本技術(shù)涉及中藥分析,特別涉及一種引物對、試劑盒和不同基原的百部中藥原植物、藥材或飲片的鑒別方法。
背景技術(shù):
1、《中國藥典》2020年版規(guī)定百部為百部科植物直立百部stemona?sessilifolia(miq.)miq.、蔓生百部stemona?japonica(bl.)miq.或?qū)θ~百部stemona?tuberosa?lour.的干燥塊根。春、秋二季釆挖,除去須根,洗凈,置沸水中略燙或蒸至無白心,取出,曬干。百部甘、苦,微溫。歸肺經(jīng)。主治潤肺下氣止咳,殺蟲滅虱。用于新久咳嗽,肺癆咳嗽,頓咳;外用于頭虱,體虱,蟯蟲病,陰癢。
2、據(jù)《中國藥典》2020年版收載,百部屬于多基原中藥,不同品種、產(chǎn)地,其主要化學(xué)成分的種類和含量有一定的差異。此外,不同基原間外觀性狀相似,尤其加工成飲片后,單從外部形態(tài)學(xué)上難以區(qū)別,在銷售過程中,極易造成基原混用,因此,準(zhǔn)確鑒別不同基原的百部十分必要。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、基于此,本技術(shù)第一方面提供一種引物對,其技術(shù)方案如下:
2、一種引物對,包括序列如seq?id?no:1所示的上游引物和序列如seq?id?no:2所示下游引物。
3、本技術(shù)第二方面提供一種試劑盒,其技術(shù)方案如下:
4、一種試劑盒,包括如上所述的引物對。
5、可選地,所述試劑盒還包括擴(kuò)增試劑,所述擴(kuò)增試劑包括pcr擴(kuò)增緩沖液、脫氧核苷三磷酸(dntps)和dna聚合酶中的一種或多種。
6、可選地,所述pcr擴(kuò)增緩沖液選自10×buffer。
7、可選地,dna聚合酶選自ex?taq。
8、可選地,所述pcr擴(kuò)增緩沖液、脫氧核苷三磷酸(dntps)和dna聚合酶的體積比為(2~3):(1.5~2.5):0.2。例如,所述pcr擴(kuò)增緩沖液、脫氧核苷三磷酸(dntps)和dna聚合酶的體積比為2:1.5:0.2、2.5:2:0.2、3:2.5:0.2。
9、本技術(shù)第三方面提供一種不同基原的百部中藥原植物、藥材或飲片的鑒別方法,其技術(shù)方案如下:
10、一種不同基原的百部中藥原植物、藥材或飲片的鑒別方法,包括以下步驟:
11、以待測樣品的基因組dna為模板,采用權(quán)利要求1所述的引物對或權(quán)利要求2或3所述的試劑盒進(jìn)行pcr擴(kuò)增,對所得擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測,并根據(jù)所得檢測結(jié)果鑒別百部中藥原植物、藥材或飲片的基原。
12、當(dāng)待測樣品為百部中藥原植物,根據(jù)上述方法可鑒別百部中藥原植物的基原。當(dāng)待測樣品為百部藥材,根據(jù)上述方法可鑒別百部藥材的基原。當(dāng)待測樣品為百部飲片,根據(jù)上述方法可鑒別百部飲片的基原。
13、其中,可鑒別的百部中藥原植物的基原包括對葉百部、直立百部和蔓生百部??设b別的百部藥材的基原包括對葉百部、直立百部和蔓生百部??设b別的百部飲片的基原包括對葉百部、直立百部和蔓生百部。
14、可選地,檢測的方法包括熒光毛細(xì)管str分型法。短串聯(lián)重復(fù)序列(short?tandemrepeats,str)分型技術(shù)是一種利用pcr擴(kuò)增長度差異進(jìn)行分型,比較鑒別個(gè)體生物的dna分析技術(shù),該技術(shù)是目前應(yīng)用比較廣泛的遺傳標(biāo)記,包括法醫(yī)鑒定、基因定位、分子分型、遺傳制圖等等。本技術(shù)建立一種基于str分型的百部dna指紋圖譜鑒別方法。
15、可選地,根據(jù)所得檢測結(jié)果鑒別百部中藥原植物、藥材或飲片的基原,包括以下步驟:
16、若片段str分型遷移峰為371bp~373bp,則待測樣品的基原為對葉百部;
17、若片段str分型遷移峰為374bp~376bp,則待測樣品的基原為直立百部;
18、若片段str分型遷移峰為398bp~400bp,則待測樣品的基原為蔓生百部。
19、其中,若片段str分型遷移峰為371bp、372bp、373bp,則待測樣品的基原為對葉百部;若片段str分型遷移峰為374bp、375bp、376bp,則待測樣品的基原為直立百部;若片段str分型遷移峰為398bp、399bp、400bp,則待測樣品的基原為蔓生百部。
20、可選地,混合所述上游引物、下游引物、擴(kuò)增試劑和待測樣品的基因組dna,得到pcr擴(kuò)增的初始反應(yīng)體系;
21、按照擴(kuò)增程序進(jìn)行擴(kuò)增。
22、可選地,pcr擴(kuò)增的擴(kuò)增程序包括:于93℃~97℃下預(yù)變性3min~7min,再循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)31~37次,再于70℃~74℃下延伸3min~7min;
23、所述循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)的程序包括:于93℃~97℃下變性25s~35s,再于50℃~58℃下退火25s~35s,再于70℃~74℃下延伸25s~35s。
24、其中,于93℃~97℃下預(yù)變性3min~7min。例如,于93℃、94℃、95℃、96℃、97℃下預(yù)變性3min、4min、5min、6min、7min。
25、循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)31~37次。例如,循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)31次、32次、33次、34次、35次、36次、37次。
26、所述循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)的程序包括:于93℃~97℃下變性25s~35s,再于50℃~58℃下退火25s~35s,再于70℃~74℃下延伸25s~35s。例如,所述循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)的程序包括:于93℃、94℃、95℃、96℃、97℃下變性25s、27s、29s、31s、33s、35s,再于50℃、52℃、54℃、56℃、58℃下退火25s、27s、29s、31s、33s、35s,再于70℃、71℃、72℃、73℃、74℃下延伸25s、27s、29s、31s、33s、35s。
27、循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)后,于70℃~74℃下延伸3min~7min。例如,循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng)后,于70℃、71℃、72℃、73℃、74℃下延伸3min、4min、5min、6min、7min。
28、可選地,所述pcr擴(kuò)增的初始反應(yīng)體系中,所述上游引物的濃度為0.01μmol/l~0.2μmol/l。例如,所述上游引物的濃度為0.01μmol/l、0.05μmol/l、0.1μmol/l、0.2μmol/l。
29、可選地,所述pcr擴(kuò)增的初始反應(yīng)體系中,所述下游引物的濃度為0.01μmol/l~0.2μmol/l。例如,所述下游引物的濃度為0.01μmol/l、0.05μmol/l、0.1μmol/l、0.2μmol/l。
30、可選地,所述擴(kuò)增試劑包括pcr擴(kuò)增緩沖液、脫氧核苷三磷酸和dna聚合酶中的一種或多種。
31、可選地,所述pcr擴(kuò)增緩沖液選自10×buffer。
32、可選地,dna聚合酶選自ex?taq。
33、可選地,所述pcr擴(kuò)增緩沖液、脫氧核苷三磷酸(dntps)和dna聚合酶的體積比為(2~3):(1.5~2.5):0.2。例如,所述pcr擴(kuò)增緩沖液、脫氧核苷三磷酸(dntps)和dna聚合酶的體積比為2:1.5:0.2、2.5:2:0.2、3:2.5:0.2。
34、可選地,所述pcr擴(kuò)增的初始反應(yīng)體系中,所述擴(kuò)增試劑的體積占比為0.05%~0.5%。例如,所述擴(kuò)增試劑的體積占比為0.05%、0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5%。
35、可選地,所述pcr擴(kuò)增的初始反應(yīng)體系中,所述待測樣品的基因組dna的濃度不超過200ng/μl。可選地,所述待測樣品的基因組dna的濃度為10ng/μl~200ng/μl。
36、與傳統(tǒng)方案相比,本技術(shù)具有以下有益效果:
37、本技術(shù)設(shè)計(jì)了能夠快速區(qū)分不同基原(對葉百部、直立百部、蔓生百部)百部的特異性引物對,適用于百部不同基原的混偽鑒定,有利于保障中藥用藥安全與臨床療效。