1.用于確定狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的方法;所述方法包括:
2.用于確定狗的生物學年齡的方法;所述方法包括:
3.用于為狗選擇生活方式方案、膳食方案或治療干預的方法,所述方法包括:
4.用于確定生活方式方案、膳食方案或治療干預對改善狗的死亡風險的功效的方法,所述方法包括:
5.用于確定生活方式方案、膳食方案或治療干預對改善狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的功效的方法,所述方法包括:
6.用于開發(fā)抗衰老生活方式方案、膳食方案或治療干預的方法;所述方法包括;
7.用于預防或降低狗發(fā)展疾病的風險的方法;所述方法包括:
8.用于選擇適合接受抗衰老生活方式方案、膳食方案或治療干預的狗的方法;所述方法包括:
9.根據(jù)任一前述權利要求所述的方法,其中用于確定所述狗的所述死亡風險和/或健康壽命的概率的所述方法還包括將所述dna甲基化圖譜與所述狗的所述實足年齡、品種和/或性別中的一者或多者組合。
10.根據(jù)權利要求3至9中任一項所述的方法,其中基于與所述狗的實足年齡相比所述狗具有增加的死亡風險和/或降低的健康壽命的概率的確定來選擇生活方式方案、膳食方案或治療干預。
11.根據(jù)權利要求3至10中任一項所述的方法,其中所述生活方式方案、膳食方案或治療干預是膳食干預。
12.根據(jù)權利要求11所述的方法,其中所述膳食干預是熱量限制飲食、老年飲食或低蛋白飲食。
13.根據(jù)任一前述權利要求所述的方法,其中所述樣本是血液樣本。
14.根據(jù)權利要求1至3或5至8中任一項所述的方法,其中步驟a)還包括確定來自從所述狗獲得的樣本的dna甲基化圖譜。
15.根據(jù)任一前述權利要求所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜包含至少一個如表3中所列的甲基化位點。
16.根據(jù)權利要求15所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜包含至少3個、至少5個、至少10個、至少20個、至少50個、至少100個、至少150個、至少200個或如表3中所列的甲基化位點中的每個甲基化位點。
17.根據(jù)權利要求15所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜包含如表4中所列的甲基化位點。
18.根據(jù)權利要求15所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜包含如表5中所列的甲基化位點。
19.根據(jù)權利要求15所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜包含如表6中所列的甲基化位點。
20.根據(jù)權利要求15所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜包含如表7中所列的甲基化位點。
21.根據(jù)權利要求14至20中任一項所述的方法,其中使用包括以下步驟中的一者或多者的方法來確定dna甲基化:(a)用apobec處理樣本dna以使胞嘧啶脫氨基;(b)基于捕獲的富集;和/或(c)高通量測序。
22.根據(jù)任一前述權利要求所述的方法,其中所述dna甲基化圖譜與以下項的發(fā)病率或預測的發(fā)病率相關聯(lián):(i)組織;(ii)器官;或(iii)生理系統(tǒng),諸如免疫系統(tǒng)、胃腸系統(tǒng)、泌尿系統(tǒng)、肌肉系統(tǒng)、心血管系統(tǒng)和/或神經(jīng)系統(tǒng)。
23.根據(jù)權利要求22所述的方法,所述方法還包括對所述狗應用適用于改善根據(jù)權利要求22所述的組織;器官;或生理系統(tǒng)的所述發(fā)病率或預測的發(fā)病率的生活方式方案、膳食方案或治療干預。
24.用于降低狗的死亡風險和/或增加狗的健康壽命的概率的膳食干預或治療方式,其中將所述膳食干預施用于狗,其中死亡風險通過根據(jù)權利要求1、7至10或13至23中任一項所述的方法確定。
25.膳食干預治療方式在降低狗的死亡風險和/或增加狗的健康壽命的概率中的用途,其中將所述膳食干預施用于狗,其中死亡風險通過根據(jù)權利要求1、7至20或13至23中任一項所述的方法確定。
26.計算機可讀介質,所述計算機可讀介質包括指令,所述指令在被執(zhí)行時使一個或多個處理器執(zhí)行根據(jù)權利要求1、2、3、7至16或23中任一項所述的方法。
27.用于確定狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的計算機系統(tǒng);所述計算機系統(tǒng)被編程為使用所述狗的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險。
28.用于為狗選擇合適的生活方式方案、膳食方案或治療干預的計算機系統(tǒng),所述計算機系統(tǒng)被編程為執(zhí)行以下步驟中的一者或多者:
29.用于確定生活方式方案、膳食方案或治療干預對改善狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的功效的計算機系統(tǒng),所述計算機系統(tǒng)被編程為執(zhí)行以下步驟中的一者或多者:
30.用于確定狗將受益于抗衰老生活方式方案、膳食方案或治療干預的可能性的計算機系統(tǒng);所述計算機系統(tǒng)被編程為執(zhí)行以下步驟中的一者或多者:
31.計算機程序產(chǎn)品,所述計算機程序產(chǎn)品包括計算機可實施指令,所述計算機可實施指令用于使可編程計算機使用狗的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率。
32.計算機程序產(chǎn)品,所述計算機程序產(chǎn)品包括計算機可實施指令,所述計算機可實施指令用于使可編程計算機使用來自狗的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率;以及基于使用dna甲基化圖譜來確定的所述死亡風險和/或健康壽命的概率來為所述狗選擇合適的生活方式方案、膳食方案或治療干預。
33.計算機程序產(chǎn)品,所述計算機程序產(chǎn)品包括計算機可實施指令,所述計算機可實施指令用于使可編程計算機:a)使用來自在生活方式方案、膳食方案或治療干預之前從狗獲得的樣本以及在所述生活方式方案、膳食方案或治療干預之后從所述狗獲得的樣本的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率;以及b)在已經(jīng)應用所述生活方式方案、膳食方案或治療干預之前和之后確定所述狗的所述死亡風險和/或健康壽命的概率在從所述狗獲得的所述樣本之間是否存在變化。
34.計算機程序產(chǎn)品,所述計算機程序產(chǎn)品包括計算機可實施指令,所述計算機可實施指令用于使可編程計算機:a)使用來自從狗獲得的樣本的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率;以及b)如果與狗的實足年齡相比,所述狗具有增加的死亡風險和/或降低的健康壽命的概率,則將所述狗標識為可能對抗衰老生活方式方案、膳食方案或治療干預有反應。
35.用于創(chuàng)建表觀遺傳時鐘以確定狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的方法;所述方法包括:a)提供來自從所述狗獲得的樣本的dna甲基化圖譜;b)計算兩個gompertz或weibull函數(shù),(i)第一個gompertz或weibull函數(shù),其將存活率建模為所述甲基化圖譜、實足年齡和任選的品種類別和/或性別的函數(shù);和(ii)第二個gompertz或weibull函數(shù),其將存活率建模為實足年齡和任選的僅品種類別和/或性別的函數(shù);其中基于時間變量來確定所述死亡風險和/或健康壽命的概率,在所述時間變量處由所述第二個gompertz或weibull函數(shù)給出的所述狗的存活概率等于由所述第一個gompertz或weibull函數(shù)給出的在它們的實足年齡處的存活概率。
36.根據(jù)權利要求27至35中任一項所述的計算機系統(tǒng)或計算機程序產(chǎn)品;其中所述計算機系統(tǒng)或計算機程序準備并共享詳述步驟(b)的結果的報告。
37.用于確定狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的試劑盒,所述試劑盒包括用于收集和任選地穩(wěn)定來自受試者的樣本的裝置和試劑;以及用于收集和任選地穩(wěn)定所述樣本的說明書,并且其中所述樣本用于郵寄以用于后續(xù)dna提取,用于測量從所述樣本提取的dna中的dna甲基化,從而獲得dna甲基化圖譜。
38.用于使用狗的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的方法;所述方法包括(a)提供來自所述狗的樣本,任選地使用根據(jù)權利要求37所述的試劑盒;(b)提供用于后續(xù)dna提取的所述樣本以用于測量從所述樣本提取的dna中的dna甲基化,從而獲得dna甲基化圖譜;(c)使用根據(jù)權利要求27所述的計算機系統(tǒng)或根據(jù)權利要求31所述的計算機程序產(chǎn)品來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率;其中所述計算機系統(tǒng)準備并共享詳述步驟(c)的結果的報告。
39.用于使用來自狗的dna甲基化圖譜來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率;以及基于使用dna甲基化圖譜來確定的所述死亡風險和/或健康壽命的概率來為所述狗選擇合適的生活方式方案、膳食方案或治療干預的方法;所述方法包括(a)提供來自所述狗的樣本,任選地使用根據(jù)權利要求37所述的試劑盒;(b)提供用于后續(xù)dna提取的所述樣本以用于測量從所述樣本提取的dna中的dna甲基化,從而獲得dna甲基化圖譜;(c)使用根據(jù)權利要求28所述的計算機系統(tǒng)或根據(jù)權利要求32所述的計算機程序產(chǎn)品來確定所述狗的死亡風險和/或健康壽命的概率以及為所述狗選擇合適的生活方式方案、膳食方案或治療干預;其中所述計算機系統(tǒng)準備并共享詳述步驟(c)的結果的報告。
40.用于使用dna甲基化圖譜來確定生活方式方案、膳食方案或治療干預對改善狗的死亡風險和/或健康壽命的概率的功效的方法,所述方法包括:(a)提供在所述生活方式方案、膳食方案或治療干預之前從所述狗獲得的樣本以及在所述生活方式方案、膳食方案或治療干預之后從所述狗獲得的樣本,任選地使用根據(jù)權利要求37所述的試劑盒;(b)提供用于后續(xù)dna提取的所述樣本以用于測量從所述樣本提取的dna中的dna甲基化,從而獲得dna甲基化圖譜;(c)使用根據(jù)權利要求29所述的計算機系統(tǒng)或根據(jù)權利要求33所述的計算機程序產(chǎn)品在已經(jīng)應用所述生活方式方案、膳食方案或治療干預之前和之后確定所述狗的所述死亡風險和/或健康壽命的概率在從所述狗獲得的所述樣本之間是否存在變化;其中所述計算機系統(tǒng)準備并共享詳述步驟(c)的結果的報告。
41.使用dna甲基化圖譜將狗標識為可能對抗衰老生活方式方案、膳食方案或治療干預有反應的方法;所述方法包括:(a)提供從所述狗獲得的樣本;任選地使用根據(jù)權利要求37所述的試劑盒;(b)提供用于后續(xù)dna提取的所述樣本以用于測量從所述樣本提取的dna中的dna甲基化,從而獲得dna甲基化圖譜;(c)使用根據(jù)權利要求30所述的計算機系統(tǒng)或根據(jù)權利要求34所述的計算機程序產(chǎn)品,如果與狗的實足年齡相比,所述狗具有增加的死亡風險和/或降低的健康壽命的概率,則將所述狗標識為可能對抗衰老生活方式或膳食有反應;其中所述計算機系統(tǒng)準備并共享詳述步驟(c)的結果的報告。