本發(fā)明屬于生物制藥,尤其涉及一種(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf及其用于制備芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體的方法。
背景技術(shù):
1、芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性化合物是一種廣泛存在于藥物分子如甲砜霉素、氯霉素、氟苯尼考、屈西多巴、維貝隆,以及一些天然活性產(chǎn)物結(jié)構(gòu)中的基本骨架,其結(jié)構(gòu)式如下1-8所示:
2、
3、本發(fā)明中的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性化合物是合成上述結(jié)構(gòu)類似藥物的關(guān)鍵中間體,目前傳統(tǒng)工業(yè)上主要采用羥醛縮合,硼氫化鈉還原,l-(+)-酒石酸拆分來生產(chǎn)2s,3r構(gòu)型的芳香族α-氨基-β-羥基酯類藥物中間體,整體路線存在如下缺點(diǎn):1)羥醛縮合催化劑硫酸銅的后處理問題;2)酒石酸拆分收率低,理論上最大只有50%(de1938513;us3927054;us5382673)。此外,除了傳統(tǒng)工業(yè)生產(chǎn)方法,目前也報(bào)道了通過動(dòng)態(tài)還原動(dòng)力學(xué)拆分合成這類化合物及其結(jié)構(gòu)類似物的化學(xué)方法,但這些化學(xué)方法常需要使用過渡金屬釕或銠,嚴(yán)重污染環(huán)境而且底物加載量也不高(guodong?sun,zihongzhou,zhonghualuo,etal.organic?letter,2017,19,4339-4342;guodong?sun,weilin?jian,zhonghua?luo,etal.organic?process?research&development,2019,23,1204-1212),因此嚴(yán)重限制了其在工業(yè)生產(chǎn)上的應(yīng)用。
4、采用羰基還原酶動(dòng)態(tài)動(dòng)力學(xué)還原生產(chǎn)芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性化合物往往能克服上述化學(xué)路線的一些不足,且理論收率能達(dá)100%,突破傳統(tǒng)拆分50%的限制。例如在2013年,默克公司就報(bào)道了通過羰基還原酶cdx-018催化還原化合物2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-氧代-3-苯基丙酸甲酯,選擇性地生成得到(2s,3r)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-羥基-3-苯基丙酸甲酯(維貝隆藥物中間體),ee值大于99%,dr值大于99:1,收率為92%(fengxu,john?y.l.chung,jefferyc.moore,etal.organicletter,2013,15,1342-1345);此外,陳少欣團(tuán)隊(duì)報(bào)道了采用(2s,3r)-羰基還原酶kred-02及其突變體m30催化6種不同結(jié)構(gòu)的α-氨基-β-氧代酯類底物來生產(chǎn)α-氨基-β-羥基酯類手性化合物,這些化合物可以合成氯霉素、甲砜霉素和氟苯尼考等藥物,其轉(zhuǎn)化率達(dá)98%,產(chǎn)物手性ee值>99%,手性de值>99%(cn?109207531a;cn112176007a;jiezou,guoweini,jiaweitang,etal.europeanjournaloforganic?chemistry,2018,5044-5053;jiawei?tang,liuqingchen,luwen?zhang,et?al,catalysis?science&technology,2021,11,6755-6769);陳芬兒院士團(tuán)隊(duì)也報(bào)道了采用羰基還原酶kred-bt催化一系列芳香族α-氨基-β-氧代酯類化合物來生產(chǎn)芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性藥物中間體,反應(yīng)收率高,立體選擇性優(yōu)異(cn113249417a;qing-chunzhang,zuo-linlu,chenhu,etal.asianjournaloforganicchemistry,2021,10,1-5)。最近,我們團(tuán)隊(duì)也報(bào)道了利用羰基還原酶easdr6突變體easdr6a138l/s193a催化2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-氧代-3-苯基丙酸甲酯,選擇性地生成產(chǎn)物(2s,3r)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-羥基-3-苯基丙酸甲酯(維貝隆藥物中間體),底物加載量達(dá)到200g/l,底物轉(zhuǎn)化率大于99%,產(chǎn)物ee值大于99%,de值大于99%(xiaojian?zhang,feiyang,kailichen,etal.bioorganic?chemistry,2023,140,106788)。
5、因此通過羰基還原酶動(dòng)態(tài)動(dòng)力學(xué)還原來制備芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性藥物中間體具有底物加載量高,產(chǎn)物收率高,產(chǎn)物立體選擇性高,操作簡單,綠色安全等優(yōu)點(diǎn),非常適合推進(jìn)到工業(yè)化生產(chǎn)。
6、自然界篩選到的野生型的羰基還原酶往往催化活力和選擇性都較差,用量較大,不利于實(shí)際應(yīng)用,利用蛋白質(zhì)工程改造的方法改造野生酶以適應(yīng)工業(yè)生產(chǎn)要求是最佳的選擇。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的是提供一種芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體的制備方法,該方法涉及(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf參與的動(dòng)態(tài)動(dòng)力學(xué)還原反應(yīng),可以一步構(gòu)筑雙手性中心,合成路線簡單環(huán)保,產(chǎn)物收率和立體選擇性高。
2、本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:
3、一種(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf,由seq?id?no.2所示的氨基酸序列經(jīng)下列突變所得:(1)第190位丙氨酸突變?yōu)槔i氨酸;(2)第193位絲氨酸突變?yōu)楸彼幔?3)第201位酪氨酸突變?yōu)楸奖彼帷?/p>
4、由于氨基酸序列的特殊性,任何含有本發(fā)明所示氨基酸序列的肽蛋白的片段或其變體,如其保守性變體、生物活性片段或衍生物,只要該肽蛋白的片段或肽蛋白變體與前述氨基酸序列同源性在90%以上,均屬于本發(fā)明保護(hù)范圍之列。具體的,所述改變包括氨基酸序列中氨基酸的缺失、插入或替換;其中,對于變體的保守性改變,所替換的氨基酸具有與原氨基酸相似的結(jié)構(gòu)或化學(xué)性質(zhì),如用亮氨酸替換異亮氨酸,谷氨酰胺替換天冬酰胺,酶變體也可具有非保守性改變。
5、本發(fā)明還提供所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因。
6、進(jìn)一步地,本發(fā)明中(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。
7、由于核苷酸序列的特殊性,任何本發(fā)明所示多核苷酸的變體,只要其與前述多核苷酸具有90%以上同源性,均屬于本發(fā)明保護(hù)范圍之列。所述多核苷酸的變體是指一種具有一個(gè)或多個(gè)核苷酸改變的多核苷酸序列。此多核苷酸的變體可以是生的變位變異體或非生的變異體,包括取代變異體、缺失變異體和插入變異體。如本領(lǐng)域所知的,等位變異體是一個(gè)多核苷酸的替換形式,它可能是一個(gè)多核苷酸的取代、缺失或插入,但不會(huì)從實(shí)質(zhì)上改變其編碼的肽蛋白的功能。
8、本發(fā)明還涉及含有所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因的重組載體,以及利用所述重組載體構(gòu)建的含有所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的重組基因工程菌。
9、所述重組載體包含適合在宿主細(xì)胞中表達(dá)的控制序列可操作地連接的多核苷酸。
10、優(yōu)選重組載體的表達(dá)載體為pet-28a(+)。
11、重組基因工程菌構(gòu)建方法通常為:將(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因同表達(dá)載體pet-28a(+)連接,構(gòu)建了含有(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因的異源表達(dá)重組質(zhì)粒,將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至宿主菌中,獲得含有重組質(zhì)粒的重組基因工程菌。所述重組基因工程菌的宿主菌通常為大腸桿菌e.coli?bl21(de3)。
12、所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf可按以下方法獲得:
13、構(gòu)建含有所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf編碼基因的重組載體,將所述重組載體轉(zhuǎn)化至宿主菌中,對獲得的重組基因工程菌進(jìn)行誘導(dǎo)培養(yǎng),培養(yǎng)液分離得到含有(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的菌體細(xì)胞,破碎后獲得(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的粗酶液,粗酶液純化即可獲得(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf純酶。
14、本發(fā)明還提供采用(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf在生物催化式x所示的芳香族α-氨基-β-氧代酯類化合物底物,不對稱還原反應(yīng)制得式y(tǒng)所示的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體的應(yīng)用。
15、本發(fā)明還一種提供芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體的制備方法,所述方法為:
16、式x所示的芳香族α-氨基-β-氧代酯類化合物為底物,(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf為催化劑,葡萄糖為輔底物,nadp+為輔酶,葡萄糖脫氫酶gdh6構(gòu)建輔酶循環(huán)的催化劑,進(jìn)行不對稱還原反應(yīng),制得式y(tǒng)所示的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體;
17、所述方法的反應(yīng)式如下式所示:
18、
19、式x或式y(tǒng)中,r1為c6~c10的芳香基或c4~c10的雜環(huán)芳基,所述c6~c10的芳香基或c4~c10的雜環(huán)芳基上的h不被取代或被一個(gè)以上的取代基a取代,
20、所述c6~c10的芳香基優(yōu)選苯基或萘基;
21、所述c4~c10的雜環(huán)芳基優(yōu)選噻吩、呋喃或苯并二氧六環(huán);
22、所述取代基a為甲砜基、硝基、鹵素、甲氧基中的一種或多種;
23、式x或式y(tǒng)中,r2為叔丁氧羰基(boc)或二氯乙?;?/p>
24、在本發(fā)明中,所述的(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf和葡萄糖脫氫酶gdh6可以以各種形式來使用。例如,可使用表達(dá)本發(fā)明所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf和葡萄糖脫氫酶gdh6的靜息細(xì)胞或濕菌體,也可以使用粗酶液、純酶或者粗酶粉等各種不同形式,或者使用固定化酶。
25、優(yōu)選地,為獲得較高的轉(zhuǎn)化效率和降低成本,優(yōu)選使用粗酶液。
26、具體的,優(yōu)選所述方法為:
27、以含所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因的重組基因工程菌經(jīng)發(fā)酵培養(yǎng)獲得的濕菌體或濕菌體超聲破碎后的粗酶液為催化劑,以式x所示的芳香族α-氨基-β-氧代酯類化合物為底物,葡萄糖為輔底物,葡萄糖脫氫酶gdh6的粗酶液為構(gòu)建輔酶循環(huán)的催化劑,dmso為助溶劑,nadp+為輔酶,在ph值為6-8的緩沖溶液中構(gòu)成反應(yīng)體系,制得式y(tǒng)所示的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體。
28、葡萄糖脫氫酶gdh6的氨基酸序列如seq?id?no.3所示。
29、反應(yīng)的溫度優(yōu)選為30~40℃、攪拌速度優(yōu)選600~1000rpm。反應(yīng)時(shí)間優(yōu)選10~15小時(shí)。
30、更進(jìn)一步,緩沖溶液優(yōu)選100mm、ph?7.0的磷酸鉀緩沖溶液,整個(gè)反應(yīng)過程中用6mnaoh溶液控制反應(yīng)ph在7.0左右。
31、所述催化劑可以為酶的形式或者菌體的形式。所述酶的形式包括游離酶、固定化酶,包括純化酶、粗酶、發(fā)酵液、載體固定的酶、細(xì)胞破碎物等:所述菌體的形式包括存活菌體細(xì)胞和/或死亡菌體細(xì)胞。
32、所述催化劑為粗酶液的形式時(shí),所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf粗酶液的濃度以其濕菌體重量計(jì)為15~20g/l緩沖溶液,所述葡萄糖脫氫酶gdh6粗酶液的濃度以其濕菌體重量計(jì)為5~10g/l緩沖溶液,所述底物濃度為10~50g/l,所述輔底物葡萄糖的濃度與底物濃度相同,所述助溶劑dmso的體積用量為反應(yīng)體系體積的10~20%,所述輔酶nadp+的濃度0.5~5g/l,優(yōu)選0.75g/l。
33、所述濕菌體可按如下方法制備:將含有所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的編碼基因的重組基因工程菌或含有葡萄糖脫氫酶gdh6的編碼基因的重組基因工程菌接種至含終濃度50μg/ml卡那霉素抗性的lb液體培養(yǎng)基,37℃,200rpm下培養(yǎng)8h獲得種子液,再以體積濃度2%接種量接種至新鮮的含有終濃度50μg/ml卡那霉素抗性的lb液體培養(yǎng)基中,于37℃,200rpm下培養(yǎng)至菌體od600達(dá)0.6~0.8,加入終濃度為0.1mm的iptg,28℃下誘導(dǎo)培養(yǎng)12h后,4℃、8000rpm離心10min,棄去上清液,分別收集獲得(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的濕菌體和葡萄糖脫氫酶gdh6的濕菌體。
34、本發(fā)明所述(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的純酶可按如下方法進(jìn)行制備:將(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf的濕菌體用生理鹽水清洗,將收集的濕菌體用100mm、ph?7.0的磷酸鉀緩沖液重懸成50g/l的菌體溶液,冰浴條件下進(jìn)行超聲破碎,獲得細(xì)胞破碎液;將細(xì)胞破碎液離心,所得到的上清即為所需的粗酶液;粗酶液可進(jìn)一步用鎳柱純化、透析脫鹽后得到純酶。
35、超聲條件為:45%功率,持續(xù)2s,間歇4s,連續(xù)破碎20min。
36、所述反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液分離純化,制得式y(tǒng)所示的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體;反應(yīng)液分離純化的方法通常為:反應(yīng)液用甲基叔丁基醚萃取,合并有機(jī)層、干燥,過濾,濾液蒸除溶劑,制得式y(tǒng)所示的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體。
37、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明有益效果主要體現(xiàn)在:
38、本發(fā)明構(gòu)建了含(2s,3r)選擇性的羰基還原酶突變體vaf和含葡萄糖脫氫酶gdh6的工程菌應(yīng)用于催化還原式x所示的芳香族α-氨基-β-氧代酯類化合物,為式y(tǒng)所示的芳香族α-氨基-β-羥基酯類手性中間體y的生產(chǎn)提供了一種新的生物制備途徑。相對于其它制備方法,使用本發(fā)明方法具有綠色安全、操作簡便、易于工業(yè)放大等優(yōu)勢,且該突變體具有高催化活性、產(chǎn)物選擇性高、底物普適性廣、高底物濃度耐受等優(yōu)點(diǎn),可以合成多種藥物的關(guān)鍵中間體(如氯霉素、屈西多巴、維貝隆等),具有巨大的工業(yè)應(yīng)用前景。