1.一種用于預(yù)測淋巴瘤患者對癌癥治療的反應(yīng)性的方法，該方法包括：
2.如權(quán)利要求1所述的方法，該方法進(jìn)一步包括向該淋巴瘤患者施用第二癌癥治療。
3.如權(quán)利要求1或2所述的方法，其中步驟(a)包括生成定義這些參考生物樣品中該至少一種基因表達(dá)水平之間關(guān)系的聚類信息，并基于該聚類信息重新排列熱圖展示。
4.如權(quán)利要求1-3中任一項所述的方法，其中步驟(a)采用分層方法或非分層方法。
5.如權(quán)利要求1-3中任一項所述的方法，其中步驟(a)使用iclusterplus方法。
6.如權(quán)利要求1-5中任一項所述的方法，其中這些參考淋巴瘤患者被聚類至2-12個亞組中。
7.如權(quán)利要求6所述的方法，其中這些參考淋巴瘤患者被聚類至7個亞組中。
8.如權(quán)利要求1-7中任一項所述的方法，其中該方法進(jìn)一步包括使用這些參考生物樣品中該至少一種基因的表達(dá)水平訓(xùn)練分類器模型。
9.如權(quán)利要求1-8中任一項所述的方法，其中該至少一種基因選自表1的基因，任選地其中該至少一種基因包含表1的五種或更多種基因。
10.如權(quán)利要求9所述的方法，其中該至少一種基因包含表1的所有基因。
11.如權(quán)利要求8—10中任一項所述的方法，其中該分類器模型是分組多項式廣義線性模型(glm)。
12.如權(quán)利要求8—11中任一項所述的方法，其中該分類器模型是二元模型。
13.如權(quán)利要求8-12中任一項所述的方法，其中該方法進(jìn)一步包括為步驟(a)的至少一個亞組設(shè)置閾值置信水平，以從該至少一個亞組中排除得出較低置信水平聚類數(shù)據(jù)的患者。
14.如權(quán)利要求1-13中任一項所述的方法，其中該淋巴瘤選自由以下組成的組：彌漫性大b細(xì)胞淋巴瘤(dlbcl)、惰性b細(xì)胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、小淋巴細(xì)胞性淋巴瘤、淋巴結(jié)邊緣區(qū)b細(xì)胞淋巴瘤、淋巴漿細(xì)胞性淋巴瘤、間變性大細(xì)胞淋巴瘤、原發(fā)性皮膚型淋巴瘤、蕈樣肉芽腫、慢性淋巴細(xì)胞性白血病和套細(xì)胞淋巴瘤。
15.如權(quán)利要求14所述的方法，其中該淋巴瘤是dlbcl。
16.如權(quán)利要求14所述的方法，其中該淋巴瘤是惰性b細(xì)胞淋巴瘤、淋巴結(jié)邊緣區(qū)b細(xì)胞淋巴瘤、套細(xì)胞淋巴瘤或慢性淋巴細(xì)胞性白血病。
17.根據(jù)權(quán)利要求1—16中任一項所述的方法，其中該參考患者組中的這些參考患者被聚類至亞組a1-a7中，并且其中：
18.如權(quán)利要求1-17中任一項所述的方法，其中該第一癌癥治療是使用利妥昔單抗、環(huán)磷酰胺、多柔比星、長春新堿和強(qiáng)的松(r—chop)的聯(lián)合治療。
19.如權(quán)利要求1-18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a1時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
20.如權(quán)利要求1-18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a2時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
21.如權(quán)利要求1-18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a3時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
22.如權(quán)利要求1-18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a4時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
23.如權(quán)利要求1-18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a5時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
24.如權(quán)利要求1—18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a6時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
25.如權(quán)利要求1-18中任一項所述的方法，其中當(dāng)確定該淋巴瘤患者屬于亞組a7時，該方法包括預(yù)測該患者不太可能對該第一癌癥治療有反應(yīng)。
26.如權(quán)利要求2-25中任一項所述的方法，其中該第二癌癥治療是r-chop。
27.如權(quán)利要求2-25中任一項所述的方法，其中該第二癌癥治療不是r-chop。
28.如權(quán)利要求27所述的方法，其中該第二癌癥治療是溴結(jié)構(gòu)域和超末端(bet)抑制劑或細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(cdk)抑制劑。
29.一種用于預(yù)測淋巴瘤患者對癌癥治療的反應(yīng)性的方法，該方法包括：
30.一種用于預(yù)測淋巴瘤患者對癌癥治療的反應(yīng)性的方法，該方法包括：
31.一種治療淋巴瘤患者的方法，該方法包括：
32.一種治療淋巴瘤患者的方法，該方法包括：
33.如權(quán)利要求30-32中任一項所述的方法，其中該癌癥治療是r-chop。
34.根據(jù)權(quán)利要求32所述的方法，其中該替代癌癥治療是bet抑制劑或cdk抑制劑。
35.如權(quán)利要求28-34中任一項所述的方法，其中該淋巴瘤選自由以下組成的組：dlbcl、惰性b細(xì)胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、小淋巴細(xì)胞性淋巴瘤、淋巴結(jié)邊緣區(qū)b細(xì)胞淋巴瘤、淋巴漿細(xì)胞性淋巴瘤、間變性大細(xì)胞淋巴瘤、原發(fā)性皮膚型淋巴瘤、蕈樣肉芽腫、慢性淋巴細(xì)胞性白血病和套細(xì)胞淋巴瘤。
36.如權(quán)利要求35所述的方法，其中該淋巴瘤是dlbcl。
37.如權(quán)利要求35所述的方法，其中該淋巴瘤是dlbcl、惰性b細(xì)胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、淋巴結(jié)邊緣區(qū)b細(xì)胞淋巴瘤、套細(xì)胞淋巴瘤或慢性淋巴細(xì)胞性白血病。
38.如權(quán)利要求29-37中任一項所述的方法，其中表1的全部基因的表達(dá)水平在(a)中確定并在(b)中進(jìn)行比較。
39.如權(quán)利要求1—38中任一項所述的方法，其中這些生物樣品是腫瘤活檢樣品。
40.如權(quán)利要求1-39中任一項所述的方法，其中確定該至少一種基因的表達(dá)水平包括檢測這些生物樣品中的至少一種復(fù)合物的存在或量，其中該至少一種復(fù)合物的存在或量指示該至少一種基因的表達(dá)水平。
41.根據(jù)權(quán)利要求40所述的方法，其中該至少一種復(fù)合物是雜交復(fù)合物。
42.根據(jù)權(quán)利要求40所述的方法，其中該至少一種復(fù)合物被可檢測地標(biāo)記。
43.如權(quán)利要求1-39中任一項所述的方法，其中確定該至少一種基因的表達(dá)水平包括檢測這些生物樣品中的至少一種反應(yīng)產(chǎn)物的存在或量，其中該至少一種反應(yīng)產(chǎn)物的存在或量指示該至少一種基因的表達(dá)水平。
44.如權(quán)利要求43所述的方法，其中該至少一種反應(yīng)產(chǎn)物被可檢測地標(biāo)記。
45.如權(quán)利要求1-44中任一項所述的方法，其中該參考淋巴瘤患者是難治性dlbcl患者、復(fù)發(fā)性dlbcl患者或新診斷的dlbcl患者。
46.如權(quán)利要求1-45中任一項所述的方法，其中該淋巴瘤患者是難治性dlbcl患者、復(fù)發(fā)性dlbcl患者或新診斷的dlbcl患者。
47.如權(quán)利要求1-46中任一項所述的方法，其中該淋巴瘤患者是gcb?dlbcl患者或abcdlbcl患者。
48.如權(quán)利要求1-47中任一項所述的方法，其中該淋巴瘤患者是dhitsig+dlbcl患者或dhitsig-dlbcl患者。