本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,涉及一種基于證據(jù)的胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的篩選方法。
背景技術(shù):
胃癌是最常見(jiàn)的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一,在我國(guó)和全球發(fā)病率及死亡率均居惡性腫瘤前列。根據(jù)GLOBOCAN的統(tǒng)計(jì),2008年,全球胃癌新增發(fā)病98.9萬(wàn)例,中國(guó)為46.3萬(wàn)例,占46.8%。胃癌死亡率僅次于肺癌居第二位,每年死亡人數(shù)約73.7萬(wàn),中國(guó)為35.2萬(wàn),占47.8%。我國(guó),胃癌死亡率在惡性腫瘤中排名第三,僅次于肺癌和肝癌,死亡率為24.71/10萬(wàn),占所有因癌癥死亡人數(shù)的18.3%,其中男性死亡率(32.46/10萬(wàn))明顯高于女性(16.59/10萬(wàn)),農(nóng)村高于城市。近年來(lái),胃癌的發(fā)病率和死亡率有輕微的下降,然而,胃癌的發(fā)病逐漸年輕化,我國(guó)青年人胃癌占全部胃癌總數(shù)的比例由1.7%上升到3.3%。近年來(lái),隨著胃癌診斷技術(shù)的不斷發(fā)展,胃癌的病因?qū)W研究和以手術(shù)切除、放射治療、化學(xué)藥物和靶向藥物治療為主的綜合治療取得了一定進(jìn)展,早期胃癌的總生存時(shí)間顯著提高,如果能夠在胃癌病變僅限于黏膜層時(shí)發(fā)現(xiàn)病變,5年的生存率可達(dá)到95%。但胃癌患者早期常缺乏特異的臨床癥狀和體征,我國(guó)早期胃癌的診斷率還不到10%,導(dǎo)致5年生存率在20%~50%。許多因素與胃癌的預(yù)后有關(guān),如腫瘤的發(fā)生部位、組織學(xué)分級(jí)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和血管侵犯等。目前判斷胃癌預(yù)后的方法,主要還是依靠傳統(tǒng)的局部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和TNM分期方法,但臨床中的許多問(wèn)題無(wú)法通過(guò)傳統(tǒng)的預(yù)后方法解決,如相同的TNM分期且接受相同治療的胃癌患者,其預(yù)后往往有很大的差異。個(gè)體化差異與預(yù)后及療效的關(guān)系越來(lái)越受到臨床醫(yī)生和研究者的重視。因此,需要尋找新的可與TNM分析相結(jié)合的預(yù)后指標(biāo)用以更準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)胃癌患者預(yù)后及對(duì)不同治療的敏感性,指導(dǎo)臨床治療,最終實(shí)現(xiàn)對(duì)患者的個(gè)體化治療,將能提高療效、避免過(guò)度治療和降低患者經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān),減少醫(yī)療資源的浪費(fèi)。生物標(biāo)記物是一種具有特殊分子特征的,存在于血液、體液或者組織中可以用于衡量疾病進(jìn)展和治療效果的生物化學(xué)分子,也可以叫做分子標(biāo)記。根據(jù)分子的類(lèi)型可以分為DNA標(biāo)記、RNA標(biāo)記、蛋白質(zhì)標(biāo)記等;按照臨床應(yīng)用可以分為診斷標(biāo)記、篩查標(biāo)記、預(yù)后標(biāo)記、易感標(biāo)記等。生物標(biāo)記物在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用很多,如疾病的易感分析、疾病的篩查、疾病的診斷、疾病的預(yù)后評(píng)估、治療方法的選擇、治療效果的評(píng)價(jià)和藥物設(shè)計(jì)等。隨著生物標(biāo)志物研究的進(jìn)展,人體自身的生物標(biāo)記物有望成為診斷和治療的基礎(chǔ),并幫助實(shí)現(xiàn)疾病早期診斷和患者的個(gè)性化治療。胃癌侵襲和轉(zhuǎn)移分子機(jī)制研究的進(jìn)展已揭示了多種分子改變和胃癌的預(yù)后有關(guān)。伴隨高通量分子生物學(xué)技術(shù)廣泛應(yīng)用,藥物基因組學(xué)及腫瘤分子生物學(xué)研究的飛速發(fā)展,人類(lèi)對(duì)胃癌從基因、mRNA和蛋白水平到體內(nèi)、外試驗(yàn)進(jìn)行了系統(tǒng)的研究。腫瘤的轉(zhuǎn)移為多步驟過(guò)程,包括瘤細(xì)胞脫落、局部浸潤(rùn)、遷移、血管浸潤(rùn)和血管生成、遷移至外周血并在血液循環(huán)中存活、內(nèi)皮細(xì)胞粘附、滲出血管、在不同的器官中定居和重新生長(zhǎng)等。多種基因參與腫瘤的轉(zhuǎn)移調(diào)控,如細(xì)胞周期蛋白、細(xì)胞粘附分子、蛋白酶、血管生成和生長(zhǎng)因子等,而這些轉(zhuǎn)移相關(guān)基因、mRNA和蛋白表達(dá)可作為胃癌的預(yù)后生物標(biāo)記物。另外,越來(lái)越多的證據(jù)顯示,抗腫瘤藥物機(jī)制相關(guān)的分子是識(shí)別患者個(gè)體差異的重要分子標(biāo)記物,主要包括三類(lèi):1)抗腫瘤藥物的作用分子標(biāo)記物,如HER2和EGFR;2)抗腫瘤藥物代謝相關(guān)的分子標(biāo)記物,如UGT1A1和CYP2D6等基因多態(tài)性;3)抗腫瘤藥物作用通路的相關(guān)分子標(biāo)記物,如KRAS基因突變和ERCC1基因mRNA表達(dá)水平。尋找和發(fā)現(xiàn)有價(jià)值的胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物已經(jīng)成為目前胃癌研究的一個(gè)重要熱點(diǎn)。我國(guó)十分重視生物標(biāo)記物的研究,將其列入了十二五等國(guó)家重點(diǎn)計(jì)劃項(xiàng)目。研究人員一直致力于發(fā)現(xiàn)可靠的胃癌相關(guān)生物標(biāo)記,已有2萬(wàn)多個(gè)研究發(fā)表在國(guó)際權(quán)威雜志上,每年有數(shù)以千記的研究成果,并且呈現(xiàn)加速增長(zhǎng)趨勢(shì)。其中,胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的研究尤為突出,已有上萬(wàn)個(gè)相關(guān)研究成果發(fā)表,約占有一半的胃癌生物標(biāo)記物研究,已發(fā)現(xiàn)了上百個(gè)潛在的預(yù)后標(biāo)記物。雖然研究人員每年開(kāi)展了大量的臨床實(shí)驗(yàn),花費(fèi)了大量的研究人力和財(cái)力。然而,胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的研究成果很少能被醫(yī)生和企業(yè)應(yīng)用于臨床。其主要原因是大量科學(xué)研究的信息不經(jīng)過(guò)合理的深加工,其利用價(jià)值是很低的。對(duì)同一個(gè)問(wèn)題,全球不同的實(shí)驗(yàn)室可能同時(shí)展開(kāi)研究,受試驗(yàn)對(duì)象、樣本量,地區(qū)、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)等因素的限制,可能得出不一致甚至是矛盾的結(jié)論。在單個(gè)研究中,研究人員常常會(huì)對(duì)某個(gè)預(yù)后生物標(biāo)記進(jìn)行夸張性宣傳,而包含正面結(jié)果的研究也容易被研究人員引用。由于以上的原因,臨床醫(yī)生和企業(yè)應(yīng)用生物標(biāo)記物所需要的知識(shí)積累和時(shí)間花費(fèi)將是巨大的,極大的影響了胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的研究和應(yīng)用進(jìn)程。如何在目前海量的生物標(biāo)記物研究數(shù)據(jù)中挖掘和搜集信息,評(píng)估和處理數(shù)據(jù),篩選出具有應(yīng)用價(jià)值或潛在應(yīng)用價(jià)值的預(yù)后生物標(biāo)記物已經(jīng)成為一個(gè)急需解決的問(wèn)題。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明要解決的技術(shù)問(wèn)題是提供一種基于證據(jù)的胃癌預(yù)后標(biāo)記物篩選方法,即是一種通過(guò)對(duì)海量的生物標(biāo)記物研究數(shù)據(jù)的挖掘和信息搜集,科學(xué)評(píng)估、加工、整理和處理數(shù)據(jù),按照評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)篩選出胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的方法。為了解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明提供一種基于證據(jù)的胃癌預(yù)后分子標(biāo)記物篩選方法,包括以下內(nèi)容:1)、為胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的實(shí)驗(yàn)研究制定納入標(biāo)準(zhǔn):主要在研究設(shè)計(jì)、研究人群、臨床效應(yīng)指標(biāo)、生物標(biāo)記物種類(lèi)等方面進(jìn)行限制;2)、制定研究證據(jù)檢索策略:全面而系統(tǒng)地檢索臨床研究證據(jù)數(shù)據(jù)庫(kù),包括PubMed、Embase、中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(CBM),萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)和中國(guó)知識(shí)資源總庫(kù)(CNKI);只檢索以人為研究對(duì)象的研究,研究類(lèi)型和出版語(yǔ)言不受限制;檢索納入研究的參考文獻(xiàn);3)、初步篩選預(yù)后生物標(biāo)記物:將檢索到的研究證據(jù)按照納入標(biāo)準(zhǔn),確定胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的種類(lèi)和數(shù)量,構(gòu)建生物標(biāo)記物數(shù)據(jù)庫(kù);生物標(biāo)記物按照研究設(shè)計(jì)方法、研究的數(shù)量和研究的樣本量進(jìn)行篩選,篩選出滿足以下任一一個(gè)條件的生物標(biāo)記物:(1)具有隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn);(2)研究數(shù)量≥3并且研究樣本量≥500;將篩選出來(lái)的生物標(biāo)記物進(jìn)行證據(jù)的擴(kuò)大再搜索,豐富臨床證據(jù);4)、研究資料提?。河?名研究者按照預(yù)先制定的研究資料提取內(nèi)容及標(biāo)準(zhǔn)獨(dú)立進(jìn)行資料提取以及交叉核對(duì),確保研究資料提取和質(zhì)量評(píng)價(jià)的結(jié)果具有一致性,意見(jiàn)不一致時(shí)交由第3位研究者確定;如果使用了相同的研究對(duì)象,選取樣本量最大的或者包含所有相同研究對(duì)象的研究;5)、試驗(yàn)研究質(zhì)量評(píng)估:使用Newcastle-OttawaScale對(duì)納入的研究進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估,主要評(píng)價(jià)患者選擇,退出隨訪,確認(rèn)生物標(biāo)記物狀態(tài)的準(zhǔn)確性,診斷準(zhǔn)確性,預(yù)后指標(biāo)評(píng)估的準(zhǔn)確性和控制混雜因素的準(zhǔn)確性;6)、標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理:采用標(biāo)準(zhǔn)化統(tǒng)計(jì)策略,合并測(cè)量指標(biāo),評(píng)估生物標(biāo)記物對(duì)胃癌預(yù)后的效能和價(jià)值;若存在系統(tǒng)綜述和Meta分析研究,直接將數(shù)據(jù)列入最終結(jié)果,否則進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。標(biāo)準(zhǔn)化統(tǒng)計(jì)策略主要包括:Meta分析,亞組分析,敏感性分析,Meta回歸分析,異質(zhì)性評(píng)估,累積Meta分析,發(fā)表偏倚評(píng)估;7)、預(yù)后生物標(biāo)記物篩選:經(jīng)過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理的胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物研究,按照研究設(shè)計(jì)方法、研究質(zhì)量、樣本量、預(yù)后指標(biāo)結(jié)果的顯著性進(jìn)行篩選,獲得具有潛在應(yīng)用價(jià)值的胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物;篩選標(biāo)準(zhǔn)如下:(1)具有一系列隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)研究,合并樣本量≧500例,OS、臨床病理特征、PFS、復(fù)發(fā)、毒性等預(yù)后指標(biāo)顯著(p<0.05),無(wú)發(fā)表偏倚(p>0.05);(2)只有單篇隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)研究,樣本量≥300例,失訪率<20%,研究質(zhì)量高(患者來(lái)源明確,具有隨機(jī)方案,胃癌分期等信息,分子標(biāo)記物檢測(cè)方法科學(xué)可靠,預(yù)后指標(biāo)評(píng)估按照國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),隨訪充分,統(tǒng)計(jì)方法科學(xué)等),OS、臨床病理特征、PFS、復(fù)發(fā)、毒性等預(yù)后指標(biāo)顯著(p<0.05);(3)具有多個(gè)實(shí)驗(yàn)研究,合并樣本量≥1000,OS、臨床病理特征、PFS、復(fù)發(fā)、毒性等預(yù)后指標(biāo)顯著(p<0.05),無(wú)發(fā)表偏倚(p>0.05);(4)只有單個(gè)多中心大樣本研究,樣本量≧500例,失訪率<20%,研究質(zhì)量高(患者來(lái)源明確,胃癌分期等信息,分子標(biāo)記物檢測(cè)方法科學(xué)可靠,預(yù)后指標(biāo)評(píng)估按照國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),隨訪充分,統(tǒng)計(jì)方法科學(xué)等),OS、臨床病理特征、PFS、復(fù)發(fā)、毒性等預(yù)后指標(biāo)顯著(p<0.05);8)、根據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn),篩選出具有潛在應(yīng)用價(jià)值的胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物,并描述預(yù)后價(jià)值。本發(fā)明的創(chuàng)新點(diǎn)在于:1.相對(duì)于單個(gè)實(shí)驗(yàn)研究篩選生物標(biāo)記物,本方法能在海量的研究數(shù)據(jù)中剔除不相關(guān)研究,最大限度地利用已有研究證據(jù),能綜合地評(píng)估生物標(biāo)記物的價(jià)值,篩選出胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物。2.相對(duì)于通過(guò)傳統(tǒng)的多中心大樣本試驗(yàn)研究來(lái)發(fā)現(xiàn)預(yù)后標(biāo)記物的方法,本方法能以更快的速度、更少的人力和財(cái)力篩選到具有潛在應(yīng)用價(jià)值的預(yù)后生物標(biāo)記物,方便研究人員、醫(yī)生和企業(yè)應(yīng)用。綜上所述,本發(fā)明利用了一種基于研究證據(jù)的生物標(biāo)記物篩選方法,來(lái)進(jìn)行胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物的篩選,以降低篩選成本,縮短篩選時(shí)間,降低專(zhuān)業(yè)門(mén)檻,提高預(yù)后生物標(biāo)記物的應(yīng)用價(jià)值。具體實(shí)施方式實(shí)施例1、一種基于證據(jù)的胃癌預(yù)后分子標(biāo)記物篩選方法,依次進(jìn)行以下步驟:1.制定研究證據(jù)納入標(biāo)準(zhǔn):(1)研究人群為胃癌患者;(2)評(píng)估生物標(biāo)記物與臨床效應(yīng)指標(biāo)之間的關(guān)系,臨床效應(yīng)指標(biāo)必須是總體生存期(OS)、無(wú)進(jìn)展生存期(PFS)、化療藥物敏感性、復(fù)發(fā)、毒副作用、臨床病理特征等中的一種或幾種;(3)生物標(biāo)記物為基因突變、基因多態(tài)性、mRNA表達(dá)水平、蛋白表達(dá)水平、microRNA和微衛(wèi)星中的一種或幾種;(4)提供明確的生物標(biāo)記物檢測(cè)方法;(5)研究設(shè)計(jì)必須隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)、橫截面研究、隊(duì)列研究或者系統(tǒng)綜述(滿足上述至少一種),分為前瞻性研究和回顧性研究。排除下列研究:(1)沒(méi)有對(duì)照組;(2)無(wú)分子標(biāo)記物檢測(cè)方法;(3)重復(fù)的研究;(4)細(xì)胞或者動(dòng)物實(shí)驗(yàn);(5)綜述文章;(6)沒(méi)有研究生物標(biāo)記物與胃癌預(yù)后關(guān)系。2.系統(tǒng)性檢索胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物相關(guān)的研究證據(jù),數(shù)據(jù)庫(kù)包括PubMed、Embase、CBM、CNKI和萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)。PubMed和Embase數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索式為:("Stomach"OR"Gastric")AND("cancer"OR"cancers"OR"tumor"OR"tumors"OR"neoplasm"OR"neoplasms"OR"adenoma"OR"adenomas"OR"carcinoma"OR"carcinomas"OR"adenocarcinoma"OR"adenocarcinoma"OR"malignant"OR"malignancy")AND("response"OR"survival"OR"outcome"OR"resistance"OR"outcomes"OR"recurrence"OR"relapse"OR"toxicity"OR"responder"OR"responders"OR"adverseevents"OR"adverseevent"OR"adverseeffect"OR"adverseeffects"OR"prognosis"OR"prognostic"OR"predictive")AND("polymorphism"OR"polymorphisms"OR"polymorphic"OR"geneticvariant"OR"geneticvariants"OR"mutation"OR"muton"OR"mutations"OR"mutons"OR"expression"OR"expressions"OR"express"OR"mrna"OR"biomarker"OR"biomarkers"OR"microsatellite"OR"microsatellites"OR"allele"OR"gene"OR"protein"OR"MicroRNAs"OR"miRNAs"OR"miRNA"OR"MicroRNA"OR"RNA,Micro"OR"MicroRNA"OR"pri-miRNA"OR"RNA,SmallTemporal"OR"TemporalRNA,Small"OR"stRNA"OR"SmallTemporalRNA"OR"pre-miRNA");CBM,CNKI和萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索式為:(“胃癌”O(jiān)R“stomachcancer”O(jiān)R“gastriccancer”)AND(“敏感性”O(jiān)R“生存期”O(jiān)R“生存”O(jiān)R“PFS”O(jiān)R“OS”O(jiān)R”survival”O(jiān)R“response”O(jiān)R“responder”O(jiān)R“outcome”O(jiān)R“復(fù)發(fā)”O(jiān)R“recurrence”O(jiān)R“relapse”O(jiān)R“毒性”O(jiān)R“副作用”O(jiān)R“預(yù)后”O(jiān)R“預(yù)測(cè)”O(jiān)R“prognosis”O(jiān)R“prognostic”O(jiān)R“predictive”O(jiān)R"adverseevent"OR"adverseeffect"OR“淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移”O(jiān)R“療效”O(jiān)R“藥物反應(yīng)”)AND(“多態(tài)性”O(jiān)R“突變”O(jiān)R“微衛(wèi)星”O(jiān)R“表達(dá)”O(jiān)R“生物標(biāo)記物”O(jiān)R“分子標(biāo)記物”O(jiān)R"polymorphism"OR"mutation"OR"expression"OR"mrna"OR"biomarker"OR"microsatellite"OR"MicroRNAs"OR"miRNA")。只檢索以人為研究對(duì)象的研究,研究類(lèi)型和出版語(yǔ)言不受限制。檢索納入研究的參考文獻(xiàn)。3.初步篩選預(yù)后生物標(biāo)記物(1)根據(jù)研究證據(jù)檢索結(jié)果(即上述步驟2所得的結(jié)果),按照證據(jù)納入標(biāo)準(zhǔn),構(gòu)建胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物數(shù)據(jù)庫(kù)。(2)篩選出具有隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)研究或者研究數(shù)量≥3并且研究樣本量≥500的標(biāo)記物。其中隨機(jī)對(duì)照實(shí)驗(yàn)研究通過(guò)直接對(duì)檢索式限定進(jìn)行多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索后獲得,研究數(shù)量和研究樣本量由檢索結(jié)果的統(tǒng)計(jì)分析獲得。如Cdx2表達(dá)水平與胃癌預(yù)后相關(guān)的研究有13個(gè),總樣本量大于1500例。備注說(shuō)明:此步驟是初步篩選標(biāo)記物,根據(jù)這個(gè)步驟,篩選到了其中一個(gè)Cdx2,后面以Cdx2為例進(jìn)行分析。(3)緊接著對(duì)篩選到的Cdx2進(jìn)行PubMed、Embase、CNKI、CBM和萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)的研究證據(jù)再檢索,檢索式只包括胃癌和Cdx2標(biāo)記物兩塊內(nèi)容,以獲得更全的研究證據(jù)。檢索式為:((("Stomach"OR"Gastric")AND("cancer"OR"cancers"OR"tumor"OR"tumors"OR"neoplasm"OR"neoplasms"OR"adenoma"OR"adenomas"OR"carcinoma"OR"carcinomas"OR"adenocarcinoma"OR"adenocarcinoma"OR"malignant"OR"malignancy"))OR"胃癌")AND("CDX2"OR"CDX-2"OR"caudaltypehomeobox2"OR"CDX3"OR"CDX-3")。檢索結(jié)果獲得616個(gè)相關(guān)文獻(xiàn),其中符合研究證據(jù)納入標(biāo)準(zhǔn)的共有13項(xiàng)研究。4.由2名研究者獨(dú)立對(duì)13項(xiàng)符合納入標(biāo)準(zhǔn)的研究,進(jìn)行研究資料提取。對(duì)提取的資料內(nèi)容進(jìn)行核對(duì),采用一致的內(nèi)容,若出現(xiàn)不一致情況,交由第3位研究者確定。提取的主要資料包括:研究作者,發(fā)表時(shí)間,研究對(duì)象來(lái)源(醫(yī)院、地區(qū)、國(guó)家和種族等),患者的基線情況(年齡、性別等),研究樣本量,胃癌是否經(jīng)過(guò)組織或病理確認(rèn),胃癌的分期和分化狀況,試驗(yàn)研究設(shè)計(jì),檢測(cè)Cdx2表達(dá)水平的方法,是否采用了盲法,Cdx2陰性和陽(yáng)性表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn),是否實(shí)施放療或化療治療,OS、復(fù)發(fā)、臨床病理參數(shù)(性別、年齡、腫瘤位置、臨床分期、腫瘤分化、血管浸潤(rùn)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移)等預(yù)后指標(biāo),隨訪時(shí)間,統(tǒng)計(jì)分析方法等。備注說(shuō)明:步驟4將步驟3篩選到的符合標(biāo)準(zhǔn)的研究,提取數(shù)據(jù),用于后續(xù)步驟5和6的分析。5.使用Newcastle-OttawaScale對(duì)納入的13項(xiàng)研究(即根據(jù)檢索結(jié)果,符合第1步納入標(biāo)準(zhǔn)的Cdx2的13項(xiàng)研究)進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估,主要評(píng)價(jià)病人選擇,退出隨訪,確認(rèn)生物標(biāo)記物狀態(tài)的準(zhǔn)確性,診斷準(zhǔn)確性,療效評(píng)估的準(zhǔn)確性和控制混雜因素的準(zhǔn)確性。Newcastle-OttawaScale針對(duì)研究樣本選擇、可比性和研究結(jié)果三類(lèi)指標(biāo),共8個(gè)項(xiàng)目進(jìn)行研究質(zhì)量評(píng)估。其中,研究樣本選擇有4個(gè)項(xiàng)目,研究結(jié)果有3個(gè)項(xiàng)目,每個(gè)項(xiàng)目各1分;可比性有1個(gè)項(xiàng)目,最高可得2分。在總共9分中,得到6分及以上的研究為高質(zhì)量的研究,否則為低質(zhì)量研究。若研究為高質(zhì)量研究,進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理和分析;若研究為低質(zhì)量研究,直接將此研究舍棄。納入的Cdx2表達(dá)水平相關(guān)的13項(xiàng)研究,都是高質(zhì)量研究,用于標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理。6.標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理采用標(biāo)準(zhǔn)化統(tǒng)計(jì)策略,合并測(cè)量指標(biāo),綜合地評(píng)估生物標(biāo)記物對(duì)胃癌預(yù)后價(jià)值。數(shù)據(jù)處理分為兩部分:首先評(píng)估Cdx2表達(dá)水平與總體生存期之間的關(guān)系;然后分析Cdx2表達(dá)水平與臨床病理參數(shù)的關(guān)系,包括性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤位置、組織分化、侵入深度、血管浸潤(rùn)、淋巴結(jié)狀態(tài)、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和TNM分期。(1)Cdx2表達(dá)水平與胃癌預(yù)后之間的關(guān)系用RR和HR及95%置信區(qū)間來(lái)評(píng)估,其中RR用來(lái)評(píng)估二分類(lèi)指標(biāo),HR用來(lái)評(píng)估生存期指標(biāo)。HR通過(guò)原始研究數(shù)據(jù)或者Kaplan-Meier生存曲線計(jì)算獲得。(2)Q統(tǒng)計(jì)量檢驗(yàn)研究間的異質(zhì)性。由于統(tǒng)計(jì)效力較低,將顯著性水平定位0.10。若研究間存在顯著異質(zhì)性,采用固定效應(yīng)模型(倒方差方法或者M(jìn)antel–Haenszel方法)對(duì)RR或者HR值進(jìn)行合并,若研究之間有顯著異質(zhì)性,采用隨機(jī)效應(yīng)模型(DerSimonianandLaird方法)。合并RR或者HR值的檢驗(yàn)使用Z統(tǒng)計(jì)量。(3)進(jìn)一步用I2統(tǒng)計(jì)量來(lái)檢驗(yàn)研究之間的異質(zhì)性。Q值的大小取決于合并方差、效應(yīng)值的離散程度以及納入研究的證據(jù)數(shù)量,隨著證據(jù)數(shù)目的變化而變化,I2統(tǒng)計(jì)量是利用了自由度校正了研究證據(jù)數(shù)目對(duì)Q值的影響。因此I2統(tǒng)計(jì)量揭示的異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果更為穩(wěn)健可靠,特別是對(duì)于研究數(shù)量較少的分層分析。當(dāng)I2=0時(shí),表明研究間的變異僅由抽樣誤差引起;當(dāng)I2<0.25時(shí),則認(rèn)為存在輕度異質(zhì)性;當(dāng)I2在0.25和0.5之間時(shí),則認(rèn)為存在中度異質(zhì)性;當(dāng)I2>0.5時(shí),將被認(rèn)為存在高度異質(zhì)性。(4)亞組分析和Meta回歸尋找異質(zhì)性來(lái)源。Meta回歸利用限制性最大似然法來(lái)估計(jì)權(quán)重系數(shù),能同時(shí)整合研究?jī)?nèi)部和研究之間的差異。由于Meta回歸分析的統(tǒng)計(jì)效力較低,將統(tǒng)計(jì)顯著性水平定為0.10。(5)敏感性分析通過(guò)評(píng)估單項(xiàng)研究或單個(gè)因素對(duì)于Meta分析結(jié)果的影響,來(lái)衡量合并結(jié)果的可靠性。累積Meta分析用來(lái)分析合并RR或者HR值隨著發(fā)表時(shí)間推移的趨勢(shì)。使用漏斗圖對(duì)文章發(fā)表偏倚進(jìn)行評(píng)估,進(jìn)一步用Egger提出的t檢驗(yàn)來(lái)定量評(píng)估漏斗圖的對(duì)稱(chēng)性。7.預(yù)后生物標(biāo)記物篩選經(jīng)過(guò)標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理的Cdx2表達(dá)水平與胃癌預(yù)后關(guān)系的研究結(jié)果,按照研究設(shè)計(jì)方法、研究質(zhì)量、樣本量、預(yù)后指標(biāo)結(jié)果的顯著性進(jìn)行篩選。(1)研究共納入了13個(gè)獨(dú)立試驗(yàn),包括1513例胃癌患者,各個(gè)研究質(zhì)量較好,評(píng)估了Cdx2表達(dá)水平與5年總體生存期和臨床病理學(xué)參數(shù)之間的關(guān)系。(2)Cdx2陽(yáng)性表達(dá)與提高的5年總體生存期顯著性相關(guān)聯(lián),合并HR為2.22(95%CI:1.78-2.75,P<0.001)。(3)Cdx2表達(dá)水平與胃癌的侵襲性生物表性顯著相關(guān)(性別、腫瘤分期、腫瘤分化、血管浸潤(rùn)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移)。Cdx2陽(yáng)性表達(dá)患者具有更低的血管浸潤(rùn)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)。(4)敏感性分析顯示Cdx2表達(dá)水平與胃癌預(yù)后的關(guān)系可靠,發(fā)表偏倚可能性很?。≒>0.05),表明了結(jié)果的可信度。8.根據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn),篩選得到Cdx2表達(dá)水平是一個(gè)具有潛在應(yīng)用價(jià)值的胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物。Cdx2陽(yáng)性表達(dá)與更低的血管浸潤(rùn)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、提高的5年總體生存期顯著關(guān)聯(lián)。此外,通過(guò)本方法還篩選到了多個(gè)胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物,如E-cadherin表達(dá)水平,TYMS2R/3R多態(tài)性,GSTP1Ile105Val多態(tài)性,telomerase活性,VEGF表達(dá)水平,MMP-9表達(dá)水平,HER-2/neu表達(dá)水平等。9.開(kāi)展驗(yàn)證試驗(yàn),對(duì)Cdx2表達(dá)水平作為胃癌預(yù)后生物標(biāo)記物進(jìn)行驗(yàn)證?;仡櫺缘倪B續(xù)納入100例胃癌患者,分析其Cdx2表達(dá)水平與5年總體生存期之間的關(guān)系。采用Cox比例分配模型統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果顯示Cdx2陽(yáng)性表達(dá)與提高的5年總體生存期顯著性相關(guān)聯(lián),HR為1.99(95%CI:1.27-3.13)。此結(jié)果與篩選方法得出的結(jié)果一致,表明本方法的可靠性。最后,還需要注意的是,以上列舉的僅是本發(fā)明的若干個(gè)具體實(shí)施例。顯然,本發(fā)明不限于以上實(shí)施例,還可以有許多變形。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員能從本發(fā)明公開(kāi)的內(nèi)容直接導(dǎo)出或聯(lián)想到的所有變形,均應(yīng)認(rèn)為是本發(fā)明的保護(hù)范圍。