本發(fā)明屬于生物檢測技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種使用熒光偏振法對乳鐵蛋白進行檢測的適配體及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
熒光偏振技術(shù)作為一種簡單可靠的信號傳導(dǎo)手段,可以基于熒光基團的分子質(zhì)量的變化提供關(guān)于分子取向、遷移和作用過程的信息。熒光偏振分析法具有很多的優(yōu)勢:第一,它是一種均相分析方法且靈敏度高,無需分離等復(fù)雜操作,結(jié)果重現(xiàn)性好;第二,響應(yīng)時間快,可以實時監(jiān)測分子間相互作用;第三,可以與酶標(biāo)儀等儀器聯(lián)用,可以實現(xiàn)自動化高通量測定;第四,熒光偏振依賴于兩個垂直方向上的熒光強度的比值,與熒光絕對強度無關(guān),熒光偏振值對熒光的波動及光漂白不敏感,從而成為在復(fù)雜生物樣品中均相測定目標(biāo)分子的理想分析方法。因此,熒光偏振技術(shù)在熒光傳感應(yīng)用中受到廣泛的研究關(guān)注。
乳鐵蛋白是一種極具廣闊市場前景的功能性蛋白,它主要存在于哺乳動物的乳汁中,其含量與動物的種屬息息相關(guān),以人乳、牛乳為典型代表。研究表明,乳鐵蛋白具有多種生物學(xué)活性。它具有參與鐵代謝、抗腫瘤、抗氧化、抗菌、阻斷氧自由基、免疫調(diào)節(jié)及抗炎癥、促進細胞增長、減少內(nèi)臟脂肪等多種功能。且由于乳鐵蛋白是一種可被嬰兒攝入的、安全極高的天然乳成分,其在日本被批準(zhǔn)為食品添加劑,在美國被納入一般認為安全物質(zhì)之中。加之,乳鐵蛋白廣泛的生物學(xué)功能深受國內(nèi)外食品相關(guān)企業(yè)的高度重視,在我國GB 14880—2012《食品營養(yǎng)強化劑使用標(biāo)準(zhǔn)》中,乳鐵蛋白也被列為一種新型營養(yǎng)強化劑并規(guī)定了其在相關(guān)乳制品中的含量標(biāo)準(zhǔn)。因而,能否建立快速準(zhǔn)確的乳鐵蛋白檢測技術(shù)對于食品安全來說至關(guān)重要。目前,適合不同類型生物樣品中乳鐵蛋白的檢測技術(shù)主要有分光光度法、高效液相色譜法、酶聯(lián)免疫吸附法、高效親和色譜法、高效毛細血管電泳法以及表面等離子共振技術(shù)等檢測技術(shù),但這些方法依然存在前處理過程復(fù)雜、實際樣品回收率低、穩(wěn)定性差等特點,因此建立出一種能夠全面實現(xiàn)準(zhǔn)確、快速、無需對樣品進行前處理的全自動乳鐵蛋白檢測方法十分重要且緊迫。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種用于檢測乳鐵蛋白含量的適配體。
本發(fā)明還要解決的技術(shù)問題是提供上述適配體在檢測乳鐵蛋白中的應(yīng)用。
為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明采用的技術(shù)方案如下:
一種用于檢測乳鐵蛋白含量的適配體,所述適配體的核苷酸序列如SEQ ID NO.5~65所示,所述的適配體優(yōu)選SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.18、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.35。
上述用于檢測乳鐵蛋白含量的適配體在檢測乳鐵蛋白中的應(yīng)用。
一種熒光偏振法測量陰性蛋白含量的方法,包括如下步驟:
(1)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線:向10μL、40nM~4000nM異硫氰酸熒光素標(biāo)記的適配體溶液中加入100μL不同濃度的陰性蛋白標(biāo)準(zhǔn)樣品,混勻,所述適配體的核苷酸序列為SEQ ID NO.1~61中的任一種,25℃~40℃下反應(yīng)5~120min,用酶標(biāo)儀檢測,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線;
(2)樣品檢測:將異硫氰酸熒光素標(biāo)記的適配體與待測樣品混合,按照步驟(1)的條件檢測。
其中,所述異硫氰酸熒光素標(biāo)記的適配體的濃度為40nM~4000nM;
其中,所述待測樣品的濃度為0.78~50μg/mL。
其中,所述的陰性蛋白為乳鐵蛋白、α-乳白蛋白、β-乳球蛋白、BSA,優(yōu)選乳鐵蛋白。
有益效果:
本發(fā)明以FITC標(biāo)記的適配體為探針,通過乳鐵蛋白與探針的特異性結(jié)合使熒光偏振信號發(fā)生改變,且乳鐵蛋白濃度對數(shù)值與熒光偏振信號呈線性變化,從而實現(xiàn)對乳鐵蛋白的定量檢測。該種熒光偏振法靈敏度高,抗干擾性非常強,可以有效避免假陽性信號,實現(xiàn)對復(fù)雜樣品中目標(biāo)物的測量,如牛奶中乳鐵蛋白的測量,該方法檢測的線性范圍為0.78~50μg/mL。
附圖說明
圖1熒光偏振法反應(yīng)時間優(yōu)化圖。
圖2不同濃度乳鐵蛋白與熒光偏振信號關(guān)系圖。
圖3熒光偏振法對乳鐵蛋白特異性檢測圖。
圖4熒光偏振法對乳鐵蛋白檢測線性圖。
圖5其他適配體對乳鐵蛋白熒光偏振檢測線性圖。
具體實施方式
根據(jù)下述實施例,可以更好地理解本發(fā)明。然而,本領(lǐng)域的技術(shù)人員容易理解,實施例所描述的內(nèi)容僅用于說明本發(fā)明,而不應(yīng)當(dāng)也不會限制權(quán)利要求書中所詳細描述的本發(fā)明。
實施例1:乳鐵蛋白適配體篩選
乳鐵蛋白適配體篩選的具體步驟,包括芯片制備、正負篩過程、PCR擴增等詳細過程,具體如下所述,其中:
文庫:5′-TAMRA-GACAGGCAGGACACCGTAAC-N40-CTGCTACCTCCCTCCTCTTC-3′
TARMA修飾的前向引物:5′-TARMA-GACAGGCAGGACACCGTAAC-3′
生物素化的后向引物:5′Biotin-GAAGAGGAGGGAGGTAGCAG-3′
(1)芯片制備:利首先利光刻掩模與化學(xué)腐蝕相結(jié)合的技術(shù)制作微流控通道模板作為PDMS通道制做磨具;后稱取質(zhì)量比為10:1的PDMS前聚體與固化劑充分混合,抽真空后澆到微流控通道模板上經(jīng)固化后得到PDMS微流控通道;使用點樣儀在玻璃基片點制濃度為5mg/mL的乳鐵蛋白和陰性蛋白微陣列,并對PDMS和點樣后的玻璃基片同時等離子處理,之后緊密貼合共同作為篩選芯片,用于接下來的每輪篩選;篩選準(zhǔn)備:將步驟(1)得到的篩選芯片放入恒溫水浴箱中37℃下孵育蛋白2h;再通入20mg/mlBSA和0.01mM隨機序列短鏈ssDNA(20nt)在37℃條件下封閉1h;之后用150μL,1×PBST溶液清洗正負篩通道;
(2)第一輪篩選:將0.5nmol,125μL原始文庫在95℃加熱5min,并立即在冰上冷凍10s;再用注射泵以2.5μL/min流速將文庫輸進正篩通道,在常溫條件下反應(yīng)50min;之后以15μL/min流速通入150μL,1×PBS緩沖溶液以除去正篩通道中未結(jié)合的ssDNA序列;輕輕撕掉PDMS層,使用Luxscan~10K/A微陣列掃描儀掃描芯片;最后用DPEC水在95℃下加熱5min洗脫乳鐵蛋白結(jié)合的ssDNA序列,所得溶液在50℃條件下高純氮吹干至體積為69μL;
(3)PCR擴增過程:將步驟(2)所得溶液分為體積均為23μL的3份相同溶液,每份依次加入25μL,2×Taq聚合酶,1μL,20μM TAMRA標(biāo)記的前向引物和1μL,20μM生物素化的后向引物,混合均勻后進行PCR擴增;PCR的熱循環(huán)過程如下:94℃5min;循環(huán)94℃30s,60.5℃30s,72℃30s過程10輪,72℃5min終止反應(yīng);該步驟獲得的產(chǎn)物稀釋10倍后作為模板進行再一次擴增:取5μL稀釋后PCR產(chǎn)物與25μL,2×SYBRPremix Ex TaqTM酶,1μL,20μM TAMRA標(biāo)記的前向引物,1μL,20μM生物素化的后向引物以及18μL DPEC水充分混合均勻,PCR擴增每進行一輪便取10μL樣品至微孔板中用BioTek檢測其熒光信號,熒光信號最高者作為最佳輪數(shù),剩余產(chǎn)物均擴增該輪數(shù);
(4)分離純化:將步驟(4)得到的PCR產(chǎn)物與600μL Promega磁珠充分混勻,在搖床上快速搖動1h后除去上清液;再加入25μL,50mM NaOH渦旋5min將磁珠上連接的雙鏈解離;吸取上層清液并依次加入12.5μL 100mM HCl,25μL H2O,62.5μL2×PBSM中和,所得的溶液作為下一輪篩選的次級文庫,其含量約為40pmol;
(5)第二輪篩選:用泵以2.5μL/min流速將文庫輸進負篩通道,在常溫條件下反應(yīng)50min;再用泵以2.5μL/min流速將文庫輸進正篩通道,在常溫條件下反應(yīng)50min;接著以15μL/min流速通入150μL 1×PBS緩沖溶液除去正篩通道中未反應(yīng)的鏈;輕輕撕掉PDMS層,使用Luxscan~10K/A微陣列掃描儀掃描芯片;最后用無核水在95℃下加熱5min洗脫蛋白結(jié)合的鏈,所得溶液在60℃吹干至體積為92μL,留作PCR擴增;
(6)重復(fù)步驟(4)、(5)、(6)至第八輪篩選;
(7)將篩選的第五、六、七輪PCR擴增產(chǎn)物送至上海生工測序,每輪隨機選取120條測序,再用IDT軟件對得到的鏈進行二級結(jié)構(gòu)分析,最終獲得最佳的適配體。
實施例2:熒光偏振法對乳鐵蛋白標(biāo)準(zhǔn)樣品進行檢測:
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N2(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入100μL濃度為25μg/mL的乳鐵蛋白標(biāo)準(zhǔn)樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
實施例3:熒光偏振法反應(yīng)時間優(yōu)化
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N2(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入100μL濃度為25μg/mL的乳鐵蛋白標(biāo)準(zhǔn)樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下分別反應(yīng)5min、10min、15min、20min、25min、30min、35min、40min、45min、50min、55min、60min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
圖1為不同時間條件下熒光偏振信號與空白溶液中熒光偏振信號圖。
實施例4:不同濃度乳鐵蛋白與熒光偏振信號關(guān)系
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N2(堿基序列:CGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCTATACTAC)溶液中分別加入100μL濃度為0.19μg/mL,0.39μg/mL 0.78μg/mL,1.56μg/mL,3.12μg/mL,6.25μg/mL、12.5μg/mL、25μg/mL、50μg/mL的乳鐵蛋白標(biāo)準(zhǔn)樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
(3)通過分析,發(fā)現(xiàn)分析熒光偏振信號隨乳鐵蛋白濃度的對數(shù)值呈線性變化,得到標(biāo)準(zhǔn)曲線,由標(biāo)準(zhǔn)曲線計算得到樣品中乳鐵蛋白的濃度。
圖2為加入不同濃度乳鐵蛋白的熒光偏振值圖,圖d為標(biāo)準(zhǔn)曲線圖(R=0.988)。
實施例5:熒光偏振法對乳鐵蛋白特異性檢測
(1)在五份10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N2(堿基序列:CGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCTATACTAC)溶液中分別將加入100μL25μg/mL的乳鐵蛋白、100μL 500μg/mL α-乳白蛋白、100μL 500μg/mL β-乳球蛋白、100μL 500μg/mL BSA和100μL PBS溶液,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
圖3為該種熒光偏振法對乳鐵蛋白、α-乳白蛋白、β-乳球蛋白、BSA的特異性檢測圖。
實施例6:檢測乳鐵蛋白含量的方法
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N2(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入稀釋25-100倍的牛奶樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
(3)對比標(biāo)準(zhǔn)曲線得到牛奶樣品中乳鐵蛋白的濃度,具體見圖4。
實施例7:檢測乳鐵蛋白含量的方法
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N6(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入稀釋25-100倍的牛奶樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
(3)對比標(biāo)準(zhǔn)曲線得到牛奶樣品中乳鐵蛋白的濃度,具體見圖5(a)。
實施例8:檢測乳鐵蛋白含量的方法
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N14(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入稀釋25-100倍的牛奶樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
(3)對比標(biāo)準(zhǔn)曲線得到牛奶樣品中乳鐵蛋白的濃度,具體見圖5(b)。
實施例9:檢測乳鐵蛋白含量的方法
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N16(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入稀釋25-100倍的牛奶樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
(3)對比標(biāo)準(zhǔn)曲線得到牛奶樣品中乳鐵蛋白的濃度,具體見圖5(c)。
實施例10:檢測乳鐵蛋白含量的方法
(1)在10μL,250nM FITC(異硫氰酸熒光素)標(biāo)記的適配體N31(堿基序列:AGGCAGGACACCGTAACCGGTGCATCTATGGCTACTAGCTTTTCCTGCCT)溶液中加入稀釋25-100倍的牛奶樣品,充分混勻。
(2)將步驟(1)的混合液置于96微孔板中37℃條件下反應(yīng)15min,用BioTeK酶標(biāo)儀直接掃描,激發(fā)波長為480nm,發(fā)射波長為528nm。
(3)對比標(biāo)準(zhǔn)曲線得到牛奶樣品中乳鐵蛋白的濃度,具體見圖5(d)。
本發(fā)明將熒光偏振方法應(yīng)用于乳鐵蛋白的分析檢測中,當(dāng)乳鐵蛋白的濃度在0.78μg/mL~50μg/mL之間,熒光偏振信號強度與乳鐵蛋白濃度的對數(shù)之間具有很好的相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)為0.988。同時,本發(fā)明能快速高通量檢測乳鐵蛋白,不僅可以避免假陽性信號的產(chǎn)生而且可以防止外界環(huán)境的干擾,信號采集方式簡單快速。