本實(shí)用新型涉及生物化學(xué)及分子生物學(xué)領(lǐng)域,具體涉及一種定量檢測試劑盒,適用于各種DNA的定量檢測。
背景技術(shù):
:在分子生物學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行DNA分析時常常需要對DNA進(jìn)行準(zhǔn)確定量。在臨床診斷方面,病毒DNA的定量檢測是臨床診斷的重要依據(jù)。SYBRGreenI是一種結(jié)合于所有dsDNA雙螺旋小溝區(qū)域的具有綠色激發(fā)波長的染料。在游離狀態(tài)下,SYBRGreenI發(fā)出微弱的熒光,但一旦與雙鏈DNA結(jié)合后,熒光大大增強(qiáng)。因此,SYBRGreenI的熒光信號強(qiáng)度與雙鏈DNA的數(shù)量相關(guān),可以根據(jù)熒光信號檢測出PCR體系存在的雙鏈DNA數(shù)量。SYBRGreenI的最大吸收波長約為497nm,發(fā)射波長最大約為520nm。SYBRGreenI核酸凝膠染液是一種高敏感性的熒光染液,可用于檢測瓊脂糖凝膠及聚丙烯酰胺凝膠中的雙鏈DNA和寡核苷酸。當(dāng)染液與核酸結(jié)合后,SYBRGreenI核酸凝膠染液的熒光信號會明顯增強(qiáng),因此經(jīng)SYBRGreenI核酸凝膠染液染色的凝膠顯示出非常好的性價比,沒有背景熒光。目前,常規(guī)利用SYBRGreenI熒光染料檢測DNA含量的方法存在以下方面的不足:1、PCR擴(kuò)增過程中SYBRGreenI熒光染料與DNA結(jié)合的方法存在非特異性擴(kuò)增導(dǎo)致定量不準(zhǔn)確的風(fēng)險;2、SYBRGreenI熒光染料直接作用于樣本存在對樣本含量、檢測儀器靈敏度要求高的問題,檢測成本較高,而且樣本中其他雜質(zhì)也會對檢測結(jié)果造成一定影響,導(dǎo)致定量不準(zhǔn)確。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:針對以上現(xiàn)有技術(shù)問題,本實(shí)用新型的目的在于提供一種定量檢測試劑盒,排出了樣本中其他雜質(zhì)和非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物對最終檢測結(jié)果的影響,更準(zhǔn)確、低成本的完成DNA含量的定量檢測,包括以下步驟:粗濾;瓊脂糖凝膠電泳;DNA回收;SYBRGreenI熒光染色;檢測及結(jié)果分析。該方法利用簡化的DNA回收方法得到高純度的DNA,再通過SYBRGreenI染色和紫外分光光度計(jì)檢測熒光,計(jì)算分析得到DNA濃度。具體技術(shù)方案如下:一種定量檢測試劑盒,包括盒體,支架,第一EP管以及第二EP管,其中,所述盒體內(nèi)設(shè)置支架;所述支架上設(shè)有4-6個管架;所述第一EP管設(shè)置于第一管架上,所述第一EP管底部設(shè)有鉆孔,管內(nèi)設(shè)有定性濾紙;所述第二EP管設(shè)置于第二管架上,所述第二EP管底部設(shè)有鉆孔,管內(nèi)設(shè)有定性濾紙;所述第一EP管為0.5ml或1.5ml容量的EP管,所述第二EP管為0.5ml或1.5ml容量的EP管。還包括盒蓋,所述盒蓋一側(cè)連接至盒體并用于扣合盒體。還包括第三EP管,第四EP管,第五EP管以及第六EP管,分別設(shè)置于支架的第三管架,第四管架,第五管架以及第六管架上。上述定量檢測DNA含量的SYBRGreenI定量檢測試劑盒的檢測方法,包括如下步驟:(1)粗濾;(2)瓊脂糖凝膠電泳;(3)DNA回收;(4)SYBRGreenI熒光染色;(5)檢測;(6)結(jié)果分析。進(jìn)一步地,步驟(1)中包括:(1-1)取待測樣品放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;(1-2)將套好的EP管離心,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體全部進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。進(jìn)一步地,步驟(2)中包括:(2-1)配膠;(2-2)電泳準(zhǔn)備;(2-3)上樣;(2-4)電泳。進(jìn)一步地,步驟(3)中包括:(3-1)將切下來的含目的DNA的膠塊切碎,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;(3-2)將套好的EP管離心,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體定容;(3-3)加入NaAc和無水乙醇,冷凍;沉淀干燥后溶于TE溶液。進(jìn)一步地,步驟(4)中包括:(4-1)加入與DNA復(fù)溶液等體積的稀釋好的SYBRGreenI工作液,混勻;(4-2)放置30分鐘左右。進(jìn)一步地,步驟(5)中包括:(5-1)將染色好的DNA溶液放置到紫外分光光度計(jì)上,260nm波長處分別讀取熒光值A(chǔ)260;(5-2)根據(jù)WdsDNA=A260×50μg/ml公式換算待測樣品中目的DNA含量。進(jìn)一步地,(2-1)配膠:根據(jù)基因組片段大小,配置相應(yīng)濃度的瓊脂糖凝膠;取適量的瓊脂和TAE緩沖液至錐形瓶中,搖勻并用錫紙封口,放入微波爐煮,煮好的凝膠應(yīng)無氣泡、色澤均勻;將煮好的凝膠放入65℃的水浴鍋中,待凝膠冷卻至65℃時,加入適量的SYBRGreenI熒光染料,及時將凝膠倒入裝好的干凈電泳模具中;待凝膠完全凝固后,小心的將梳子拔出;(2-2)電泳準(zhǔn)備:把凝膠連同膠托一起放入電泳槽正中央,膠孔的方向朝向負(fù)極,往電泳槽中倒入一定量的TAE緩沖液至剛好將凝膠淹沒;(2-3)上樣:將樣品、6×溴酚藍(lán)按5:1的比例混勻,輕甩后按照規(guī)定的順序上樣;(2-4)電泳:上樣后,蓋上電泳槽蓋,接通電泳儀和電泳槽,設(shè)置電泳參數(shù):120V30min。本實(shí)用新型方法操作簡便、成本低廉、準(zhǔn)確度高。附圖說明圖1為已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管示意圖圖2為套入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5mlEP的1.5ml的EP管示意圖圖3為定量檢測DNA含量的SYBRGreenI定量檢測試劑盒具體實(shí)施方式下面根據(jù)附圖對本實(shí)用新型進(jìn)行詳細(xì)描述,其為本實(shí)用新型多種實(shí)施方式中的一種優(yōu)選實(shí)施例。在一個優(yōu)選實(shí)施例中,一種定量檢測DNA含量的SYBRGreenI定量檢測試劑盒及其檢測方法,進(jìn)一步地包括以下步驟:(1)粗濾:①取待測樣品100μl,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;②將套好的EP管在4℃10000rpm下離心10min,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體全部進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳;(2)瓊脂糖凝膠電泳:①配膠:根據(jù)基因組片段大小,配置相應(yīng)濃度的瓊脂糖凝膠。取適量的瓊脂和TAE緩沖液至錐形瓶中,搖勻并用錫紙封口,放入微波爐煮,煮好的凝膠應(yīng)無氣泡、色澤均勻。將煮好的凝膠放入65℃的水浴鍋中,待凝膠冷卻至65℃時,加入適量的SYBRGreenI熒光染料,及時將凝膠倒入裝好的干凈電泳模具中。待凝膠完全凝固后,小心的將梳子拔出;②電泳準(zhǔn)備:把凝膠連同膠托一起放入電泳槽正中央,膠孔的方向朝向負(fù)極,往電泳槽中倒入一定量的TAE緩沖液至剛好將凝膠淹沒;③上樣:將樣品、6×溴酚藍(lán)按5:1的比例混勻,輕甩后按照規(guī)定的順序上樣;④電泳:上樣后,蓋上電泳槽蓋,接通電泳儀和電泳槽,設(shè)置電泳參數(shù):120V30min;(3)DNA回收:①將切下來的含目的DNA的膠塊切碎,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;②將套好的EP管在4℃10000rpm下離心10min,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體用移液槍定容;③加入1/10體積的3mol/LNaAc(pH5.5)和2倍體積的無水乙醇,在-20℃冷凍30min以上。沉淀干燥后溶于20μlTE溶液(pH7.8)。(4)SYBRGreenI熒光染色:①加入與DNA復(fù)溶液等體積的稀釋好的SYBRGreenI工作液(稀釋比例根據(jù)SYBRGreenI的說明書),混勻;②放置30分鐘。(5)檢測及結(jié)果分析:①將染色好的DNA溶液放置到紫外分光光度計(jì)上,260nm波長處分別讀取熒光值A(chǔ)260;②根據(jù)WdsDNA=A260×50μg/ml公式換算待測樣品中目的DNA含量。粗濾步驟①取待測樣品100μl,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;DNA回收步驟①將切下來的含目的DNA的膠塊切碎,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;DNA回收步驟②將套好的EP管在4℃10000rpm下離心5~10min,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體用移液槍定容;DNA回收步驟③加入1/10體積的3mol/LNaAc(pH5.5)和2倍體積的無水乙醇,在-20℃冷凍30min以上。沉淀干燥后溶于20μlTE溶液(pH7.8)。在另一個優(yōu)選實(shí)施例中,一種SYBRGreenI熒光染料定量檢測DNA含量的方法,通過粗濾、瓊脂糖凝膠電泳、DNA回收、SYBRGreenI熒光染色、檢測及結(jié)果分析完成待測樣品DNA的定量檢測,具體包括以下步驟:1、粗濾:(1)取待測樣品100μl,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;(2)將套好的EP管在4℃10000rpm下離心5~10min,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體全部進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳;2、瓊脂糖凝膠電泳:(1)配膠:根據(jù)基因組片段大小,配置相應(yīng)濃度的瓊脂糖凝膠。取適量的瓊脂和TAE緩沖液至錐形瓶中,搖勻并用錫紙封口,放入微波爐煮,煮好的凝膠應(yīng)無氣泡、色澤均勻。將煮好的凝膠放入65℃的水浴鍋中,待凝膠冷卻至65℃時,加入適量的SYBRGreenI熒光染料,及時將凝膠倒入裝好的干凈電泳模具中。待凝膠完全凝固后,小心的將梳子拔出;(2)電泳準(zhǔn)備:把凝膠連同膠托一起放入電泳槽正中央,膠孔的方向朝向負(fù)極,往電泳槽中倒入一定量的TAE緩沖液至剛好將凝膠淹沒;(3)上樣:將樣品、6×溴酚藍(lán)按5:1的比例混勻,輕甩后按照規(guī)定的順序上樣;(4)電泳:上樣后,蓋上電泳槽蓋,接通電泳儀和電泳槽,設(shè)置電泳參數(shù):120V30min;3、DNA回收:(1)將切下來的含目的DNA的膠塊切碎,放入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管中,再將這個0.5ml的EP管套入一個1.5ml的EP管中;(2)將套好的EP管在4℃10000rpm下離心5~10min,去掉0.5ml的EP管,并將1.5ml的EP管得到液體用移液槍定容;(3)加入1/10體積的3mol/LNaAc(pH5.5)和2倍體積的無水乙醇,在-20℃冷凍30min以上。沉淀干燥后溶于20μlTE溶液(pH7.8)。4、SYBRGreenI熒光染色:(1)加入與DNA復(fù)溶液等體積的稀釋好的SYBRGreenI工作液(稀釋比例根據(jù)SYBRGreenI的說明書),混勻;(2)放置30分鐘。5、檢測及結(jié)果分析:(1)將染色好的DNA溶液放置到紫外分光光度計(jì)上,260nm波長處分別讀取熒光值A(chǔ)260;(2)根據(jù)WdsDNA=A260×50μg/ml公式換算待測樣品中目的DNA含量。應(yīng)用本實(shí)用新型檢測待測樣品A中基因片段長度約1kb的DNA含量,同時設(shè)定一組已知DNA濃度(30ng/μl)的標(biāo)準(zhǔn)對照,經(jīng)過粗濾和瓊脂糖凝膠電泳,再經(jīng)過DNA回收、SYBRGreenI熒光染色和檢測及結(jié)果分析,測得結(jié)果如表2:樣本名稱A260DNA含量待測樣品A0.0170.85ng/μl標(biāo)準(zhǔn)對照0.59829.9ng/μl表2如圖1所示,該EP管包含已在底部鉆好孔的0.5ml的EP21和定性濾紙22。如圖2所示,該EP管包含已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管31和1.5ml的EP管32。如圖3所示,該試劑盒包括圖1所示的已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5ml的EP管41和圖2所示的套入已在底部鉆好孔并放入小塊定性濾紙的0.5mlEP的1.5ml的EP管42。當(dāng)前第1頁1 2 3