一種褐藻膠裂解酶基因algp及其制備方法與表達(dá)的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及生物工程領(lǐng)域,更具體地,本發(fā)明涉及一種褐藻膠裂解酶基因algp及 其制備方法與表達(dá)。
【背景技術(shù)】
[0002] 廣轟無(wú)巧的海洋占據(jù)著地球71%的面積,是一個(gè)巨大的寶庫(kù),蘊(yùn)藏的巨量的生物 資源。海藻是其中一種重要的海洋植物,它是無(wú)機(jī)物的天然富集器,也是許多海洋活性物質(zhì) 的制造者。海藻多糖就是海藻中的一大類(lèi)重要活性物質(zhì),目前國(guó)際上應(yīng)用最廣泛最多的海 藻多糖是褐藻膠,卡拉膠和瓊膠。
[0003] 褐藻膠是源自于褐藻植物的細(xì)胞壁的水溶性酸性多糖,其主要由aA-古羅糖醒 酸和目-D-甘露糖醒酸組成。隨著研究的發(fā)現(xiàn),褐藻膠的降解產(chǎn)物具有特別的化學(xué)活性與 生物活性,在醫(yī)藥衛(wèi)生、食品工業(yè)及化妝品行業(yè)等均存在巨大的應(yīng)用價(jià)值。制備褐藻膠降解 產(chǎn)物有多種方法,如酸法降解、超聲降解、氧化降解、酶降解法等。其中酶法降解相較于化學(xué) 法制備反應(yīng)溫和、易于控制,耗能低,產(chǎn)物回收率較高W及不會(huì)產(chǎn)生嚴(yán)重的污染等優(yōu)點(diǎn),更 多的研究聚焦于酶法降法制備褐藻膠低聚糖。
[0004] 但是,目前由于大多數(shù)產(chǎn)褐藻膠裂解酶的菌株的活性較低,產(chǎn)量較低,阻礙了褐藻 膠低聚糖的制備,進(jìn)一步阻礙了研究與應(yīng)用的深入進(jìn)展。
[0005] 因此,開(kāi)發(fā)活性高、產(chǎn)量高的褐藻膠裂解酶、提高產(chǎn)褐藻膠裂解酶的菌株的活性成 為了本技術(shù)領(lǐng)域的當(dāng)務(wù)之急。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0006] 本發(fā)明的目的在于提供一種褐藻膠裂解酶基因algp及其制備方法與表達(dá)。
[0007] 在本發(fā)明的第一方面,提供一種褐藻膠裂解酶,其是:
[000引 (a)SEQIDNO: 2所示的氨基酸序列的多膚;或
[0009] 化)將SEQIDNO:2所示氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或多個(gè)(如1-20個(gè);較佳地1-10 個(gè);更佳地1-5個(gè))氨基酸殘基的取代、缺失或添加而形成的,且具有(a)多膚活性的由(a) 衍生的多膚;
[0010] (C)氨基酸序列與(a)限定的多膚的氨基酸序列有90%W上(較佳地95%W上; 更佳地98%W上;更佳地99%W上)相同性且具有(a)多膚活性的多膚;或
[0011] (d)具有(a)多膚功能的SEQIDNO:2的蛋白片段。
[0012] 在一個(gè)優(yōu)選例中,所述的褐藻膠裂解酶來(lái)源于海洋弧菌(VibrioSP.)QY102。
[0013] 在本發(fā)明的另一方面,提供一種分離的多核巧酸,該多核巧酸編碼所述的褐藻膠 裂解酶的多核巧酸。
[0014] 在一個(gè)優(yōu)選例中,所述的多核巧酸的核巧酸序列如SEQIDNO: 1所示。
[0015] 在本發(fā)明的另一方面,提供一種表達(dá)載體,它含有所述的多核巧酸。
[0016] 在一個(gè)優(yōu)選例中,所述的表達(dá)載體來(lái)源于pet28。
[0017] 在本發(fā)明的另一方面,提供一種遺傳工程化的宿主細(xì)胞,它含有所述的載體,或基 因組中整合有所述的多核巧酸。
[0018] 在一個(gè)優(yōu)選例中,所述的宿主細(xì)胞是原核細(xì)胞,較佳地為大腸桿菌細(xì)胞,更佳地為 HMS174值E3)。
[0019] 在本發(fā)明的另一方面,提供所述的褐藻膠裂解酶的用途,用于酶解褐藻膠。
[0020] 在本發(fā)明的另一方面,提供一種生產(chǎn)褐藻膠裂解酶的方法,包括步驟:
[0021] (1)培養(yǎng)所述的宿主細(xì)胞,獲得培養(yǎng)物;和
[0022] (2)從培養(yǎng)物中分離褐藻膠裂解酶。
[0023] 在一個(gè)優(yōu)選例中,所述的宿主細(xì)胞是大腸桿菌細(xì)胞,所述的方法包括:
[0024] 使所述宿主細(xì)胞在化發(fā)酵罐中采用發(fā)酵培養(yǎng)基生長(zhǎng),生長(zhǎng)到ODe。。= 3 + 0. 5時(shí), 開(kāi)始補(bǔ)稀料,根據(jù)溶氧反饋緩慢提升補(bǔ)料速率,待1+0.2L稀料補(bǔ)完換成濃料進(jìn)行補(bǔ)料;整 個(gè)發(fā)酵過(guò)程控制溶氧在30 + 10% (較佳地30 + 5% );菌體生長(zhǎng)到ODe。。= 40 + 3時(shí)暫停補(bǔ) 料,此時(shí)溶氧迅速回升,待停補(bǔ)料約IOmin后進(jìn)行IPTG誘導(dǎo),添加IPTG后維持30 ± 5min后 再進(jìn)行補(bǔ)料,待菌體生長(zhǎng)緩慢、酶活不再增長(zhǎng)后停止發(fā)酵。
[00巧]在另一優(yōu)選例中,所述的發(fā)酵培養(yǎng)基的組分為;酵母粉2g/l,甘油5g/l,泡敵 60U1/L,胞2冊(cè)〇46g/L,KH2PO43g/L,畑典1Ig/L,化Cl0. 5g/L,M拆〇40. 5g/L,CaClz溶液 2ml/L,微量元素2ml/L;
[0026] 所述的稀料的組分為;蛋白腺20g/L,酵母粉lOg/L,甘油60g/L,M拆O4I. 25g/L;
[0027] 所述的濃料的組分為;蛋白腺80g/l,酵母粉40g/l,甘油240g/L,M拆〇45g/L;
[0028] 所述各組分的用量在所指定數(shù)值基礎(chǔ)上可浮動(dòng)±20% (較佳地,浮動(dòng)±10% ;更 佳地,浮動(dòng)±5% )。
[0029] 在本發(fā)明的另一方面,提供一種用于酶解褐藻膠的試劑盒,所述的試劑盒中包含 所述的褐藻膠裂解酶。
[0030] 本發(fā)明的其它方面由于本文的公開(kāi)內(nèi)容,對(duì)本領(lǐng)域的技術(shù)人員而言是顯而易見(jiàn) 的。
【附圖說(shuō)明】
[0031] 圖1、褐藻膠裂解酶基因al甜的核巧酸序列。
[0032] 圖2、根據(jù)褐藻膠裂解酶基因algp的核巧酸序列推測(cè)的氨基酸序列。
【具體實(shí)施方式】
[0033] 本發(fā)明人經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的研究,首次掲示了一種海洋弧菌(VibrioSP.)QY102來(lái)源的 褐藻膠裂解酶,其編碼基因命名為algp。本發(fā)明的褐藻膠裂解酶蛋白穩(wěn)定性好,生物活性 高。本發(fā)明還公開(kāi)了含有algp基因的表達(dá)載體和宿主細(xì)胞,W及表達(dá)該褐藻膠裂解酶的方 法。根據(jù)本發(fā)明的技術(shù)方案,可W實(shí)現(xiàn)W較低的成本大量生產(chǎn)重組褐藻膠裂解酶。
[0034] 如本文所用,所述的"褐藻膠裂解酶活性"是W酶的活力單位來(lái)定義的。酶活力單 位扣)定義為;在實(shí)驗(yàn)條件下,每分鐘催化底物產(chǎn)生Iyg還原糖所需的酶量。發(fā)酵液酶活 力單位定義為;每毫升發(fā)酵液含酶活單位扣/ml)。
[0035] 如本文所用,"分離的"是指物質(zhì)從其原始環(huán)境中分離出來(lái)(如果是天然的物質(zhì),原 始環(huán)境即是天然環(huán)境)。如活體細(xì)胞內(nèi)的天然狀態(tài)下的多聚核巧酸和多膚是沒(méi)有分離純化 的,但同樣的多聚核巧酸或多膚如從天然狀態(tài)中同存在的其他物質(zhì)中分開(kāi),則為分離純化 的。
[0036] 如本文所用,"分離的褐藻膠裂解酶或多膚(蛋白)"是指褐藻膠裂解酶基本上不 含天然與其相關(guān)的其它蛋白、脂類(lèi)、糖類(lèi)或其它物質(zhì)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員能用標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì) 純化技術(shù)純化褐藻膠裂解酶。基本上純的多膚在非還原聚丙帰醜胺凝膠上能產(chǎn)生單一的主 帶。
[0037] 本發(fā)明的褐藻膠裂解酶多膚可W是重組多膚、天然多膚、合成多膚。本發(fā)明的多膚 可W是天然純化的產(chǎn)物,或是化學(xué)合成的產(chǎn)物,或使用重組技術(shù)從宿主(例如,細(xì)菌、酵母、 高等植物、昆蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物細(xì)胞)中產(chǎn)生。
[0038] 本發(fā)明還包括褐藻膠裂解酶的片段、衍生物和類(lèi)似物。如本文所用,術(shù)語(yǔ)"片段"、 "衍生物"和"類(lèi)似物"是指基本上保持本發(fā)明的天然褐藻膠裂解酶相同的生物學(xué)功能或活 性的多膚。本發(fā)明的多膚片段、衍生物或類(lèi)似物可W是(i)有一個(gè)或多個(gè)保守或非保守性 氨基酸殘基(優(yōu)選保守性氨基酸殘基)被取代的多膚,而送樣的取代的氨基酸殘基可W是 也可W不是由遺傳密碼編碼的,或(ii)在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基中具有取代基團(tuán)的多膚, 或(iii)附加的氨基酸序列融合到此多膚序列而形成的多膚(如前導(dǎo)序列或分泌序列或用 來(lái)純化此多膚的序列或蛋白原序列,或融合蛋白)。根據(jù)本文的定義送些片段、衍生物和類(lèi) 似物屬于本領(lǐng)域熟練技術(shù)人員公知的范圍。
[0039] 在本發(fā)明中,術(shù)語(yǔ)"褐藻膠裂解酶"指具有裂解褐藻膠的活性的SEQIDNO:2序列 的多膚。該術(shù)語(yǔ)還包括具有與褐藻膠裂解酶相同功能的、SEQIDN0:2序列的變異形式。送 些變異形式包括(但并不限于);若干個(gè)(通常為1-20個(gè),更佳地1-10個(gè),還更佳如1-8 個(gè)、1-5個(gè)、1-3個(gè)、或1-2個(gè))氨基酸的缺失、插入和/或取代,W及在C末端和/或N末端 添加或缺失一個(gè)或數(shù)個(gè)(通常為20個(gè)W內(nèi),較佳地為10個(gè)W內(nèi),更佳地為5個(gè)W內(nèi))氨基 酸。例如,在本領(lǐng)域中,用性能相近或相似的氨基酸進(jìn)行取代時(shí),通常不會(huì)改變蛋白質(zhì)的功 能。又比如,在C末端和/或N末端添加或缺失一個(gè)或數(shù)個(gè)氨基酸通常也不會(huì)改變蛋白質(zhì) 的功能。該術(shù)語(yǔ)還包括褐藻膠裂解酶的活性片段和活性衍生物。
[0040] 多膚的變異形式包括:同源序列、保守性變異體、等位變異體、天然突變體、誘導(dǎo)突 變體、在高或低的嚴(yán)緊度條件下能與褐藻膠裂解酶DNA雜交的DNA所編碼的蛋白。本發(fā)明 還提供了其他多膚,如包含褐藻膠裂解酶或其片段的融合蛋白。
[0041] 發(fā)明還提供褐藻膠裂解酶或多膚的類(lèi)似物。送些類(lèi)似物與天然褐藻膠裂解酶的差 別可W是氨基酸序列上的差異,也可W是不影響序列的修飾形式上的差異,或者兼而有之。 送些多膚包括天然或誘導(dǎo)的遺傳變異體。誘導(dǎo)變異體可W通過(guò)各種技術(shù)得到,如通過(guò)福射 或暴露于誘變劑而產(chǎn)生隨機(jī)誘變,還可通過(guò)定點(diǎn)誘變法或其他已知分子生物學(xué)的技術(shù)。類(lèi) 似物還包括具有不同于天然k氨基酸的殘基(如D-氨基酸)的類(lèi)似物,W及具有非天然 存在的或合成的氨基酸(如目、Y-氨基酸)的類(lèi)似物。應(yīng)理解,本發(fā)明的多膚并不限于上 述例舉的代表性的多膚。
[0042] 在本發(fā)明中,"褐藻膠裂解酶保守性變異多膚"指與SEQIDNO:2的氨基酸序列相 比,有至多10個(gè),較佳地至多8個(gè),更佳地至多5個(gè),最佳地至多3個(gè)(如1個(gè)、2個(gè)