一種NT-proBNP核酸適配體及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于NT-proBNP檢測技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及一種NT-proBNP核酸適配體及其 應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002] 腦鈉肽(BNP)最早由Sudoh等在豬腦中發(fā)現(xiàn),是一種由32氨基酸肽鏈組成的多肽 類神經(jīng)激素。人類心臟初始分泌的BNP是一種由132個氨基酸組成的前體,其后被酶切降 解為具有生物活性的BNP(32個氨基酸殘基組成)及腦鈉肽前體N末端(NT-ProBNP,76個 氨基酸殘基組成)。BNP和NT-ProBNP主要由心肌壁受壓后心室應(yīng)答釋放,是對心功能敏感 且特異的標志物,其在血液中的濃度與心功能障礙的嚴重程度相關(guān),可以用來更客觀的評 價患者疾病的嚴重程度和患者的預(yù)后。廣泛應(yīng)用于心衰診斷、心衰預(yù)后與監(jiān)視的評估、急性 冠脈綜合癥的危險分類、早期或輕度的心功能不全等。
[0003] NT-ProBNP較BNP在評價心功能上更具有優(yōu)勢,其優(yōu)勢在于:l、NT-proBNP由76個 氨基酸組成,較BNP半衰期長,其半衰期大于lh,在血液中清除較慢,可累積較高濃度,更能 靈敏地反映心功能的狀態(tài)和變化,尤其是在早期診斷中;標本可以存放,即可以中心實驗室 檢測,也可以床邊檢測,BNP只能床邊即刻檢測;2、由于無生理活性,因而不受治療用合成 BNP的干擾;3、NT-proBNP可以使用血清和血漿,抗干擾性強,BNP只能使用血漿標本。4、 NT-proBNP的定量結(jié)果能提供可靠,且具有良好的重復(fù)性臨床信息,更適合臨床應(yīng)用。因此, 目前臨床應(yīng)用中已逐漸呈現(xiàn)將NT-proBNP取代BNP的趨勢。
[0004] 目前NT-proBNP檢測方法主要為免疫檢測方法,一種為競爭酶聯(lián)免疫分析,如 Biomedica Gruppe公司的產(chǎn)品;一種為雙抗體夾心法,如Roche Diagnostics的雙抗體夾 心化學發(fā)光法,已申報發(fā)明專利。目前,基于抗體的方法,有一定優(yōu)勢,但也有一些固有的缺 陷?,F(xiàn)在,科學家不約而同的把注意力聚焦到分子生物學新技術(shù)在生物檢測的應(yīng)用上。
[0005]SELEX技術(shù)(系統(tǒng)進化指數(shù)富集技術(shù))是90年代初研制的一種新的組合化學技 術(shù)。其基本原理就是利用分子生物學技術(shù),構(gòu)建人工合成的單鏈隨機寡核苷酸文庫,其中隨 機序列一般長度在20-40bp左右,文庫容量在1014-1015之間。由于單鏈隨機寡核苷酸片段 特別是RNA易形成發(fā)卡、口袋、假節(jié)、G-四聯(lián)體等二級結(jié)構(gòu),故能與蛋白質(zhì)、小肽,甚至金屬 離子結(jié)合,形成具有很強結(jié)合力的復(fù)合物。這種方法具有簡便、快速、經(jīng)濟等特點,與其他組 合化學庫如隨機肽庫、抗體庫和噬菌體表面展示文庫相比,從寡核苷酸文庫中篩選出的核 酸適體具有許多優(yōu)勢:a.本身是寡核苷酸,分子量較小可以化學合成,節(jié)約成本;b.具有比 抗體更高的特異性和相近的親和性;c.便于標記,在不同部位有選擇性的標記;d.穩(wěn)定性 好,重復(fù)性好,易于保存,對高溫和劇烈條件不敏感。因此,寡核苷酸適配體在臨床檢測及診 斷中具有良好的應(yīng)用前景。有關(guān)核酸適配體檢測新技術(shù)已廣泛應(yīng)用生物檢測、生物傳感、體 內(nèi)成像、蛋白核酸功能研究各個領(lǐng)域,顯示出了誘人的前景。
[0006] NT-proBNP為76氨基酸殘基的多肽,分子量小,可利用的抗原表位局限,且被羅氏 專利保護,核酸適配體分子量只有10-20KD,較抗體IgG150kD小得多,在建立夾心法的檢測 中,可以獲得多個抗原位點的特異核酸適配體,可以克服抗體分子量大而引起空間位阻的 影響,易于夾心檢測方法的建立。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0007] 本發(fā)明針對現(xiàn)有技術(shù)中的不足,其目的在于提供一種NT-proBNP核酸適配體及其 應(yīng)用。
[0008] 為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采取的技術(shù)方案如下;
[0009] 一種NT-proBNP核酸適配體,所述的核酸適配體為SEQ ID : 1-15所示的核苷酸序 列中的任意一條。
[0010] 所述的核酸適配體能與NT-proBNP蛋白或NT-proBNP蛋白N端氨基酸序列制備的 單克隆抗體相結(jié)合。
[0011]所述的NT-proBNP蛋白N端的氨基酸序列為GlySerAlaSerAspLeuGluThr SerGlyLeuGlnGluGlnArg。
[0012] 一種NT-proBNP核酸適配體在制備NT-proBNP檢測試劑盒中的應(yīng)用。
[0013] 所述的NT-proBNP核酸適配體被生物素標記。
[0014] 一種NT-proBNP核酸適配體在制備NT-proBNP檢測試紙條中的應(yīng)用。
[0015] 所述的NT-proBNP核酸適配體被膠體金標記。
[0016] 所述的NT-proBNP檢測試紙條的組成為:在PVC背襯(1)上依次粘附有樣品墊 (2)、結(jié)合墊(3)、硝酸纖維素膜(4)和吸水墊(5);所述的結(jié)合墊(3)上包被有由膠體金標 記的NT-proBNP核酸適配體;所述的硝酸纖維素膜設(shè)置有檢測線(6)和質(zhì)控線(7);其中, 檢測線(6)上包被有NT-proBNP蛋白N端氨基酸的單克隆抗體,質(zhì)控線(7)上包被有與膠 體金標記的NT-proBNP的核酸適配體結(jié)合的試劑。
[0017] 所述的與膠體金標記的NT-proBNP的核酸適配體結(jié)合的試劑為NT-proBNP核酸適 配體的互補序列。
[0018] 本發(fā)明的優(yōu)點為:所述的NT-proBNP核酸適配體本身是寡核苷酸,分子量較小, 可以化學合成,節(jié)約成本,具有比抗體更高的親和性和特異性;同時所述的NT-proBNP核 酸適配體便于標記,重復(fù)性和穩(wěn)定性好,易于保存。用所述NT-proBNP核酸適配體制備的 NT-proBNP檢測試劑盒和試紙條對NT-proBNP檢測靈敏,且易于優(yōu)化。
【附圖說明】
[0019] 圖1為合成的NT-proBNP基因與proBNP基因序列的測序比對圖。
[0020] 圖2為pGEX4T-1-NT-ProBNP表達載體的雙酶切電泳圖。
[0021] 圖3為純化后的GST-NT-proBNP蛋白的SDS-PAGE電泳圖;其中,1 :誘導(dǎo)前全菌,2 : 誘導(dǎo)沉淀,3 :誘導(dǎo)上清,4 :GST柱純化穿透液,5-9 :GST純化洗脫收集液,10 :蛋白分子量標 準。
[0022] 圖4為純化后的12G4單克隆抗體的SDS-PAGE電泳圖。
[0023] 圖5為陽性克隆PCR鑒定電泳圖。
[0024] 圖6為NT-proBNP核酸適配體活性評價柱形圖。
[0025] 圖7為一種NT-proBNP檢測試紙條的結(jié)構(gòu)示意圖。
【具體實施方式】
[0026] 下面結(jié)合附圖和具體實施例對本發(fā)明做進一步說明。
[0027] 實施例1 :全基因合成NT-proBNP基因,構(gòu)建pGEX4T-l-NT-ProBNP表達載體并純 化GST-NT-proBNP蛋白。
[0028] (1)通過genebank查詢proBNP基因序列,根據(jù)成熟BNP后剪切的N端序列即 NT-proBNP序列設(shè)計全序列合成方案,通過DNAwork2. 0軟件進行密碼子優(yōu)化,不改變氨基 酸序列組成,并使蛋白更易于在原核大腸桿菌中表達,然后在優(yōu)化后的核酸序列的兩端加 上EcoRI和SalI酶切位點,便于與表達載體連接克隆,優(yōu)化設(shè)計后的核苷酸序列如SEQ ID:16所示。將優(yōu)化后的序列送交金斯瑞公司進行合成,圖1為合成的NT-proBNP基因與 proBNP基因序列的測序比對圖。
[0029] (2)將合成基因NT-proBNP從PUC57載體中雙酶切后膠回收,并將pGex4T-l 載體雙酶切,回收載體片段,將回收基因片段和載體片段經(jīng)T4DNA連接酶連接,構(gòu)建成 pGEX4T-l-NT-Pr〇BNP表達載體,并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中,涂平板,37度培養(yǎng) 16h,挑取單克隆進行液體培養(yǎng)并提取質(zhì)粒進行雙酶切鑒定。圖2為pGEX4T-l-NT-Pr〇BNP 表達載體的雙酶切電泳圖,從圖可知表達載體構(gòu)建成功。
[0030] (3)將構(gòu)建好的pGEX4T-1-NT-ProBNP表達載體轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21 (DE3)感受態(tài) 細胞中,挑取單克隆進行IPTG誘導(dǎo)表達,挑選表達量高的單克隆保存作為菌種。放大菌種 培養(yǎng),進行誘導(dǎo)后收集菌體,超聲破碎,采用GST標簽親和柱進行親和純化,收集洗脫峰進 行SDS-PAGE電泳分析,如圖3所示。純化的GST-NT-proBNP蛋白純度達95%以上,可以滿 足接下來的實驗需求。
[0031] 實施例2 :制備NT-proBNP蛋白N端氨基酸的單克隆抗體。
[0032] 分析NT-proBNP蛋白的抗原表位,選擇N端優(yōu)勢抗原表位,人共合成NT-proBNP蛋 白的N端 15 個氨基酸多肽(GlySerAlaSerAspLeuGluThrSerGlyLeuGlnGluGlnArg),將合成 的多肽與牛血清白蛋白(BSA)共價偶聯(lián)后進行免疫,當血清效價達到要求后,進行脾細胞 分離,并與SP/20骨髓瘤細胞融合,進行單細胞克隆,將抗體效價高的單細胞克隆進行亞克 隆,如表1所示:5G4、5E7和12G4單克隆抗體活性較高,將此3株活性較高的單克隆抗體制 備腹水,并用proteinA親和層析進行純化。圖4為純化后的12G4單克隆抗體的SDS-PAGE 電泳圖,顯示為重鏈、輕鏈兩條帶。
[0033] 表1 :單克隆抗體的篩選(0D450nm吸光度)
[0034]
[0035] 實施例3:篩選與獲得的單克隆抗體配對的NT-proBNP核酸適配體。
[0036] 篩選步驟如下:
[0037] 1、硅包磁珠經(jīng)APTES(2% )氨基硅烷化處理,使其帶活性氨基,形成氨基磁珠;
[0038]2、將 8ug/ml的NT-proBNP單克隆抗體(5G4),在 37°C下經(jīng)EDC/NHS(4mg/ml/llmg/ ml)活化羧基,活化時間為15min;然后取lml活化后的單克隆抗體與lmg氨基磁珠在37°C 下偶聯(lián)lh,形成偶聯(lián)抗體磁珠;
[0039] 3、用PBS清洗偶聯(lián)抗體磁珠5次,然后用1 %BSA封閉過夜;
[0040] 4、加入100ul(2mg/ml)的GST-NT-proBNP蛋白到lml的偶聯(lián)抗體磁珠中,孵育2h, 形成結(jié)合GST-NT-proBNP蛋白的偶聯(lián)抗體磁珠;
[0041] 5、用SHMCK(0. 2%Tween-20)洗 5 次;
[0042] 6、將人工合成的ssDNA文