本發(fā)明涉及熒光生物傳感器,尤其是涉及一種檢測(cè)核酸外切酶i(exoi)的熒光傳感方法。
背景技術(shù):
核酸外切酶(exonucleases)是一類從多核苷酸鏈的一頭開始按序催化降解核苷酸的酶。核酸外切酶分為:核酸外切酶i(exoi)和核酸外切酶iii(exoiii)。exoi是一種僅能從單鏈dna(ssdna)的3’端到5’端,按照堿基順序,逐個(gè)催化水解堿基間的磷酸二酯鍵,逐漸降解ssdna的酶。exoi水解ssdna后,最終產(chǎn)物是逐個(gè)脫氧核糖核苷酸。exoi對(duì)ssdna的堿基序列是沒有要求的,不具有水解雙鏈dna的能力。核酸外切酶在生物學(xué)的很多過程中起著重要的作用,如dna復(fù)制、重組、修復(fù)等。其中最重要的功能就是維持生物體內(nèi)的基因突變幾率,從而維持遺傳信息的穩(wěn)定性。近年來,相繼報(bào)道了exoiii的定量檢測(cè),然而exoi的研究還很少。
目前對(duì)exoi的活性檢測(cè)普遍缺乏定量描述,因?yàn)閭鹘y(tǒng)檢測(cè)exoi活性的方法是將標(biāo)準(zhǔn)的dna與核酸外切酶反應(yīng),凝膠電泳觀察酶切效果,這種方法最多給出半定量結(jié)果,而且操作麻煩、重現(xiàn)性差,更不能實(shí)時(shí)給出不同條件下的酶活性變化。因此,發(fā)展一種快速、準(zhǔn)確、靈敏的定量檢測(cè)exoi活性的方法,將有重要價(jià)值。
銥配合物具有發(fā)光效率高、較大的stokes位移、發(fā)光顏色可以通過改變配體結(jié)構(gòu)進(jìn)行調(diào)節(jié)以及良好的光穩(wěn)定性等優(yōu)點(diǎn)而成為研究的熱點(diǎn)。根據(jù)報(bào)道,銥配合物在生物傳感器方面的應(yīng)用越來越廣泛。陽(yáng)離子共軛聚合物(ccp)作為一種新型的水溶性熒光分子,具有摩爾吸光系數(shù)大、熒光量子產(chǎn)率高等優(yōu)點(diǎn)。同時(shí),共軛聚合物具有分子導(dǎo)線的功能,能夠?qū)崿F(xiàn)熒光信號(hào)的放大。銥配合物和ccp可以發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(fret)現(xiàn)象。
本發(fā)明基于銥配合物和ccp的fret現(xiàn)象,構(gòu)建一種簡(jiǎn)單、高靈敏、快速的分析傳感方法,用于定量檢測(cè)exoi,過程及其簡(jiǎn)單,為臨床應(yīng)用提供了一種很有前景的檢測(cè)手段。目前,基于銥配合物和ccp的fret現(xiàn)象檢測(cè)exoi活性的熒光傳感器尚未見報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種特異性好、靈敏度高、檢測(cè)速度快、結(jié)果準(zhǔn)確可靠的檢測(cè)exoi的熒光傳感方法。
本發(fā)明解決上述技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案為:一種檢測(cè)exoi的熒光傳感方法,具體步驟如下:
(1)將85~95μl濃度為3~4μmccp與0.5~2μl濃度為0.5~2mm銥配合物混合,然后加入相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,得到100μl用于檢測(cè)exoi的基于ccp與銥配合物fret效應(yīng)的熒光傳感器體系。檢測(cè)熒光強(qiáng)度,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(2)加入1~3μl5~15μm的ssdna到步驟(1)中的體系,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(3)不同濃度的exoi加入到步驟(2)中,然后加入相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,30~40℃下溫育25~35min,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值,獲得一系列不同濃度的exoi對(duì)應(yīng)的熒光強(qiáng)度比值,建立熒光強(qiáng)度比值與exoi濃度之間的定量關(guān)系;根據(jù)這個(gè)定量關(guān)系可以檢測(cè)樣品中exoi的活性。
利用上述基于銥配合物和ccp的熒光生物傳感器檢測(cè)exoi的方法,進(jìn)行熒光分析,設(shè)置狹縫寬度為:10nm,激發(fā)波長(zhǎng)是380nm,掃描電壓是700v,檢測(cè)ccp/ssdna/銥配合物體系對(duì)不同活性的exoi的檢測(cè)熒光強(qiáng)度,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度(i415)與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值(i530)。
發(fā)明原理:本發(fā)明基于ssdna干擾ccp與銥配合物之間的fret發(fā)展了一種無標(biāo)記、簡(jiǎn)單便利的傳感器用于檢測(cè)exoi的活性。由于ccp帶正電,與帶有負(fù)電的銥配合物之間通過靜電作用發(fā)生fret,加入ssdna時(shí),二者的熒光強(qiáng)度比值減少;當(dāng)有exoi存在時(shí),由于exoi水解ssdna,使得二者的熒光強(qiáng)度比值增大。exoi濃度越大,二者的熒光強(qiáng)度比值i530/i415越大,熒光強(qiáng)度比值與exoi濃度的對(duì)數(shù)之間呈線性關(guān)系。
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)在于:本發(fā)明構(gòu)建了一種檢測(cè)exoi的熒光傳感方法。首先,利用ssdna干擾ccp與銥配合物之間的fret。其次,exoi存在時(shí),利用exoi水解ssdna,使得i530/i415增大。exoi濃度越大,二者的熒光強(qiáng)度比值i530/i415越大。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,熒光強(qiáng)度比值與exoi濃度的對(duì)數(shù)之間呈線性關(guān)系,實(shí)現(xiàn)對(duì)exoi的檢測(cè)。其優(yōu)點(diǎn)在于:
(1)高靈敏度。在0.01-2u/ml濃度范圍內(nèi),i530/i415值與exoi濃度(c)的對(duì)數(shù)之間呈現(xiàn)良好的線性關(guān)系,線性方程為i530/i415=1.29+0.45×1gc(u/ml),線性相關(guān)系數(shù)r2=0.9926,表示曲線具有很好的擬合度,檢測(cè)限為0.01u/ml。這些結(jié)果表明,該傳感器對(duì)exoi的檢測(cè)具有較低檢測(cè)限和較高靈敏度。
(2)高特異性。核酸外切酶(exoiii)、限制內(nèi)切酶(hindiii)、核酸外切酶(λ-exo)、限制內(nèi)切酶(ecori)作為對(duì)照物質(zhì),均為0.1u/ml,檢測(cè)均無干擾。
(3)結(jié)果準(zhǔn)確。在10%尿液和10%血清環(huán)境中,回收率均在90%~110%之間。
(4)制備與檢測(cè)方法試劑用量少、檢測(cè)速度快、成本低。本發(fā)明只需消耗少量材料和試劑就可實(shí)現(xiàn)對(duì)exoi的高靈敏檢測(cè)。
綜上所述,本發(fā)明是基于ssdna干擾ccp與銥配合物之間的fret構(gòu)建一種無標(biāo)記、簡(jiǎn)單便利的傳感器用于檢測(cè)exoi的活性,具有靈敏度高、選擇性好、操作簡(jiǎn)單、分析快速、易于操作等優(yōu)點(diǎn),可以實(shí)現(xiàn)低濃度exoi的檢測(cè),具有良好的應(yīng)用前景。
附圖說明
圖1為本發(fā)明傳感器的可行性實(shí)驗(yàn)圖;
圖2為本發(fā)明傳感器對(duì)不同濃度exoi的熒光響應(yīng)圖;
圖3為本發(fā)明傳感器對(duì)不同濃度exoi的校準(zhǔn)曲線圖;
圖4為本發(fā)明傳感器對(duì)exoi的選擇性實(shí)驗(yàn)圖;
圖5為本發(fā)明傳感器對(duì)exoi的抗干擾實(shí)驗(yàn)圖。
具體實(shí)施方式
以下結(jié)合附圖實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)描述。
一、具體實(shí)施例
實(shí)施例1
本發(fā)明解決上述技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案為:一種檢測(cè)exoi的熒光傳感方法,具體步驟如下:
(1)將90μl濃度為3.28μmccp與1μl濃度為1mm銥配合物混合,然后加入相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,得到100μl用于檢測(cè)exoi的基于ccp與銥配合物fret效應(yīng)的熒光傳感器體系。檢測(cè)熒光強(qiáng)度,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(2)加入2μl10μm的ssdna到步驟(1)中的體系,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(3)不同濃度的exoi加入到步驟(2)中,然后相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,37℃下溫育30min,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值,獲得一系列不同濃度的exoi對(duì)應(yīng)的熒光強(qiáng)度比值,建立熒光強(qiáng)度比值與exoi濃度之間的定量關(guān)系;根據(jù)這個(gè)定量關(guān)系可以檢測(cè)樣品中exoi的活性。
實(shí)施例2
本發(fā)明解決上述技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案為:一種檢測(cè)exoi的熒光傳感方法,具體步驟如下:
(1)將85μl濃度為4μmccp與2μl濃度為1mm銥配合物混合,然后加入相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,得到100μl用于檢測(cè)exoi的基于ccp與銥配合物fret效應(yīng)的熒光傳感器體系。檢測(cè)熒光強(qiáng)度,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(2)加入1μl15μm的ssdna到步驟(1)中的體系,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(3)不同濃度的exoi加入到步驟(2)中,然后相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,34℃下溫育30min,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值,獲得一系列不同濃度的exoi對(duì)應(yīng)的熒光強(qiáng)度比值,建立熒光強(qiáng)度比值與exoi濃度之間的定量關(guān)系;根據(jù)這個(gè)定量關(guān)系可以檢測(cè)樣品中exoi的活性。
實(shí)施例3
本發(fā)明解決上述技術(shù)問題所采用的技術(shù)方案為:一種檢測(cè)exoi的熒光傳感方法,具體步驟如下:
(1)將95μl濃度為3μmccp與0.5μl濃度為2mm銥配合物混合,然后加入相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,得到100μl用于檢測(cè)exoi的基于ccp與銥配合物fret效應(yīng)的熒光傳感器體系。檢測(cè)熒光強(qiáng)度,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(2)加入3μl5μm的ssdna到步驟(1)中的體系,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值。
(3)不同濃度的exoi加入到步驟(2)中,然后相應(yīng)體積的10×exoi緩沖液,32℃下溫育30min,檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,計(jì)算ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值,獲得一系列不同濃度的exoi對(duì)應(yīng)的熒光強(qiáng)度比值,建立熒光強(qiáng)度比值與exoi濃度之間的定量關(guān)系;根據(jù)這個(gè)定量關(guān)系可以檢測(cè)樣品中exoi的活性。
二、可行性實(shí)驗(yàn)
測(cè)定ccp/銥配合物體系的熒光強(qiáng)度;加入66個(gè)堿基的ssdna組成ccp/ssdna/銥配合物體系,測(cè)定其熒光強(qiáng)度;加入exoi(10u/ml,1μl),37℃下培養(yǎng)30min,測(cè)定體系的熒光強(qiáng)度。另外在只有ccp/銥配合物的體系中加入加入exoi(10u/ml,1μl),作為對(duì)照實(shí)驗(yàn)。同時(shí)利用化學(xué)發(fā)光熒光成像系得到各溶液的熒光圖像(具體實(shí)施示例1)。當(dāng)體系中存在ccp和銥配合物時(shí)發(fā)生高效的fret;加入ssdna后,fret效率急劇減??;由于exoi存在時(shí)水解ssdna,530nm處的熒光強(qiáng)度增強(qiáng),體系中的ccp和銥配合物重新發(fā)生fret(如圖1)。所以我們?cè)O(shè)計(jì)的基于ccp和銥配合物fret效應(yīng)的熒光傳感器可以檢測(cè)exoi的活性,而且可定量檢測(cè)exoi的濃度,有一定的應(yīng)用潛能。
三、exoi檢測(cè)應(yīng)用
1、利用上述具體實(shí)施例1制備的熒光生物傳感器檢測(cè)exoi的方法
利用熒光分析,設(shè)置狹縫寬度為:10nm,激發(fā)波長(zhǎng)是380nm,掃描電壓是700v,檢測(cè)ccp/ssdna/銥配合物體系中ccp(415nm)的熒光強(qiáng)度與銥配合物(530nm)的熒光強(qiáng)度比值i530/i415對(duì)不同濃度exoi的定量關(guān)系,根據(jù)兩者之間的定量關(guān)系,確定待測(cè)樣品中exoi的含量(具體實(shí)施示例1)。圖2在530nm處的熒光強(qiáng)度隨exoi濃度的增加而增強(qiáng),這就意味著ccp與銥配合物重新發(fā)生高效的fret,因此fret效率增大。
2、靈敏度試驗(yàn)
利用熒光分析,設(shè)置狹縫寬度為:10nm,激發(fā)波長(zhǎng)是380nm,掃描電壓是700v,上述具體實(shí)施例1制備的ccp/ssdna/銥配合物體系的熒光強(qiáng)度比值i530/i415,exoi濃度的范圍為0~2u/ml(具體實(shí)施示例1)。試驗(yàn)結(jié)果說明,如圖3所示,說明隨著exoi濃度的增大,i530/i415越明顯;傳感器i530/i415對(duì)exoi濃度的對(duì)數(shù)的線性相關(guān)方程為i530/i415=1.29+0.45×igc(u/ml),r2=0.9926,線性范圍為0.01~2.0u/ml,根據(jù)s/n計(jì)算得知,檢測(cè)限為0.01u/ml。說明傳感器對(duì)exoi可實(shí)現(xiàn)高靈敏度檢測(cè)。
3、特異性實(shí)驗(yàn)
選擇性實(shí)驗(yàn)與抗干擾實(shí)驗(yàn)如圖4和5所示,其中exoi及其他酶的濃度均為0.1u/ml,所用到的其他酶如下:核酸外切酶(exoiii)、限制內(nèi)切酶(hindiii)、核酸外切酶(λ-exo)、限制內(nèi)切酶(ecori)。
(1)選擇性實(shí)驗(yàn)
利用熒光分析,設(shè)置狹縫寬度為:10nm,激發(fā)波長(zhǎng)是380nm,掃描電壓是700v,上述具體實(shí)施例1制備的ccp/ssdna/銥配合物體系分別檢測(cè)濃度為0.1u/ml的核酸外切酶(exoiii)、限制內(nèi)切酶(hindiii)、核酸外切酶(λ-exo)、限制內(nèi)切酶(ecori)。如圖4,與exoi對(duì)比,傳感器對(duì)其他酶的響應(yīng)非常小,基本接近空白信號(hào),說明傳感器對(duì)于exoi的檢測(cè)有很好的選擇性。
(2)抗干擾實(shí)驗(yàn),
利用熒光分析,設(shè)置狹縫寬度為:10nm,激發(fā)波長(zhǎng)是380nm,掃描電壓是700v,上述具體實(shí)施例1制備的ccp/ssdna/銥配合物體系,在0.1u/ml存在下分別檢測(cè)濃度為0.1u/ml的核酸外切酶(exoiii)、限制內(nèi)切酶(hindiii)、核酸外切酶(λ-exo)、限制內(nèi)切酶(ecori),比較傳感器對(duì)四個(gè)體系及僅exoi存在時(shí)的熒光響應(yīng),如圖5,觀察到i530/i415的大小與僅有exoi存在時(shí)的i530/i415基本沒有差異,說明傳感器實(shí)現(xiàn)了對(duì)exoi的特異性檢測(cè)。
當(dāng)然,上述說明并非對(duì)本發(fā)明的限制,本發(fā)明也并不限于上述舉例。本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員在本發(fā)明的實(shí)質(zhì)范圍內(nèi)做出的變化、改型、添加或替換,也應(yīng)屬于本發(fā)明保護(hù)范圍。