁瑣、耗時,通常ctab法制備提取dna需要數(shù)小時甚至更長的時間,極大的浪費了時間資源。因此,有必要尋求一種快速的dna的快速提取方法。技術(shù)實現(xiàn)要素:本發(fā)明提供的一種花生組織的dna快速提取方法,解決了傳統(tǒng)的ctab和酚類法提取基因組dna,步驟操作繁瑣、耗時的問題。本發(fā)明目的是提供一種花生組織的dna快速提取方法,包括以下步驟:s1,材料預(yù)處理:采集花生組織,洗凈晾干,交替置于-20℃5min和20℃5min,每個溫度各兩次,再次晾干,得到待測樣品;s2,取待測樣品,加入玻璃珠研磨至粉末狀,然后加入dna提取液研磨,后置于40±1℃條件下水浴30min,然后加入β-巰基乙醇和20g/100ml的sds,65℃水浴加熱20min,離心,收集第一次上清液;其中,1ldna提取貯藏液中含有0.1moltris-hcl、0.1moledta、1.5molnacl、10gctab、ph8.0;使用時,每毫升dna提取貯藏液中加入40μl100mg/ml纖維素酶和40μl50mg/ml脂肪酶,作為dna提取液使用;s3,向第一次上清液中,加入0.8倍體積經(jīng)4℃預(yù)冷的異丙醇,混勻,-20℃放置≥20min的時間,離心,棄上清,收集dna沉淀;s4,在dna沉淀中加入75%乙醇,離心,棄上清,最后置于通風(fēng)處風(fēng)干;s5,風(fēng)干的dna沉淀用te溶解,-20℃保存?zhèn)溆?。?yōu)選的,上述的花生組織的dna快速提取方法,s2中,所述脂肪酶為堿性脂肪酶或者中性脂肪酶。優(yōu)選的,上述的花生組織的dna快速提取方法,s2中,待測樣品、dna提取液、β-巰基乙醇和20g/100ml的sds的比例為1g:2ml:50μl:20μl。優(yōu)選的,上述的花生組織的dna快速提取方法,s2、s4中離心的條件均為4℃、12000rpm離心10min,s3中離心的條件均為4℃、12000rpm離心15min。優(yōu)選的,上述的花生組織的dna快速提取方法,s2與s3之間還包括有機溶劑萃取步驟,具體為:s2中收集第一次上清液后,取第一次上清液轉(zhuǎn)入新的離心管中,加入等體積的體積比為25:24:1的苯酚:氯仿:異戊醇溶液,在4℃下12000rpm離心10min,收集第二次上清液;然后向第二次上清液中,加入0.8倍體積經(jīng)4℃預(yù)冷的異丙醇。優(yōu)選的,上述的花生組織的dna快速提取方法,s6中,風(fēng)干的dna沉淀用50μlph8.0te溶解,然后加入1μl10ng/μl的rnasea,常溫過夜后置于-20℃保存?zhèn)溆?。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明提供的一種花生組織的dna快速提取方法,具有以下有益效果:1、適用于花生的根、莖、葉、花、種子等不同組織,dna提取液中添加纖維素酶用于溶解植物中纖維素,添加脂肪酶用于溶解樣品中脂肪,尤其是溶解花生種子中脂肪,使dna更容易釋放,提高dna純度;20g/100ml的sds用于裂解細(xì)胞,β-巰基乙醇一方面具有抗氧化效果,另一方面,其與sds聯(lián)合使用,可以沉淀掉蛋白質(zhì),比單獨使用sds效果更佳,避免蛋白質(zhì)對dna純度的影響。2、傳統(tǒng)ctab方法排除人為操作時間誤差,提取植物dna耗時120min以上,而本發(fā)明的方法取花生組織dna耗時70min左右,耗時短、dna純度高,并且提取過程中不使用苯酚等揮發(fā)性有毒有機溶劑,減少有機溶劑對人體健康的損害,安全性高。附圖說明圖1為花生葉片基因組dna的酶切電泳圖譜;其中,1號泳道均為bamhⅰ酶切結(jié)果,2號泳道為kpnⅰ酶切結(jié)果,3號泳道為pstⅰ酶切結(jié)果,4號泳道為花生葉片基因組dna。具體實施方式下面結(jié)合具體實施例對本發(fā)明進行詳細(xì)說明,但不應(yīng)理解為本發(fā)明的限制。下述實施例中的實驗方法,如無特殊說明,均為常規(guī)方法,下述實施例中所用的材料、試劑等,如無特殊說明,均可從商業(yè)途徑得到。下述實施例中涉及到數(shù)據(jù)范圍的,在該數(shù)據(jù)范圍內(nèi)包括兩個端點的任何數(shù)值均可實現(xiàn),由于效果和步驟相同,故不贅述。實施例1一種花生組織的dna快速提取方法,包括以下步驟:s1,材料預(yù)處理:采集根、莖、葉、花或者種子等花生組織,洗凈晾干,置于-20℃5min,再置于20℃5min,再置于-20℃5min,再置于20℃5min,最后再次晾干,得到待測樣品。s2,取1g待測樣品置于研磨中,加入玻璃珠研磨至粉末狀,玻璃珠的直徑φ:0.4-0.6mm,然后加入2mldna提取液研磨5-10min,后置于40±1℃條件下水浴30min,然后加入50μlβ-巰基乙醇和20μl20g/100ml的sds,65℃水浴加熱20min,4℃、12000rpm離心10min,收集第一次上清液。其中,1ldna提取貯藏液中含有0.1moltris-hcl、0.1moledta、1.5molnacl、10gctab、ph8.0;使用時,每毫升dna提取貯藏液中加入40μl100mg/ml纖維素酶和40μl50mg/ml堿性脂肪酶,作為dna提取液使用。s3,將第一次上清液轉(zhuǎn)入新的1.5ml離心管中,加入0.8倍體積經(jīng)4℃預(yù)冷的異丙醇,顛倒混勻,-20℃放置20min,12000rpm離心15min,棄上清,收集dna沉淀。s4,在dna沉淀中加入75%乙醇600μl,輕搖5min,以清洗dna,12000rpm離心10min,棄上清,重復(fù)清洗步驟1次,最后置于通風(fēng)處風(fēng)干。s5,風(fēng)干的dna沉淀用50μlph8.0te溶解,然后加入1μl10ng/μl的rnasea,常溫過夜后置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩N覀円曰ㄉN子為對象,利用實施例1的方法提取基因組dna,圖1為花生種子基因組dna的酶切電泳圖譜;其中,1號泳道均為bamhⅰ酶切結(jié)果,2號泳道為kpnⅰ酶切結(jié)果,3號泳道為pstⅰ酶切結(jié)果,4號泳道為花生葉片基因組dna。各個泳道均可見清晰條帶,說明本發(fā)明方法提取的dna不會影響后續(xù)酶切、pcr等步驟。取2μl實施例1溶解的dna溶液,在eppendorfbiophotomete型核酸蛋白質(zhì)分析儀上檢測260nm、280nm處的吸收值和dna的濃度,并根據(jù)od260/od280值、od260/od230值來判斷dna的純度,結(jié)果如表1所示。表1結(jié)果顯示,采用實施例1的方法提取花生不同組織的dna均具有較高的純度。表1實施例1花生不同組織提取的dna檢測信息實施例2一種花生組織的dna快速提取方法,包括以下步驟:s1,材料預(yù)處理:采集根、莖、葉、花或者種子等花生組織,洗凈晾干,置于-20℃5min,再置于20℃5min,再置于-20℃5min,再置于20℃5min,最后再次晾干,得到待測樣品。s2,取0.5g待測樣品置于研磨中,加入玻璃珠研磨至粉末狀,玻璃珠的直徑φ:0.4-0.6mm,然后加入1mldna提取液研磨5-10min,后置于40±1℃條件下水浴30min,然后加入25μlβ-巰基乙醇和10μl20g/100ml的sds,65℃水浴加熱20min,4℃、12000rpm離心10min,收集第一次上清液;其中1ldna提取貯藏液中含有0.1moltris-hcl、0.1moledta、1.5molnacl、10gctab、ph8.0;使用時,每毫升dna提取貯藏液中加入40μl100mg/ml纖維素酶和40μl50mg/ml中性脂肪酶,作為dna提取液使用。取第一次上清液轉(zhuǎn)入新的2.0ml的離心管中,加入等體積的體積比為24:1的氯仿:異戊醇溶液,輕搖萃取使蛋白質(zhì)變性,在4℃下12000rpm離心10min,收集第二次上清液。s3,將第二次上清液轉(zhuǎn)入新的1.5ml離心管中,加入0.8倍體積經(jīng)4℃預(yù)冷的異丙醇,顛倒混勻,-20℃放置30min,12000rpm離心15min,棄上清,收集dna沉淀。s4,在dna沉淀中加入75%乙醇600μl,輕搖5min,以清洗dna,12000rpm離心10min,棄上清,重復(fù)清洗步驟1次,置于通風(fēng)處風(fēng)干。s5,風(fēng)干的dna沉淀用50μlph8.0te溶解,然后加入1μl10ng/μl的rnasea,常溫過夜后置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩H?μl實施例2溶解的dna溶液,在eppendorfbiophotomete型核酸蛋白質(zhì)分析儀上檢測260nm、280nm處的吸收值和dna的濃度,并根據(jù)od260/od280值、od260/od230值來判斷dna的純度,結(jié)果參見表2。表2結(jié)果顯示,采用實施例2的方法提取花生不同組織的dna均具有較高的純度。表2實施例2花生不同組織提取的dna檢測信息根莖葉花種子樣品質(zhì)量(g)0.5320.5310.5350.5290.528濃度(ng/μl)400351.4390.7380387.1od260/od2801.801.781.801.771.82od260/od2302.082.112.102.082.05傳統(tǒng)ctab方法排除人為操作時間誤差,提取植物dna耗時120min以上,而本發(fā)明的方法取花生組織dna耗時70min左右,耗時短、dna純度高,并且提取過程中不使用苯酚等揮發(fā)性有毒有機溶劑,減少有機溶劑對人體健康的損害,安全性高。為了驗證本發(fā)明提取方法的效果,我們以花生種子為樣品,設(shè)計了對照一組、對照二組、對照三組和實驗組。其中實驗組采用實施例1的試劑和方法。對照一組與實施例1的方法相似,只是將dna提取液的配方替換為1ldna提取液中含有0.1moltris-hcl、0.1moledta、1.5molnacl、10gctab、ph8.0。對照二組與實施例1的方法相似,只是將“加入50μlβ-巰基乙醇和20μl20g/100ml的sds,65℃水浴加熱20min”改為“加入20μl20g/100ml的sds,65℃水浴加熱20min”。對照三組采用授權(quán)公告號為cn101805730b,名稱為《花生健康組織和病組織簡便快速dna提取方法》中述及的方法。在eppendorfbiophotomete型核酸蛋白質(zhì)分析儀上檢測260nm、280nm處的吸收值和dna的濃度,并根據(jù)od260/od280值來判斷dna的純度,結(jié)果如下:實驗組的od260/od280值為1.82,純度高;對照一組、對照二組的od260/od280值分別為1.45、1.50,說明有不同程度的蛋白質(zhì)污染;對照三組的od260/od280值為1.99,說明rna干擾比實驗組較嚴(yán)重,再者,對照三組中使用了苯酚等揮發(fā)性有毒有機溶劑,且用量較大,危害性較大,不適合大量樣本的dna提取。盡管已描述了本發(fā)明的優(yōu)選實施例,但本領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)人員一旦得知了基本創(chuàng)造性概念,則可對這些實施例作出另外的變更和修改。所以,所附權(quán)利要求意欲解釋為包括優(yōu)選實施例以及落入本發(fā)明范圍的所有變更和修改。顯然,本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以對本發(fā)明進行各種改動和變型而不脫離本發(fā)明的精神和范圍。這樣,倘若本發(fā)明的這些修改和變型屬于本發(fā)明權(quán)利要求及其等同技術(shù)的范圍之內(nèi),則本發(fā)明也意圖包含這些改動和變型在內(nèi)。當(dāng)前第1頁12