架構(gòu)的示意圖；
[0031]圖4為根據(jù)本發(fā)明一個(gè)實(shí)施例的基因測(cè)序儀的控制方法的流程圖；
[0032]圖5為根據(jù)本發(fā)明一個(gè)具體實(shí)施例的基因測(cè)序儀的控制裝置對(duì)多畫(huà)幅基因圖片采集過(guò)程的控制流程圖。
【具體實(shí)施方式】
[0033]下面詳細(xì)描述本發(fā)明的實(shí)施例，所述實(shí)施例的示例在附圖中示出，其中自始至終相同或類(lèi)似的標(biāo)號(hào)表示相同或類(lèi)似的元件或具有相同或類(lèi)似功能的元件。下面通過(guò)參考附圖描述的實(shí)施例是示例性的，旨在用于解釋本發(fā)明，而不能理解為對(duì)本發(fā)明的限制。
[0034]目前，基因測(cè)序儀中的控制器架構(gòu)會(huì)導(dǎo)致基因測(cè)序的流程時(shí)間過(guò)長(zhǎng)，基因測(cè)序儀的通量過(guò)低。
[0035]舉例來(lái)說(shuō)，圖1為相關(guān)技術(shù)中基因測(cè)序儀中的控制器架構(gòu)的示意圖。如圖1所示，其中，I’為PC控制器，2’為RS232/USB通信接口，3’為嵌入式控制器，4’為激光器單元I/O接口，5’為相機(jī)單元USB接口，6’為激光器單元，7’為相機(jī)單元，8’為液路單元，9’為運(yùn)動(dòng)平臺(tái)單元，10’為液路單元RS232接口，11’為運(yùn)動(dòng)平臺(tái)單元RS232接口。
[0036]如圖1所示的基因測(cè)序儀的控制器架構(gòu)在測(cè)序過(guò)程中，PC控制器I’需要依據(jù)UI (User Interface，用戶界面)設(shè)置的參數(shù)對(duì)測(cè)序流程進(jìn)行控制。嵌入式控制器2’需要通過(guò)RS233或USB接口從PC控制器I’讀取控制指令，并進(jìn)行解析后對(duì)相應(yīng)的單元進(jìn)行控制，需要進(jìn)行多次通信，導(dǎo)致通信延遲，各個(gè)單元難以快速響應(yīng)。另外，各個(gè)器件之間的通信主要是通過(guò)RS232串口進(jìn)行數(shù)據(jù)交互，通信時(shí)間以及狀態(tài)查詢時(shí)間過(guò)長(zhǎng)，尤其是在測(cè)序過(guò)程中尋找大量重復(fù)執(zhí)行的步驟，這無(wú)疑會(huì)導(dǎo)致整個(gè)測(cè)序時(shí)間過(guò)長(zhǎng)。
[0037]因此，為了降低基因測(cè)序過(guò)程的時(shí)間，提高基因測(cè)序儀的通量，本發(fā)明提出一種基因測(cè)序儀基因測(cè)序儀的控制裝置、方法和基因測(cè)序儀。
[0038]下面參考附圖描述根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的基因測(cè)序儀的控制裝置、方法和基因測(cè)序儀。
[0039]圖2為根據(jù)本發(fā)明一個(gè)實(shí)施例的基因測(cè)序儀的控制裝置的結(jié)構(gòu)示意圖。
[0040]如圖2所示，該基因測(cè)序儀的控制裝置，包括:第一控制器10、隨機(jī)存儲(chǔ)器20和第二控制器30。
[0041]具體地，第一控制器10用于發(fā)送初始化指令。
[0042]在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例中，初始化指令包括初始化參數(shù)，用于對(duì)基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置。第一控制器10可將初始化指令發(fā)送至第二控制器30，以通過(guò)第二控制器30對(duì)初始化指令進(jìn)行基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置。
[0043]在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例中，第一控制器10可以是PC控制器。
[0044]隨機(jī)存儲(chǔ)器20用于存儲(chǔ)測(cè)序流程控制信息。
[0045]其中，測(cè)序流程信息可包括基因測(cè)序過(guò)程中的各個(gè)控制參數(shù)、控制條件等，可為預(yù)先設(shè)定好的，并預(yù)先存儲(chǔ)在隨機(jī)存儲(chǔ)器20中。具體地，舉例來(lái)說(shuō)，用戶可通過(guò)基因測(cè)序儀的UI界面設(shè)置好測(cè)序流程控制信息，并將設(shè)置好的測(cè)序流程控制信息存儲(chǔ)在隨機(jī)存儲(chǔ)器20中。
[0046]應(yīng)當(dāng)理解，本發(fā)明對(duì)隨機(jī)存儲(chǔ)器的類(lèi)型不做限定。舉例來(lái)說(shuō)，隨機(jī)存儲(chǔ)器的類(lèi)型可以是 RAM (Rand Access Memory 隨機(jī)隨機(jī)存儲(chǔ)器)、SRAM (Static RAM)或 DRAM (DynamicRAM)等。
[0047]第二控制器30與第一控制器10和隨機(jī)存儲(chǔ)器20分別相連，第二控制器30用于接收初始化指令，并根據(jù)初始化指令對(duì)基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置，以及從隨機(jī)存儲(chǔ)器20讀取測(cè)序流程控制信息，并根據(jù)測(cè)序流程控制信息控制基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件工作。
[0048]在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例中，第二控制器30中具有專(zhuān)用電壓轉(zhuǎn)換電路，可實(shí)現(xiàn)對(duì)基因測(cè)序儀中各個(gè)器件的電壓支持，提高系統(tǒng)集成度，簡(jiǎn)化了基因測(cè)序儀的結(jié)構(gòu)。
[0049]在本發(fā)明的實(shí)施例中，第二控制器30在接收到初始化指令后，可對(duì)初始化指令進(jìn)行解析，并根據(jù)解析結(jié)果中的初始化參數(shù)對(duì)基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置。以運(yùn)動(dòng)平臺(tái)單元為例，初始化配置可包括對(duì)移動(dòng)誤差、速度設(shè)置、運(yùn)動(dòng)模式設(shè)置、加速度設(shè)置等參數(shù)的設(shè)置。在對(duì)基因測(cè)序儀的各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置后，第二控制器30可監(jiān)測(cè)基因測(cè)序儀中各個(gè)器件的工作狀態(tài)，并根據(jù)檢測(cè)到的工作狀態(tài)從隨機(jī)存儲(chǔ)器20讀取測(cè)序流程控制信息，并根據(jù)測(cè)序流程控制信息中的控制參數(shù)對(duì)基因測(cè)序儀中各個(gè)器件進(jìn)行控制。
[0050]在本發(fā)明的實(shí)施例中，第二控制器20可通過(guò)地址總線、數(shù)據(jù)總線以及用于開(kāi)啟隨機(jī)存儲(chǔ)器20的數(shù)據(jù)讀取功能的使能控制器與隨機(jī)存儲(chǔ)器20相連。由此，在基因測(cè)序的過(guò)程中，第二控制器可從隨機(jī)存儲(chǔ)器20中讀取預(yù)先存儲(chǔ)的測(cè)序流程信息，并且隨機(jī)存儲(chǔ)器20的讀取速度更快，因而，相對(duì)于相關(guān)技術(shù)中來(lái)說(shuō)，減少了第二控制器30與第一控制器10的交互次數(shù)，而通過(guò)與讀取效率更高的隨機(jī)存儲(chǔ)器20進(jìn)行交互，大大降低了基因測(cè)序過(guò)程的時(shí)間，尤其是其中生物芯片的多畫(huà)幅基因圖片采集過(guò)程的時(shí)間，從而提高了基因測(cè)序儀的通量。
[0051]在本發(fā)明的實(shí)施例中，為保證基因測(cè)序過(guò)程的精度以及基因圖像信息的準(zhǔn)確性，第二控制器30可通過(guò)狀態(tài)反饋控制方式對(duì)基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件進(jìn)行狀態(tài)檢測(cè)和精密控制。具體地，在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例中，第二控制器30具有第一類(lèi)通信接口和第二類(lèi)通信接口。其中，第一類(lèi)通信接口可為串行接口，第二類(lèi)通信接口可為I/o接口。從而可通過(guò)第一類(lèi)通信接口與第二類(lèi)通信接口接收各器件的狀態(tài)反饋信息。
[0052]第二控制器30可通過(guò)第一類(lèi)通信接口接收初始化指令，并在對(duì)初始化指令解析后，根據(jù)解析結(jié)果通過(guò)第一類(lèi)通信接口對(duì)基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置。具體地，在對(duì)基因測(cè)序儀中各個(gè)器件進(jìn)行初始化配置時(shí)，第二控制器30可通過(guò)第一類(lèi)通信接口向各個(gè)器件分別發(fā)送狀態(tài)查詢命令，并對(duì)各個(gè)器件返回的命令進(jìn)行判斷，以確定是否完成初始化配置。
[0053]第二控制器30可通過(guò)第二類(lèi)通信接口與基因測(cè)序儀中各個(gè)器件相連，特別是在基因圖像采集過(guò)程中需要多次重復(fù)進(jìn)行操作的液路單元、相機(jī)單元、運(yùn)動(dòng)平臺(tái)單元以及激光器單元等器件，可通過(guò)第二類(lèi)通信接口實(shí)時(shí)快速地監(jiān)測(cè)基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件的工作狀態(tài)，并可通過(guò)第二類(lèi)通信接口向基因測(cè)序儀中的各個(gè)器件發(fā)送控制指令，實(shí)現(xiàn)快速控制。在通過(guò)第二類(lèi)通信接口對(duì)基因測(cè)序儀中各個(gè)器件進(jìn)行控制時(shí)，第二控制器30可通過(guò)第二類(lèi)通信接口與外圍驅(qū)動(dòng)電路完成各部件TTL(晶體管-晶體管邏輯電平)脈沖控制與TTL脈沖狀態(tài)監(jiān)控。通過(guò)微秒級(jí)響應(yīng)速的TTL脈沖信號(hào)度能夠使各個(gè)器件快速響應(yīng)。相較于相關(guān)技術(shù)中通過(guò)串口進(jìn)行通信中，1Bit的數(shù)據(jù)量至少需要幾十乃至上百微秒級(jí)，通過(guò)第二類(lèi)通信接口的TTL脈沖進(jìn)行狀態(tài)監(jiān)測(cè)和控制，縮短了每次控制操作的通信時(shí)間，尤其是對(duì)于重復(fù)執(zhí)行的操作，多次重復(fù)之后通信時(shí)間的縮短則更為顯著，大大減少了基因測(cè)序過(guò)程所需的時(shí)間，從而提高了基因測(cè)序儀的通量。
[0054]在本發(fā)明的實(shí)施例中，由于在基因測(cè)序中，多畫(huà)幅基因圖片的采集過(guò)程需要對(duì)液路單元、相機(jī)單元、運(yùn)動(dòng)平臺(tái)單元以及激光器單元等多次控制，因此，下面以液路單元、相機(jī)單元、運(yùn)動(dòng)平臺(tái)單元以及激光器單元為例進(jìn)行說(shuō)明。
[0055]具體地，第二控制器30可通過(guò)4個(gè)第二類(lèi)通信接口與相機(jī)單元進(jìn)行連接。其中，I個(gè)第二類(lèi)通信接口與相機(jī)單元的使能端相連接，I個(gè)第二類(lèi)通信接口與相機(jī)單元的拍照觸發(fā)端連接，I個(gè)第二類(lèi)通信接口與相機(jī)單元的狀態(tài)端連接，I個(gè)第二類(lèi)通信接口與相機(jī)單元的曝光時(shí)間控制端連接。
[0056]第二控制器30可通過(guò)4個(gè)第二類(lèi)通信接口分別與兩個(gè)激光器模塊進(jìn)行連接。其中，2個(gè)第二類(lèi)通信接口分別與2個(gè)激光器的使能觸發(fā)端相連接，2個(gè)第二類(lèi)通信接口輸出PffM(Pulse Width Modulat1n，脈沖寬度調(diào)制)波，并通過(guò)低通濾波電路產(chǎn)生直流信號(hào)分別對(duì)2個(gè)激光器進(jìn)行輸出功率調(diào)節(jié)，從而分別控制兩個(gè)激光器的光照強(qiáng)度。
[0057