Scap基因突變體及其應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及SCAP基因突變體及其應(yīng)用。具體地，本發(fā)明涉及分離編碼SCAP突變體 的核酸，分離的多肽，篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的方法，篩選遺憾早發(fā)心肌梗死的 生物樣品的系統(tǒng)，用于篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的試劑盒，構(gòu)建體以及重組細(xì)胞。
【背景技術(shù)】
[0002] 心肌梗死(Myocardial Infarction，MI)是一種由于冠狀動脈粥樣硬化斑塊的纖 維帽破裂而引起后續(xù)的血栓形成，從而使得血管堵塞并引起相應(yīng)區(qū)域的心肌發(fā)生缺血缺 氧，最終引起心肌壞死的嚴(yán)重致猝死性疾病。其中，部分人群呈現(xiàn)出發(fā)病年齡早（男性〈50， 女性〈60)、家族聚集傾向等典型臨床特點(diǎn)，稱為早發(fā)心肌梗死(Premature Myocardial Infarcti〇n，PMI)。有研究顯示，早發(fā)心肌梗死的遺傳度高達(dá)63%。由于這類患者的首發(fā)癥 狀即可表現(xiàn)為由急性心肌壞死引起的猝死，之前可無任何冠心病及其危險因素的相關(guān)癥 狀，因此相比非早發(fā)性心肌梗死，其危險度更高。這使得通過早期檢測潛在患病者的遺傳信 息，在出現(xiàn)致死性癥狀前提供風(fēng)險預(yù)測、實(shí)現(xiàn)對早發(fā)心肌梗死的"初級預(yù)防"顯得尤為重要。 而目前該病的發(fā)病機(jī)制尚未完全清楚，致病基因和致病突變?nèi)圆幻鞔_，且尚未有足夠的用 于早期識別早發(fā)心?；颊叩倪z傳標(biāo)志物。
[0003] 因而，目前對早發(fā)心肌梗死的致病基因和致病突變的研究仍有待深入。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明旨在至少解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的技術(shù)問題之一。為此，本發(fā)明的一個目的 在于提出一種能夠有效篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的方法。
[0005] 本發(fā)明是基于發(fā)明人的下列工作完成的：發(fā)明人高通量外顯子組測序聯(lián)合候選基 因突變驗(yàn)證的方法確定了SCAP基因?yàn)樵绨l(fā)心肌梗死的致病基因，并且SCAP基因18號外顯子 上的c. 3035OT突變?yōu)樵绨l(fā)心肌梗死的致病突變。
[0006] 根據(jù)本發(fā)明的第一方面，本發(fā)明提出了一種分離的編碼SCAP突變體的核酸。根據(jù) 本發(fā)明的實(shí)施例，所述核酸與SEQ ID N0:1相比，具有c.3035C>T突變，即相對于野生型SCAP 基因，本發(fā)明的SCAP基因突變體的第3035位堿基從C突變?yōu)門。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，發(fā)明人 確定了 SCAP基因以及該突變體與早發(fā)心肌梗死的發(fā)病密切相關(guān)，從而通過檢測該突變體在 生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患早發(fā)心肌梗死。
[0007] 根據(jù)本發(fā)明的第二方面，本發(fā)明提出了一種分離的多肽。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，與 SEQ ID N0:2相比，所述分離的多肽具有P.A1012V突變，即該突變是由于C.3035OT的無義 突變而引起的，具體地，該突變表示:該分離的多肽，由野生型SCAP的第1012位氨基酸A(丙 氨酸)突變?yōu)閂(纈氨酸）。通過檢測生物樣品中是否表達(dá)該多肽，可以有效地檢測生物樣品 是否易患早發(fā)心肌梗死。
[0008] 根據(jù)本發(fā)明的第三方面，本發(fā)明提出了一種篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的 方法。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該方法包括以下步驟:從所述生物樣品提取核酸樣本;確定所 述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID N0:1相比，具有c.3035C>T突 變是所述生物樣品易患早發(fā)心肌梗死的指示。通過根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的篩選易患早發(fā)心肌 梗死的生物樣品的方法，可以有效地篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品。
[0009] 根據(jù)本發(fā)明的第四方面，本發(fā)明提出了一種篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的 系統(tǒng)。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該系統(tǒng)包括:核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生 物樣品提取核酸樣本;核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相 連，用于對所述核酸樣本進(jìn)行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判 斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO: 1 相比，是否具有C.3035C>T突變，判斷所述生物樣品是否易患早發(fā)心肌梗死。利用該系統(tǒng)，能 夠有效地實(shí)施前述篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易患早 發(fā)心肌梗死的生物樣品。
[0010] 根據(jù)本發(fā)明的第五方面，本發(fā)明提出了一種用于篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣 品的試劑盒。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該試劑盒含有:適于檢測SCAP基因突變體的試劑，其中 與SEQ ID N0:1相比，該SCAP基因突變體具有C.3035C>T突變。利用根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例的 試劑盒，能夠有效地篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品。
[0011] 根據(jù)本發(fā)明的第六方面，本發(fā)明還提出了一種構(gòu)建體。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該構(gòu) 建體包含前面所述的分離的編碼SCAP突變體的核酸。由此，利用本發(fā)明的構(gòu)建體轉(zhuǎn)化受體 細(xì)胞獲得的重組細(xì)胞，能夠有效地用于篩選治療早發(fā)心肌梗死的藥物。
[0012]根據(jù)本發(fā)明的第七方面，本發(fā)明還提出了一種重組細(xì)胞。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，該 重組細(xì)胞是通過前面所述的構(gòu)建體轉(zhuǎn)化受體細(xì)胞而獲得的。根據(jù)本發(fā)明的一些實(shí)施例，利 用本發(fā)明的重組細(xì)胞，能夠有效地篩選治療早發(fā)心肌梗死的藥物。
[0013] 本發(fā)明的附加方面和優(yōu)點(diǎn)將在下面的描述中部分給出，部分將從下面的描述中變 得明顯，或通過本發(fā)明的實(shí)踐了解到。
【附圖說明】
[0014] 本發(fā)明的上述和/或附加的方面和優(yōu)點(diǎn)從結(jié)合下面附圖對實(shí)施例的描述中將變得 明顯和容易理解，其中：
[0015] 圖1顯示了根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的系統(tǒng)及其組 成部分的示意圖，其中，
[0016] 圖1A為根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的篩選易患早發(fā)心肌梗死的生物樣品的系統(tǒng)的示意圖，
[0017] 圖1B為根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的核酸提取裝置的示意圖，
[0018] 圖1C為根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的核酸序列確定裝置的示意圖；
[0019] 圖2顯示了根據(jù)本發(fā)明一個實(shí)施例的早發(fā)心肌梗死患者家系的家系圖；
[0020] 圖3顯示了根據(jù)本發(fā)明的一個實(shí)施例，早發(fā)心肌梗死患者家系中患者、家系內(nèi)正常 人以及家系外正常人的SCAP基因 C.3035OT突變位點(diǎn)的代表性Sanger測序驗(yàn)證峰圖。
【具體實(shí)施方式】
[0021] 下面詳細(xì)描述本發(fā)明的實(shí)施例，所述實(shí)施例的示例在附圖中示出，其中自始至終 相同或類似的標(biāo)號表示相同或類似的元件或具有相同或類似功能的元件。下面通過參考附 圖描述的實(shí)施例是示例性的，僅用于解釋本發(fā)明，而不能理解為對本發(fā)明的限制。
[0022] SCAP基因突變體
[0023]根據(jù)本發(fā)明的第一方面，本發(fā)明提出了一種分離的編碼SCAP突變體的核酸。根據(jù) 本發(fā)明的實(shí)施例，所述核酸與SEQ ID N0:1相比，具有C.3035OT突變。在本文中所使用的表 達(dá)方式"編碼SCAP突變體的核酸"，是指與編碼SCAP突變體的基因相對應(yīng)的核酸物質(zhì)，即核 酸的類型不受特別限制，可以是任何包含與SCAP突變體的編碼基因相對應(yīng)的脫氧核糖核苷 酸和/或核糖核苷酸的聚合物，包括但不限于DNA、RNA或cDNA。根據(jù)本發(fā)明的一個具體示例， 前面所述的編碼SCAP突變體的核酸為DNA。根據(jù)本發(fā)明的實(shí)施例，發(fā)明人確定了 SCAP基因的 及該突變體與早發(fā)心肌梗死的發(fā)病密切相關(guān)，從而通過檢測該突變體在生物樣品中是否存 在，可以有效地檢測生物樣品是否易患早發(fā)心肌梗死，也可以通過檢測該突變體在生物體 中是否存在，可以有效地預(yù)測生物體是否易患早發(fā)心肌梗死。
[0024] 對于本發(fā)明說明書和權(quán)利要求書中，提及核酸，本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解，實(shí)際包 括互補(bǔ)雙鏈的任意一條，或者兩條。為了方便，在本說明書和權(quán)利要求書中，雖然多數(shù)情況 下只給出了一條鏈，但實(shí)際上也公開了與之互補(bǔ)的另一條鏈。例如，提及SEQ ID N0:1，實(shí)際 包括其互補(bǔ)序列。本領(lǐng)域技術(shù)人員還可以理解，利用一條鏈可以檢測另一條鏈，反之亦然。
[0025] 該編碼SCAP突變體的核酸，是本申請的發(fā)明人通過高通量外顯子組測序聯(lián)合候選 基因突變驗(yàn)證的方法確定的早發(fā)心肌梗死的致病基因 SCAP上的致病突變。該突變位點(diǎn)在現(xiàn) 有技術(shù)中并未被提到。
[0026] 其中，野生型SCAP基因的cDNA具有如下所示的核苷酸序列：
[0027]
[0028」
[00：
[0030] 其編碼的蛋白質(zhì)具有如下所示的氨基酸序列：
[0031]
[0032] 發(fā)明人發(fā)現(xiàn)的該突變體與SEQ ID N0:1相比，具有C.3035OT突變，即相對于野生 型SCAP基因，本發(fā)明的SCAP基因突變體的第3035位堿基從C突變?yōu)門。由此，其所編碼的產(chǎn)物 與野生型的SCAP相比，具有P.A1012V突變，即該突變是由于c.3035C>T的無義突變而引起 的，具體地，該突變表示:該分離的多肽，由野生型SCAP的第1012位