Scml4基因序列及表達(dá)改變檢測(cè)及其在冠心病預(yù)測(cè)中的應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，特別涉及與冠心病易感性相關(guān)的SCML4基因上的單核 苷酸多態(tài)性（singlenucleotidepolymorphism,SNP)位點(diǎn)，以及用于檢測(cè)所述SNP位點(diǎn)的 相應(yīng)的組合物及試劑盒，尤其涉及所述SNP位點(diǎn)的核酸親和配體在制備用于檢測(cè)、篩查或 預(yù)測(cè)漢族人群冠心病易感性的組合物中的應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 冠心病，又稱冠狀動(dòng)脈性心臟病，是由冠狀動(dòng)脈血管壁粥樣硬化引起的以冠狀動(dòng) 脈狹窄甚至閉塞為形態(tài)學(xué)改變的缺血性心臟病。冠心病危害極大，根據(jù)世界衛(wèi)生組織的數(shù) 據(jù)，在世界范圍內(nèi)，以冠心病為主的缺血性心臟病是威脅人類健康的頭號(hào)殺手。數(shù)據(jù)顯示： 在2008年，全球大約有多于730萬人死于冠心病（WH0, 2011)。雖然從死亡率上看中國(guó)目前 并不是冠心病的重災(zāi)區(qū)，但是，由于人口基礎(chǔ)大，我國(guó)的冠心病受累人數(shù)是十分驚人的。估 計(jì)中國(guó)每年超過100萬人死于冠心病。另外，隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)水平的發(fā)展和人民生活水平的 提高，發(fā)明人國(guó)家的冠心病發(fā)病率還在逐年升高。
[0003] 臨床和流行病學(xué)研究證明，冠心病是常見的復(fù)雜多基因疾病，引起疾病的原因包 括遺傳因素、環(huán)境因素以及兩者的交互作用。冠心病有家族聚集性，研究表明，冠心病的遺 傳度約為40%到60%。因此，冠心病易感基因和易感位點(diǎn)的鑒定將為發(fā)現(xiàn)新的冠心病分子 機(jī)制、發(fā)展新的藥物靶點(diǎn)以及冠心病的早期基因診斷和個(gè)性化治療提供新線索。遺傳學(xué)上， 尋找多基因疾病的易感基因多利用關(guān)聯(lián)分析。遺傳關(guān)聯(lián)分析分為兩個(gè)策略：候選基因關(guān)聯(lián) 分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析（genomewideassociationstudy,GWAS)。得益于人類基因組 計(jì)劃和HapMap計(jì)劃對(duì)人類遺傳圖譜的揭示，從全基因組水平尋找與疾病相關(guān)的變異成為 可能。在過去的六年里，全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)展成為研究復(fù)雜多基因疾病遺傳基礎(chǔ)的重要 方法之一，已有超過50個(gè)冠心病相關(guān)位點(diǎn)通過該方法被發(fā)現(xiàn)，其中絕大部分位點(diǎn)是在白種 人的研究中發(fā)現(xiàn)。然而，由于遺傳的異質(zhì)性，這些結(jié)果并不能為黃種人，尤其是發(fā)明人中國(guó) 漢族人群所用。另一方面，已發(fā)現(xiàn)的位點(diǎn)中僅有6個(gè)是基于中國(guó)漢族人群的研究所發(fā)現(xiàn)，這 遠(yuǎn)不足以解釋中國(guó)漢族人群的冠心病遺傳基礎(chǔ)。此外，已有的研究多僅關(guān)注了相關(guān)位點(diǎn)，而 對(duì)于鑒定相關(guān)位點(diǎn)所指代的易感基因缺乏有效的方法。
[0004] 鑒于已知用來解釋中國(guó)漢族人群的冠心病遺傳基礎(chǔ)的基因及位點(diǎn)的數(shù)量較少，為 了提高漢族人群冠心病易感性檢測(cè)、篩查或預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確度，從而更容易、更直接、更靈敏且 更特異性地檢測(cè)、篩查或預(yù)測(cè)漢族人群冠心病易感性，有必要尋找新的與冠心病易感性相 關(guān)的易感基因和SNP位點(diǎn)。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005] 本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了一種新的能夠解釋中國(guó)漢族人群的冠心病遺傳基礎(chǔ)的與冠心病易 感性相關(guān)的SCML4基因，同時(shí)確證了SCML4基因上與冠心病易感性密切相關(guān)的SNP位點(diǎn) rs9486729以及與rs9486729連鎖的SNP位點(diǎn)。本發(fā)明具體技術(shù)方案如下：
[0006] 第一方面，本發(fā)明提供了分離的核酸分子，其代表SCML4基因上的單核苷酸多態(tài) 性（SNP)位點(diǎn)rs9486729,DNA序列如SEQIDNO: 1所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A。
[0007] 第二方面，本發(fā)明提供了分離的核酸分子，其代表SCML4基因上與SNP位點(diǎn) rs9486729連鎖的SNP位點(diǎn)，所述連鎖的SNP位點(diǎn)選自以下任一項(xiàng)：
[0008] (l)rs4945789,其DNA序列如SEQID勵(lì):2所示，其中單核苷酸11為(：的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0009] (2)rs872548,其DNA序列如SEQIDN0:3所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0010] (3)rs9320237,其DNA序列如SEQID勵(lì):4所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0011] (4)rs7773622,其DNA序列如SEQID勵(lì):5所示，其中單核苷酸11為1'的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因C;
[0012] (5)rs6568503,其DNA序列如SEQIDNO:6所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0013] (6)rsl878780,其DNA序列如SEQID勵(lì):7所示，其中單核苷酸11為六的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0014] (7)rsl2194084,其DNA序列如SEQIDN0:8所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因C;
[0015] (8)rs6568505,其DNA序列如SEQIDN0:9所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者患 誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0016] (9)rsl2214724,其DNA序列如SEQIDN0:10所示，其中單核苷酸n為C的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0017] (10)rsl2214852,其DNA序列如SEQIDN0:11所示，其中單核苷酸n為A的攜帶 者患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因C;
[0018] (ll)rsl0457173,其DNA序列如SEQIDN0:12所示，其中單核苷酸n為T的攜帶 者患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0019] (12)^6568508，其0嫩序列如5￡〇10勵(lì)：13所示，其中單核苷酸11為(：的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因T;
[0020] (13)rs7771956,其DNA序列如SEQID勵(lì):14所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因C;
[0021] (14)rs9400150,其DNA序列如SEQIDN0:15所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因T;
[0022] (15)rs4946871，其DNA序列如SEQIDN0:16所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0023] (16)rs4946872,其DNA序列如SEQIDNO: 17所示，其中單核苷酸n為A的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0024] (17)rsl2211874,其DNA序列如SEQIDN0:18所示，其中單核苷酸n為G的攜帶 者患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0025] (18)rs9400152,其DNA序列如SEQID勵(lì)：19所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0026] (19)rs9480807,其DNA序列如SEQIDN0:20所示，其中單核苷酸n為T的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0027] (20)rs6915611，其DNA序列如SEQIDN0:21所示，其中單核苷酸n為G的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因C;
[0028] (21)rs7767848,其DNA序列如SEQID勵(lì):22所示，其中單核苷酸11為六的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0029] (22)rsl0782157,其DNA序列如SEQIDN0:23所示，其中單核苷酸n為G的攜帶 者患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0030] (23)rs9384663,其DNA序列如SEQID勵(lì):24所示，其中單核苷酸11為1'的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因G;
[0031] (24)rsl7530298,其DNA序列如SEQIDN0:25所示，其中單核苷酸n為C的攜帶 者患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因T;
[0032] (25)rs9386677,其DNA序列如SEQID勵(lì):26所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0033] (26)rs9398150,其DNA序列如SEQID勵(lì):27所示，其中單核苷酸11為6的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0034] (27)rsl7596103,其DNA序列如SEQIDN0:28所示，其中單核苷酸n為G的攜帶 者患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因A;
[0035] (28)rs6931026,其DNA序列如SEQID勵(lì):29所示，其中單核苷酸11為1'的攜帶者 患誕心病的風(fēng)險(xiǎn)商于等位基因C。
[0036] 序列SEQIDNO: 1-29構(gòu)成新的與冠心病易感性相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性（SNP)。它 們?cè)试S靈敏、特異性、有效和簡(jiǎn)單的對(duì)冠心病易感性的檢測(cè)、篩查或預(yù)測(cè)方法，例如通過采 用廣為流傳且易于使用的技術(shù)如PCR或核酸雜交，其具有高適用性和利用率，特別是在世 界的欠發(fā)達(dá)地區(qū)。由于上述SNP是在中國(guó)漢族人群中鑒定的，因此認(rèn)為新的SNP可特別適 用于中國(guó)漢族人群冠心病易感性檢測(cè)、篩查或預(yù)測(cè)。<