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      一種去除a47l降低痘苗病毒免疫優(yōu)勢的方法及病毒的制作方法_2

      文檔序號:9447715閱讀:來源:國知局
      . 5倍體積的無水乙醇,移液器混勻。
      [0050] (4)轉(zhuǎn)移裂解液至吸附柱中,1300化pm離屯、1分鐘,將過濾柱轉(zhuǎn)移至一個新的收集 管中。
      [0051] (5)向過濾柱中加入650y1Washbuffer, 13000巧m離屯、1分鐘,棄廢液。
      [00閲 (6)重復(fù)洗一次,棄廢液。
      [005引 (7)將過濾柱放入收集管中1300化pm離屯、2分鐘W去除殘留的乙醇。
      [0054] (8)過濾柱放入新的收集管中,向過濾柱中加入30-50y1DEPC水,室溫靜置3分 鐘。
      [00巧](9) 13000巧m離屯、1分鐘,洗脫DNA。
      [0056] (10)野生型痘苗病毒基因組DNA和VACV-0VA基因組DNA放置于-20°C備用。
      [0057] 1.2引物設(shè)計與合成
      [0058] 根據(jù)野生型痘苗病毒W(wǎng)R株的基因組DNA序列設(shè)計并合成如下兩對引物:
      [0059] 擴增A4化上游同源臂的引物對:
      [0060]A47化-F1 :5'-CCCAAGCTTTGATTCCATAGGCAGTCCAG-3,(下劃線之前部分為保護 堿基,下劃線部分為Hindlll酶切位點識別序列,其后序列為GenBank:AY243312. 1的第 152935-152954位,即序列1的第1-20位)
      [0061]A47化-R1 :5' -AACTGCAGATAAGGTGATTGGAATGGG-3'(下劃線之前部分為保護 堿基,下劃線部分為PstI酶切位點識別序列,其后序列為GenBank:AY243312. 1的第 153921-153939位的反向互補序列,即序列1的第987-1005位的反向互補序列);
      [0062] 擴增A4化下游同源臂的引物對:
      [0063] A4化R-F1 :5' -TCCCCCCGGGGATGGACAGTCTATTTTCCTTAG-3'(下劃線之前部分為 保護堿基,下劃線部分為Xmal酶切位點識別序列,其后序列為GenBank:AY243312. 1的第 154628-154650位,即序列2的第1-23位)
      [0064]A4化R-R1 :5' -TATGGCGCCTATTGATGCGAGTTCGGTATG-3'(下劃線之前部分為保 護堿基,下劃線部分為KasI酶切位點識別序列,其后序列為GenBank:AY243312. 1的第 155497-155517位的反向互補序列,即序列2的第870-890位的反向互補序列)。
      [0065] 根據(jù)OVA基因序列設(shè)計并合成引物:
      [0066] 0VA-F1 :5' -CATGCCATGGATGGGCTCCATCGGCGCAG-3' (下劃線之前部分為保護堿基, 下劃線部分為化〇1酶切位點識別序列,其后為序列3的第1-19位)
      [0067] 0VA-F2 :5'-TCCCCCCGGGTTAAGGGGAAACACATCTGC-3'(下劃線之前部分為保護堿 基,下劃線部分為Xmal酶切位點識別序列,其后為序列3的第1161-1180位的反向互補序 列)。
      [0068] 1. 3穿梭質(zhì)粒pSCllA47k0VA的構(gòu)建及鑒定
      [0069] (1)W步驟1. 1中野生型痘苗病毒基因組DNA為模板,W步驟1. 2中合成的A4化 上下游同源臂引物對分別進行PCR,獲得帶有相應(yīng)酶切位點的A4化的上下游同源臂A4化L 和A4化R,W步驟1中VACV-0VA基因組DNA為模板,W步驟2中合成的OVA引物對進行PCR, 獲得帶有相應(yīng)酶切位點的OVA基因片段。
      [0070]PCR擴增體系如下:DNAlyl,dNTPmix(2. 5mM)5yl,正向引物F(10yM)lyl,反 向引物R(10yM) 1y1,10Xhqbuffer5y1,Taq酶 1y1,加DEPC水至總體積 50y1。[007。 PCR擴增條件如下:95°C預(yù)變性5min;95°C變性30s,55°C退火30s,72°C延伸80s, 循環(huán)30次;72°C延伸5min,最后置于4°C。
      [0072] PCR擴增結(jié)果:PCR產(chǎn)物上樣電泳,A47化為 1022bp,A47LR為 909bp,OVA為 1200bp, 切膠回收目的條帶。
      [007引 似首先用限制性內(nèi)切酶化ndlll和PstI對上游同源臂A47化進行雙酶化與經(jīng) 同樣雙酶切的pSCll質(zhì)粒的大片段進行連接,得到中間質(zhì)粒pSCll-A,接著用限制性內(nèi)切酶Xmal和KasI對下游同源臂A47LR進行雙酶切,與經(jīng)同樣雙酶切的中間質(zhì)粒pSCll-A的大片 段進行連接,得到中間質(zhì)粒PSC11A47L最后用限制性內(nèi)切酶化01和Xmal對OVA基因片段 進行雙酶切,與經(jīng)同樣雙酶切的中間質(zhì)粒PSC11A47L的大片段進行連接,獲得重組質(zhì)粒,酶 切和測序鑒定無誤后,得到質(zhì)粒pSCllA47k0VA。
      [0074] 具體步驟如下:
      [007引 酶切體系如下:1yg相應(yīng)質(zhì)粒或基因片段,2yL10xTbuffer,2yLBSA,抓相應(yīng) 的限制性內(nèi)切酶,dd&O定容至20yL。酶切條件37°C,3h。
      [0076] 酶切產(chǎn)物上樣電泳,切膠回收線性條帶;將目的條帶與載體連接;
      [0077] 連接反應(yīng)體系如下:3化目的片段,1化線性質(zhì)粒,lyLDNA連接酶,lyLlOx buffer,定容至10yL16°C連接過夜;
      [0078] 向冰上解凍的感受態(tài)D冊a中加入上述連接產(chǎn)物5yL,混勻后冰上靜置30min; 42 °C熱擊Imin;冰上放置5min后,加入500yL預(yù)熱的LB培養(yǎng)基,搖床培養(yǎng)30-60min; 300化pm離屯、5min,棄上清;重新加入30yL新鮮LB培養(yǎng)基,混勻后涂布含Amp的LB固體 平板;37°C培養(yǎng)過夜,不超過16h。挑取單克隆細菌接種到含Amp的液體培養(yǎng)基,搖床培養(yǎng), ISOrpm,14h;對挑取的單克隆細菌培養(yǎng)物進行菌落PCR,驗證外源基因OVA是否有效插入。
      [0079] 驗證引物對:
      [0080] 0VA-F2 :5' -GGGAAGGATCGACAGATTTG-3,
      [0081] 0VA-R2 :5, -GCTAGTCACAATCACCACTTTC-3,
      [0082]體系如下:菌液lyL,10xTaqbuffer2. 5yL,dNTP2yL,Taq酶 0. 5yL,引物各 1yLdd&O定容至25yL。擴增條件如下:95°C預(yù)變性5min;95°C變性30s,52°C退火30s, 72°C延伸90s,循環(huán)30次;72°C延伸5min,置于4°C。PCR產(chǎn)物上樣電泳,對符合要求的細菌 培養(yǎng)物提取質(zhì)粒;使用化〇1和EcoRV對上一步得到的質(zhì)粒進行雙酶切,上樣電泳驗證大 小,并與VectorNTI分析預(yù)測的酶切結(jié)果進行比對。對驗證正確的克隆送上海英濰捷基公 司進行測序。
      [0083] 步驟2、痘苗病毒的重組和篩選
      [0084] 2. 1痘苗病毒重組
      [0085] (1)^了25培養(yǎng)瓶培養(yǎng)〇^-1細胞至80%單層;
      [008引 似W0. 05M0I感染野生型痘苗病毒,37°C培養(yǎng)2小時;
      [0087] (3)去除病毒液,按照轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine2000說明書轉(zhuǎn)染pSCllA47k0VA 至感染細胞中,培養(yǎng)48小時;
      [0088] (4)收集細胞,反復(fù)凍融=次,進行超聲破碎后,保存于-80°C。
      [0089] 2. 2VACV-AA4化-OVA病毒的篩選
      [0090] (1)用6孔板培養(yǎng)CV-1細胞至80 %單層;
      [00川 似取經(jīng)超聲破碎后的病毒懸液,做倍比稀釋,感染CV-1細胞,37°C培養(yǎng)2小時;
      [0092] (3)每孔覆蓋3ml瓊脂培養(yǎng)基,培養(yǎng)2天;
      [0093] (4)每孔加入2ml含X-gal的上層瓊脂培養(yǎng)基,培養(yǎng)過夜;
      [0094] (5)觀察藍斑產(chǎn)生情況,挑取孤立藍斑進行進一步篩選,連續(xù)單斑純化5代,至病 毒純化。
      [0095] 步驟3、重組病毒的鑒定和純化
      [0096] 3. 1重組病毒的鑒定
      [0097] 將上述重組痘苗病毒VACV-AA4化-OVA經(jīng)BSC-1細胞連續(xù)傳代(> 10次)后,提 取重組病毒DNA,使用PCR驗證其中的A4化和OVA基因,并用WesternBlot驗證OVA蛋白 在感染細胞中的表達。
      [0098] 3. 3. 1PCR鑒定A4化和OVA基因
      [0099]A4化鑒定引物:
      [0100]A47L-JDF1 :5,-AGTATAGGTGTATGGCATTAGCC-3,(野生型痘苗病毒第巧3679-巧3701 位,即序 列1的第745-767位)
      [010"A47kJDRl:5' -AGTGACAGTGGATCTCTGAGG-3'(野生型痘苗病毒第 154889-154909 位的反向互補序列,即序列2的第262-282位的反向互補序列)
      [0102]OVA鑒定引物:
      [0103] 0VA-F1 :5' -CATGCCATGGATGGGCTCCATCGGCGCAG-3'
      [0104] 0VA-R1 :5' -TCCCCCCGGGTTAAGGGGAAACACATCTGC-3'
      [0105]W純化的重組痘苗病毒的基因組DNA為模板,用上述3對鑒定引物進行PCR檢測 反應(yīng),同時分別設(shè)置野生型痘苗病毒和/或重組痘苗病毒VACV-0VA或VACV-AA4化的基因 組DNA為模板的對照。
      [0106]PCR擴增體系為:
      [0107] DNA 1|il dNTPmix(2. 5mM) 5|〇,1 正向引物F(10叫/
      當(dāng)前第2頁1 2 3 
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