中，寡核苷酸包含一個或多個核 糖核苷（RNA)和/或脫氧核糖核苷（DNA)。
[0077] 術(shù)語"寡核苷"是指由不具有磷原子的核苷間連接所連接的一系列核苷。這種類 型的核苷間連接包括短鏈烷基、環(huán)烷基、混合雜原子烷基、混合雜原子環(huán)烷基、一個或多個 短鏈雜原子和一個或多個短鏈雜環(huán)。這些核苷間連接包括但不限于，硅氧烷、硫化物、亞砜、 砜、乙酰基、甲?；╢ormacetyl)、硫代甲?；╰hioformacetyl)、亞甲基甲?；?、疏基甲 ?；╰hioformacety1)、烯基、氨基磺酸酯，亞甲基亞胺，亞甲基肼基、磺酸酯、磺酰胺、酰胺 和其它具有混合的N、0、S和012的部分。
[0078] 如本文所用，術(shù)語"寡聚化合物"指的是連接的單體亞單元的連續(xù)序列。每個連接 的單體亞單元通常包括雜環(huán)堿基部分，但單體亞單元還包括沒有雜環(huán)堿基部分的那些，例 如無堿基單體亞單元。寡聚化合物中（如果不是基本上所有的）至少一些和通常大多數(shù)的 雜環(huán)堿基能夠與核酸分子雜交，通常是預定的RNA靶。因此，術(shù)語"寡聚化合物"包括寡核 苷酸、寡核苷酸類似物和寡核苷。它也包括具有一個或多個核苷模擬物或具有糖替代基團 的核苷的聚合物。
[0079] 在某些實施方案中，寡聚化合物包括多個單體亞單元，其獨立地選自天然存在的 核苷、非天然存在的核苷、修飾的核苷、核苷模擬物和具有糖替代基團的核苷。在某些實施 方案中，寡聚化合物是單鏈的。在某些實施方案中，寡聚化合物是雙鏈的，包含雙鏈的雙鏈 體。在某些實施方案中，寡聚化合物包含一個或多個共輒基團和/或端基。
[0080] 如本文所用的術(shù)語"核苷間連接"或"核苷間連接基團"是指包括本領域已知的所 有方式的核苷間連接基團，包括但不限于，含磷的核苷間連接基團如磷酸二酯和硫代磷酸 酯，和含非磷核苷間連接基團如甲?；蛠喖谆鶃啺坊?。核苷間連接也包括中性非離子核 苷間連接，例如酰胺-3- (3' -CH2-C( = 0)-N(H) -5'）、酰胺-4- (3' -CH2-N(H)-C( = 0) -5'）和 甲基膦酸酯，其中磷原子并不總是存在。
[0081] 在某些實施方案中，本文提供的寡聚化合物可制備為具有一個或多個核苷間連 接，其含有修飾的例如非天然存在的核苷間連接。核苷間連接的兩個主要類型通過存在 或不存在磷原子來定義。具有磷原子的修飾的核苷間連接包括但不限于，硫代磷酸酯、手 性硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、氨基烷基磷酸三酯、甲基和其它烷基膦酸酯包括 3' -亞烷基膦酸酯、5' -亞烷基膦酸酯和手性膦酸酯、亞膦酸酯、亞磷酰胺包括3' -氨基亞磷 酰胺和氨基烷基亞磷酰胺、硫代亞磷酰胺、硫代烷基膦酸酯、硫代烷基磷酸三酯、硒代磷酸 酯和硼烷磷酸酯，其具有這些的正常3'-5'連接鍵、2'-5'連接類似物和具有相反極性的那 些，其中一個或多個核苷間連接是3'-3'、5'-5'或2'-2'連接。具有相反極性的寡核苷酸 可在3' -大多數(shù)核苷酸間連接處包含單個3' -3'連接，即可以是無堿基（核堿基丟失或具 有羥基代替它）的單個反向核苷殘基。各種鹽、混合鹽和游離酸形式也包括在內(nèi)。
[0082] 在某些實施方案中，本文提供的寡聚化合物可制備為具有一個或多個含非磷的核 苷間連接。這種寡聚化合物包括但不限于，由短鏈烷基或環(huán)烷基核苷間連接，混合雜原子和 烷基或環(huán)烷基核苷間連接，或一個或多個短鏈雜原子或雜環(huán)核苷間連接形成的那些。這些 包括具有硅氧烷骨架；硫化物、亞砜和砜骨架；甲酰基和硫代甲?；羌?；亞甲基甲?；?巰基甲?；羌埽缓颂且阴；羌?；含烯烴骨架；氨基磺酸酯骨架；亞甲基亞胺基和亞甲基 肼基骨架；磺酸酯和磺酰胺骨架；酰胺骨架；和具有混合的N、0、S和CH2部分的其他基團的 那些。
[0083] 教導上述寡核苷的制備的典型的美國專利包括但不限于，U.S. :5,034,506; 5, 166, 315 ；5, 185, 444 ；5, 214, 134 ；5, 216, 141 ；5, 235, 033 ；5, 264, 562 ；5, 264, 564 ； 5, 405, 938 ；5, 434, 257 ；5, 466, 677 ；5, 470, 967 ；5, 489, 677 ；5, 541, 307 ；5, 561, 225 ； 5, 596, 086 ；5, 602, 240 ；5, 608, 046 ；5, 610, 289 ；5, 618, 704 ；5, 623, 070 ；5, 663, 312 ； 5, 633, 360 ;5, 677, 437 ;5, 677, 439 ;5, 646, 269 和 5, 792, 608,這些也被本申請共同擁有，這 些的每一個都通過引用并入本文中。
[0084] 在某些實施方案中，本文提供的寡聚化合物可通過一個或多個共輒基團的共價連 接來修飾。一般情況下，共輒基團會修改與其連接的寡聚化合物的一種或多種性質(zhì)。這類 寡核苷酸的性質(zhì)包括但不限于，藥效學、藥代動力學、結(jié)合、吸收、細胞分布、細胞攝取、電荷 以及清除。共輒基團通常用于化學領域中，并直接或通過任選的連接部分或連接基團與母 體化合物如寡聚化合物連接。共輒基團的優(yōu)選列舉包括但不限于，嵌入劑、報道分子、多胺、 聚酰胺、聚乙二醇、硫醚、聚醚、膽固醇、巰基膽固醇、膽酸基團、葉酸、脂類、磷脂、生物素、吩 嗪、菲啶、蒽醌、金剛烷、叮啶、熒光素、羅丹明、香豆素和染料。
[0085] 在某些實施方案中，本文提供的寡聚化合物可通過一個或多個端基共價連接至5' 或3'-端基來修飾。端基也可以連接在寡聚化合物的末端之一的任何其它位置。本文所用 的術(shù)語"5'_端基"、"3'端基"、"端基"和其組合是指包括本領域已知的有用基團，其可被放 置在一個或兩個末端，包括但不限于寡聚化合物的5'和3'端，分別用于各種目的例如能夠 對寡聚化合物進行追蹤（熒光標記或其它報告基團），改善寡聚化合物的藥代動力學或藥 效學（例如：吸收和/或遞送）或增強寡聚化合物的一種或多種其它期望的性質(zhì)的寡聚化 合物（用于提高核酸酶穩(wěn)定性或結(jié)合親和力的組）。在某些實施方案中，5'和3'-端基包 括但不限于，修飾的或未修飾的核苷；獨立地修飾的或未修飾的兩個或更多個連接的核苷； 共輒基團；封端基團；磷酸酯部分和保護基。
[0086] 本文所用的術(shù)語"磷酸酯部分"是指包括磷酸酯以及修飾的磷酸酯的末端磷酸酯 基團。磷酸酯部分可以位于任一末端，但優(yōu)選位于5'端的核苷。在一個方面中，末端磷酸 酯是未修飾的且具有式-OP ( = 〇) (OH) 0H。在另一個方面，末端磷酸酯被修飾，使得一個或 多個0和OH基被替換為H、0、S、N(R)或烷基，其中R為H、氨基保護基或未取代或取代的烷 基。在某些實施方案中，5'和或3'端基可包含1至3個磷酸酯部分，其各個獨立地未修飾 (二或三磷酸酯）或修飾。
[0087] 本文所用的術(shù)語"磷部分"是指具有下式的組：
[0088]
[0089] Rx和Ry各自獨立地是羥基、被保護的羥基、巰基、被保護的巰基、C1-C 6烷基、取代 的C1-C6烷基、C i-Ce烷氧基、取代的C i-Ce烷氧基、被保護的氨基或取代的氨基；以及
[0090] Rz是 0 或 S。
[0091] 作為單體如亞磷酰胺或H-膦酸酯，優(yōu)選被保護的磷基部分在寡聚物合成期間保 持穩(wěn)定性。引入寡聚化合物后，磷部分可以包括脫保護基團。
[0092] 本文中包括的磷部分可以連接至單體，其可用于制備寡聚化合物，其中單體可以 使用〇、S、NR dS CR 6Rf連接，其中R d包括但不限于H、C「C6烷基、取代的C「C6烷基、C「(： 6烷 氧基、取代的C1-C6烷氧基、C 2_C6烯基、取代的C 2_C6烯基、C 2_C6炔基、取代的C 2_(：6炔基或取 代的酰基，且艮和R f各自獨立地包括但不限于H、鹵素、C ^C6烷基、取代的C ^C6烷基、C ^C6 烷氧基或取代的C1-C6烷氧基。此類連接的磷部分包括但不限于：磷酸酯，修飾的磷酸酯，硫 代磷酸酯，修飾的硫代磷酸酯，膦酸酯，修飾的膦酸酯，氨基磷酸酯和修飾的氨基磷酸酯。
[0093] 與天然寡核苷酸相比，化學修飾的寡聚化合物結(jié)合互補核酸鏈的相對能力是通過 獲得所述化學修飾的寡聚化合物與其互補未修飾的靶核酸的雜交絡合物的熔融溫度來測 量的。熔融溫度（T ni)是雙螺旋的特征物理性質(zhì)，表示其中存在50%螺旋相對于盤繞（未雜 交）形式的以攝氏度計的溫度。U通常也稱為結(jié)合親和力）是通過使用UV光譜測定以確 定雜交的形成和分解（熔融）。發(fā)生在雜交過程中的堿基堆積伴隨UV吸收的降低（減色 性）。因此UV吸收的降低表示更高的L。
[0094]本領域已知反義化合物：RNA靶雙鏈體的相對雙鏈體穩(wěn)定性可通過將化學修飾的 核苷引入反義化合物來調(diào)節(jié)。糖修飾的核苷已經(jīng)提供了用其靶RNA調(diào)節(jié)反義化合物的Tni的 最有效手段。增加C3'-endo(Northern，RNA樣糖皺裙（pucker))構(gòu)型中糖的數(shù)量或?qū)⑻擎i 定其中的糖修飾的核苷已主要提供反義化合物對于互補RNA靶的每一修飾Tni的增加。增 加C2'-endo(Southern，RNA樣糖皺裙）構(gòu)型中糖的數(shù)量或?qū)⑻擎i定其中的糖修飾的核苷 已主要提供反義化合物對于互補RNA靶每一修飾Tni的增加。給定糖修飾的核苷的糖皺褶 不是指示核苷增加或降低反義化合物的Tni對于互補RNA靶的能力的唯一因素。例如，糖修 飾的核苷三環(huán)DNA主要在C2' -endo構(gòu)型中，然而，它賦予了對于互補RNA每一修飾Tm增加 I. 9_3°C。不采用C3' -endo構(gòu)象的糖修飾的高親和力核苷的另一實例是a-L-LNA。
[0095]如本文所用，"Tni"(熔融溫度）是雙鏈體核酸的兩條鏈分離的溫度。Tni常用作反義 化合物對于互補RNA分子的雙鏈體穩(wěn)定性的測量。
[0096]如本文所用，有關(guān)核堿基的"互補"是指能夠與另一核堿基進行堿基配對的核堿 基。例如，在DNA中，腺嘌呤（A)與胸腺嘧啶（T)互補。例如，在RNA中，腺嘌呤（A)尿嘧啶 (U)互補。在某些實施方案中，互補的核堿基是指能夠與其靶核酸的核堿基進行堿基配對的 反義化合物的核堿基。例如，如果反義化合物的某一位置的核堿基能夠與靶核酸的某一位 置的核堿基氫鍵合，那么在寡核苷酸與靶核酸之間的氫鍵合的位置被認為是那個堿基對的 互補。包含某些修飾的核堿基或者更廣泛地說雜環(huán)堿基部分可以維持與對應核堿基配對的 能力，并仍然能夠互補。
[0097]如本文所用，有關(guān)核堿基的"非互補"是指相互不形成氫鍵或以其他方式支持雜交 的一對核堿基。
[0098]如本文所用，有關(guān)連接的核苷、寡核苷酸、寡聚化合物或核酸的"互補"是指寡聚化 合物與另一種寡聚化合物或核酸通過核堿基或更廣泛的雜環(huán)堿基雜交，即互補性的能力。 在某些實施方案中，反義化合物和其靶彼此互補，當每個分子中足夠數(shù)量的相應位置被可 相互鍵合的核堿基所占據(jù)，以允許反義化合物和靶之間穩(wěn)定的結(jié)合。本領域技術(shù)人員認識 到不消除寡聚化合物保持結(jié)合的能力，包含錯配是可能的。因此，本文描述的反義化合物可 包括錯配（即與靶的相