本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及親水的樹枝狀分子和C18長鏈修飾的磁性石墨烯材料及其制備方法和在蛋白富集中的應用。
背景技術(shù):
生命科學隨著基因組測序計劃的完成實現(xiàn)了巨大的進展,同時也進入了后基因組時代,而蛋白質(zhì)組學也隨之成為后基因組時代的研究前沿和熱點領(lǐng)域。蛋白質(zhì)是生命功能的執(zhí)行者,也是生命現(xiàn)象的直接體現(xiàn)者,對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的研究將直接闡述生命在生理或病理下的變化機制。近年來,蛋白質(zhì)的分離和鑒定成為蛋白質(zhì)組學中非常重要的一個部分。以液相色譜和生物質(zhì)譜為技術(shù)手段的一系列研究手段逐漸被運用到蛋白質(zhì)的分離和鑒定中。然而也遇到了一些挑戰(zhàn)。比如有很多疾病相關(guān)的蛋白,它們在生物樣品中存在的豐度很低,直接對其進行色譜和質(zhì)譜的鑒定很困難,因而,去尋找合適而快捷的富集方法在蛋白質(zhì)的鑒定中顯的尤為重要。
石墨烯從發(fā)現(xiàn)以來由于它大的比表面積、表面富余的電子以及可修飾等特點得到了大量研究者的關(guān)注,而在生物分析研究領(lǐng)域,越來越多的以石墨烯為基底的材料也應運而生,廣泛地運用到分離和富集的目標中。同時,C18長鏈超強的疏水作用也被運用到低豐度肽段和蛋白的富集中。近年來,一種親水的聚酰胺-胺型樹枝狀分子(PAMAM)由于其表面大量的官能團和超強的親水作用引起了研究者的關(guān)注。
在眾多蛋白中,雖然大多數(shù)蛋白為疏水蛋白,但是也不乏大多親水的糖蛋白在生物體內(nèi)也發(fā)揮著重要的作用,據(jù)我們所知,尚未有研究表明一種材料同時結(jié)合親水和疏水的性能而運用于蛋白的富集中。結(jié)合這一目標,本發(fā)明設(shè)計了一種利用磁性石墨烯材料為基底,在其表面接枝一種親水的樹枝狀高分子PAMAM和C18的長鏈,從而達到分離和富集不同種蛋白的方法。這種方法成功的提高了蛋白的富集效率,對于蛋白的普適性很強,同時也有著很低的檢測限。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提出一種操作簡便,樣品損失率低,以親疏水富集為機理,高效率低檢測限的蛋白富集方法。
本發(fā)明提出的蛋白富集方法,是一種基于樹枝狀分子和C18長鏈修飾的磁性石墨烯材料對于蛋白富集方法。
本發(fā)明首先以磁性石墨烯為基底,在其表面包覆一層易于修飾的無孔二氧化硅,然后通過氨基和C18硅烷化試劑,在其表面修飾上氨基和C18長鏈,最后通過戊二醛交聯(lián)法將一種親水的樹枝狀分子聚酰胺-胺(PAMAM)接枝在氨基表面,得到親疏水的磁性材料。該新型磁性材料擁有較大的比表面積,親疏水相間的性能,用于蛋白富集,可完成對不同種蛋白的富集。
本發(fā)明提出的樹枝狀分子和C18長鏈修飾的磁性石墨烯材料的制備方法,具體步驟如下:
(1)將400-600 mg石墨烯分散到50-70 mL濃硝酸中,50-70 ℃水浴回流6-10小時;
(2)將步驟(1)所得產(chǎn)物進行離心、分離,用去離子水清洗至溶液為中性;
(3)將步驟(2)所得產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,放置保存,得到酸化石墨烯;
(4)將400-500 mg FeCl3?6H2O 溶于40-60 mL乙二醇中,攪拌得到黃色透明溶液;
(5)將步驟(3)所得產(chǎn)物分散在步驟(4)所得溶液中,超聲1.0-2.0小時,步驟(3)所得產(chǎn)物與步驟(4)所得溶液比例為:(150-200 mg):(40-60 mL);
(6)超聲攪拌情況下,將檸檬酸三鈉、醋酸鈉、聚乙二醇(20000)加入到步驟(5)所得混合溶液中,充分攪拌1.0-1.5小時,其中檸檬酸三鈉、醋酸鈉、聚乙二醇(20000)配比為(150-180 mg):(1.5-2.0 g):(1.0-1.5 g);
(7)將步驟(6)所得混合溶液轉(zhuǎn)移至水熱反應釜中,在180-220 ℃下加熱8-10小時;
(8)將步驟(7)中高壓反應釜冷卻至室溫,磁性分離產(chǎn)物,并用去離子水和無水乙醇洗滌以除去多余的原料,40-60 ℃下真空干燥,得到磁性石墨烯材料,記為magG;
(9)將步驟(8)所得產(chǎn)物修飾上無孔的二氧化硅,記為magG@SiO2;
(10)將步驟(9)所得產(chǎn)物修飾上氨基和C18長鏈,記為magG@SiO2@-NH2/C18;
(11)將步驟(10)所得產(chǎn)物修飾上高分子的聚酰胺-胺(PAMAM),記為magG@SiO2@PAMAM /C18。
本發(fā)明步驟(9)中,二氧化硅修飾磁性石墨烯的步驟具體如下:
(9.1)將200-250 mg的magG材料分散在100-150 mL異丙醇中,超聲10-15分鐘,之后加入超純水,氨水和正硅酸乙酯(TEOS),其中超純水,氨水和正硅酸乙酯(TEOS)的配比為10-15 mL: 1-2 mL: 1-1.5mL;
(9.2)將步驟(9.1)所得溶液超聲混合10-15分鐘,在30-35度條件下機械攪拌10-11h充分反應;
(9.3)通過磁性分離,將步驟(9.2)所得分析物經(jīng)過水洗、乙醇洗到上清液澄清為止,以除去表面雜質(zhì);
(9.4)將步驟(9.3)所得產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,得到magG@SiO2材料。
本發(fā)明步驟(10)中,氨基和C18修飾磁性石墨烯的步驟具體如下:
(10.1)將200-250 magG@SiO2材料分散在50-100 mL異丙醇中,超聲10-15分鐘,之后加入氨基硅烷化試劑(APTES)和碳十八硅烷化試劑(C18),二者的比例為1-2 mL: 1-2 mL;
(10.2)將步驟(10.1)所得溶液超聲混合10-15分鐘,在60-65度條件下機械攪拌10-11h充分反應;
(10.3)通過磁性分離,將步驟(10.2)所得分析物經(jīng)過水洗、乙醇洗;
(10.4)將步驟(10.3)所得產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,得到magG@SiO2@-NH2/C18材料。
本發(fā)明步驟(11)中,PAMAM修飾的步驟具體如下:
(11.1)將100-150 magG@SiO2@-NH2/C18材料分散在20-30 mL 5%戊二醛溶液中,活化2-2.5 h;
(11.2)將步驟(11.1)所得溶液用無水甲醇洗3-4遍,加入20-25 mL 甲醇(其中包含50-55μL PAMAM 溶液),常溫反應3-4 h;
(11.3)通過磁性分離,將步驟(11.2)所得上清液去除,加入20-30 mL氰基硼氫化鈉的甲醇溶液(10-15 mg/mL);反應2-2.5 h;
(11.4)通過磁性分離,將步驟(11.3)所得分析物經(jīng)過甲醇洗、水洗、乙醇洗;
(11.4)將步驟(10.3)所得產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,得到magG@SiO2@PAMAM/C18材料。
本發(fā)明把上述制備的樹枝狀分子和C18長鏈修飾的磁性石墨烯材料用于蛋白富集,具體操作步驟如下:
取 100-200 μg magG@SiO2@PAMAM/C18,用超純水洗3-4遍。加入超純水和適量的蛋白混合物,使總體積為95-110 μL;在20-30℃下富集20 min-30 min;磁性分離去除上清液,而后超純水清洗2-3次,最后用洗脫液(80%-85%乙腈和0.1-0.2%TFA 溶液),在30-37℃下洗脫20-25 min,將富集到的蛋白洗脫下來,洗脫液進行HPLC和MALDI-TOF MS分析檢測。
本發(fā)明提出的基于樹枝狀分子和C18長鏈修飾的磁性石墨烯材料對蛋白富集方法,在標準蛋白的富集中得到了很好的效果。
如圖2所示,通過本發(fā)明方法,在對標準的四種蛋白(牛血清白蛋白:BSA,肌紅蛋白:MYO,轉(zhuǎn)鐵蛋白:transferrin和溶菌酶:LYS)富集中,經(jīng)過HPLC分析有較高的回收率,圖3中它對于BSA和MYO蛋白的富集檢測限達到1ng/μL,這些結(jié)果都說明我們的材料在對蛋白的富集中有非常高的效率,由此也可以證明這種材料在以后的蛋白質(zhì)組學研究中有很好的應用前景。
附圖說明
圖1 magG@SiO2@PAMAM/C18材料的合成和富集流程圖。
圖2 magG@SiO2@PAMAM/C18的電鏡表征圖。其中,(a)magG,(b)magG@SiO2,(c)magG@SiO2@PAMAM/C18。
圖3 magG@SiO2@PAMAM/C18富集四種標準蛋白的HPLC色譜圖。
圖4 magG@SiO2@PAMAM/C18富集BSA和MYO檢測限的MALDI-TOF 質(zhì)譜圖。其中,(a)BSA富集前, (b)BSA富集后,(c)MYO富集前, (d)MYO富集后。
具體實施方式
實施例1:magG@SiO2@PAMAM/C18材料合成
(1)磁性石墨烯(magG)的合成:將400-600 mg石墨烯分散到50-70 mL濃硝酸中,50-70 ℃水浴回流6-10小時;所得產(chǎn)物進行離心、分離,用去離子水清洗至溶液為中性后在40-60 ℃下真空干燥,放置保存,得到酸化石墨烯;然后將400-500 mg FeCl3?6H2O 溶于40-60 mL乙二醇中,攪拌得到黃色透明溶液;將上一步中的酸化石墨烯溶解在所得黃色溶液中,超聲1.0-2.0比例為:150-200 mg:40-60 mL;接著在超聲攪拌情況下,將檸檬酸三鈉、醋酸鈉、聚乙二醇(20000)加入,充分攪拌1.0-1.5小時,其中,檸檬酸三鈉、醋酸鈉、聚乙二醇(20000)配比為:(150-180 mg):(1.5-2.0 g):(1.0-1.5 g);將混合溶液轉(zhuǎn)移至水熱反應釜中,在180-220 ℃下加熱8-10小時;反應結(jié)束后將反應釜冷卻至室溫,磁性分離產(chǎn)物,并用去離子水和無水乙醇洗滌以除去多余的原料,40-60 ℃下真空干燥,得到磁性石墨烯材料(記為magG);
(2)magG@SiO2的合成,將(1)中200-250 mg的magG材料分散在100-150 mL異丙醇中,超聲10-15分鐘,之后加入超純水,氨水和正硅酸乙酯(TEOS),其中超純水,氨水和正硅酸乙酯(TEOS)的配比為10-15 mL: 1-2 mL: 1-1.5mL;所得溶液超聲混合10-15分鐘,在30-35度條件下機械攪拌10-11h充分反應。通過磁性分離后,所得分析物經(jīng)過水洗、乙醇洗到上清液澄清為止,以除去表面雜質(zhì);最后產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,得到magG@SiO2材料;
(3)magG@SiO2@-NH2/C18的合成:將(2)中200-250 magG@SiO2材料分散在50-100 mL異丙醇中,超聲10-15分鐘,之后加入氨基硅烷化試劑(APTES)和碳十八硅烷化試劑(C18),二者的比例為1-2 mL: 1-2 mL;所得溶液超聲混合10-15分鐘,在60-65度條件下機械攪拌10-11h充分反應;通過磁性分離,將所得分析物經(jīng)過水洗、乙醇洗;最后所得產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,得到magG@SiO2@-NH2/C18材料;
(4)magG@SiO2@PAMAM/C18的合成:將(3)中100-150 magG@SiO2@-NH2/C18材料分散在20-30 mL 5%戊二醛溶液中,活化2-2.5 h; 所得溶液用無水甲醇洗3-4遍,加入20-25 mL 甲醇(其中包含50-55μL PAMAM 溶液),常溫反應3-4 h;通過磁性分離,將所得上清液去除,加入20-30 mL氰基硼氫化鈉的甲醇溶液(10-15 mg/mL),反應2-2.5 h;通過磁性分離后,所得分析物經(jīng)過甲醇洗、水洗、乙醇洗;最后所得產(chǎn)物在40-60 ℃下真空干燥,得到magG@SiO2@PAMAM/C18材料。
實施例2:100-200 μg magG@SiO2@PAMAM/C18材料用于蛋白的富集
取 100-200 μg magG@SiO2@PAMAM/C18,用超純水洗3-4遍。加入超純水和適量的蛋白混合物,使總體積為95-110 μL;在20-30℃下富集20 min-30 min;磁性分離去除上清液,而后超純水清洗2-3次,最后用洗脫液(80%-85%乙腈和0.1-0.2%TFA 溶液),在30-37℃下洗脫20-25 min,將富集到的蛋白洗脫下來,洗脫液進行HPLC和MALDI-TOF MS分析檢測。