本申請(qǐng)涉及生物信息技術(shù)領(lǐng)域，具體而言，涉及一種腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法及裝置。

背景技術(shù)：

隨著醫(yī)學(xué)、基因組學(xué)和高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和成熟，精準(zhǔn)醫(yī)療(Precision Medicine)也在世界各國(guó)應(yīng)用，成為新型的醫(yī)療模式。精準(zhǔn)醫(yī)療為將個(gè)人基因、環(huán)境與生活習(xí)慣差異考慮在內(nèi)的疾病預(yù)防與處置的醫(yī)療方法，依據(jù)每個(gè)人的遺傳信息，個(gè)性化、精準(zhǔn)化的去制定醫(yī)療和健康管理方案。

而每個(gè)人的遺傳背景是有區(qū)別的，在此過(guò)程中，就需要確定每個(gè)人的基因組或者某些與相應(yīng)器官或者位置相關(guān)聯(lián)的基因的突變情況，以使能夠根據(jù)該堿基突變情況進(jìn)一步分析對(duì)比，確定最終的患病可能性，以指定相應(yīng)的醫(yī)療和健康管理方案。

若機(jī)體產(chǎn)生腫瘤，會(huì)對(duì)生產(chǎn)生活產(chǎn)生不同程度的影響。于是，對(duì)腫瘤疾病做一定預(yù)防措施，以減小發(fā)病幾率，極其重要。

由于腫瘤疾病的發(fā)病情況與遺傳基因具有一定的聯(lián)系，腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)堿基突變情況不同，可能使腫瘤的不同腫瘤疾病的發(fā)病情況及發(fā)病幾率不同。于是，可以利用精準(zhǔn)醫(yī)療模式，根據(jù)腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的堿基突變情況以及其他信息的結(jié)合對(duì)腫瘤疾病的發(fā)病情況及幾率進(jìn)行預(yù)測(cè)，以對(duì)腫瘤疾病進(jìn)行預(yù)防是一種有效的預(yù)防方式。腫瘤疾病即產(chǎn)生腫瘤。

現(xiàn)有的對(duì)腫瘤基因位點(diǎn)突變情況的確定，通常是通過(guò)化學(xué)方式獲取待測(cè)基因的某一指定位置的基因位點(diǎn)的堿基突變情況，該獲取方式獲取的突變位點(diǎn)的數(shù)量有限，通常只能獲得某一個(gè)或某幾個(gè)堿基的突變情況，不能同時(shí)確定待測(cè)基因中與腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的盡可能多的多個(gè)變異位點(diǎn)的突變情況，使后續(xù)結(jié)合其他信息對(duì)腫瘤疾病的患病情況的預(yù)測(cè)結(jié)果可能出現(xiàn)較大偏差。

技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素：

有鑒于此，本申請(qǐng)實(shí)施例提供了一種腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法及裝置，通過(guò)將待測(cè)基因的變異位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，從而可以獲得待測(cè)基因中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)的堿基突變情況，以改善上述問(wèn)題。

為了實(shí)現(xiàn)上述目的，本申請(qǐng)采用的技術(shù)方案如下：

一種腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法，所述方法包括：將待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)，獲得待測(cè)基因的初步變異位點(diǎn)信息，所述初步變異位點(diǎn)信息中包括多個(gè)初步變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)初步變異位點(diǎn)的位置信息；根據(jù)所述初步變異位點(diǎn)信息，將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中不滿足預(yù)設(shè)保留條件的變異位點(diǎn)刪除，將刪除后獲得的所述待測(cè)基因中的變異位點(diǎn)作為待檢位點(diǎn)；將所述待檢位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，所述腫瘤基因庫(kù)中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置；當(dāng)所述待檢位點(diǎn)中存在與所述腫瘤基因庫(kù)中位置相同且突變堿基相同的變異位點(diǎn)，獲得所述待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況。

一種腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置，所述裝置包括：比對(duì)模塊，用于將待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)，獲得待測(cè)基因的初步變異位點(diǎn)信息，所述初步變異位點(diǎn)信息中包括多個(gè)初步變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)初步變異位點(diǎn)的位置信息；過(guò)濾模塊，用于根據(jù)所述初步變異位點(diǎn)信息，將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中不滿足預(yù)設(shè)保留條件的變異位點(diǎn)刪除，將刪除后獲得的所述待測(cè)基因中的變異位點(diǎn)作為待檢位點(diǎn)；比較模塊，用于將所述待檢位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，所述腫瘤基因庫(kù)中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置；突變獲取模塊，當(dāng)所述待檢位點(diǎn)中存在與所述腫瘤基因庫(kù)中位置相同且突變堿基相同的變異位點(diǎn)，用于獲得所述待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況。

本申請(qǐng)實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法及裝置，在獲得待測(cè)基因的變異位點(diǎn)的情況下，將待測(cè)基因的變異位點(diǎn)中與腫瘤基因庫(kù)中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，腫瘤基因庫(kù)中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置。當(dāng)待測(cè)基因中存在與腫瘤基因庫(kù)中位置相同且突變堿基相同的變異位點(diǎn)，可以確定該待測(cè)基因中存在腫瘤對(duì)應(yīng)的基因突變。

由于腫瘤基因庫(kù)中包括與腫瘤相關(guān)的多個(gè)變異位點(diǎn)，則本方案可以確定待測(cè)基因中與腫瘤相關(guān)的多個(gè)變異位點(diǎn)，以及該多個(gè)變異位點(diǎn)的具體堿基突變情況。

為使本申請(qǐng)的上述目的、特征和優(yōu)點(diǎn)能更明顯易懂，下文特舉較佳實(shí)施例，并配合所附附圖，作詳細(xì)說(shuō)明如下。

附圖說(shuō)明

為使本申請(qǐng)實(shí)施例的目的、技術(shù)方案和優(yōu)點(diǎn)更加清楚，下面將結(jié)合本申請(qǐng)實(shí)施例中的附圖，對(duì)本申請(qǐng)實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述，顯然，所描述的實(shí)施例是本申請(qǐng)一部分實(shí)施例，而不是全部的實(shí)施例?；诒旧暾?qǐng)中的實(shí)施例，本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒(méi)有做出創(chuàng)造性勞動(dòng)前提下所獲得的所有其他實(shí)施例，都屬于本申請(qǐng)保護(hù)的范圍。

圖1示出了本申請(qǐng)實(shí)施例提供的計(jì)算機(jī)的結(jié)構(gòu)示意圖；

圖2示出了本申請(qǐng)第一實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法的一種流程圖；

圖3示出了本申請(qǐng)第一實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法的部分步驟的流程圖；

圖4示出了本申請(qǐng)第二實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置的功能模塊圖；

圖5示出了本申請(qǐng)第二實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置的基因庫(kù)建立模塊的功能模塊圖；

圖6示出了本申請(qǐng)第二實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置的過(guò)濾模塊的功能模塊圖；

圖7示出了本申請(qǐng)第二實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置的比對(duì)模塊的功能模塊圖。

具體實(shí)施方式

下面將結(jié)合本申請(qǐng)實(shí)施例中附圖，對(duì)本申請(qǐng)實(shí)施例中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述，顯然，所描述的實(shí)施例僅僅是本申請(qǐng)一部分實(shí)施例，而不是全部的實(shí)施例。通常在此處附圖中描述和示出的本申請(qǐng)實(shí)施例的組件可以以各種不同的配置來(lái)布置和設(shè)計(jì)。因此，以下對(duì)在附圖中提供的本申請(qǐng)的實(shí)施例的詳細(xì)描述并非旨在限制要求保護(hù)的本申請(qǐng)的范圍，而是僅僅表示本申請(qǐng)的選定實(shí)施例?；诒旧暾?qǐng)的實(shí)施例，本領(lǐng)域技術(shù)人員在沒(méi)有做出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下所獲得的所有其他實(shí)施例，都屬于本申請(qǐng)保護(hù)的范圍。

應(yīng)注意到：相似的標(biāo)號(hào)和字母在下面的附圖中表示類似項(xiàng)，因此，一旦某一項(xiàng)在一個(gè)附圖中被定義，則在隨后的附圖中不需要對(duì)其進(jìn)行進(jìn)一步定義和解釋。同時(shí)，在本申請(qǐng)的描述中，術(shù)語(yǔ)“第一”、“第二”等僅用于區(qū)分描述，而不能理解為指示或暗示相對(duì)重要性。

如圖1所示，是本申請(qǐng)計(jì)算機(jī)100的方框示意圖。所述計(jì)算機(jī)100包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置200、存儲(chǔ)器101、存儲(chǔ)控制器102、處理器103、外設(shè)接口104、輸入輸出單元105及其他。

所述存儲(chǔ)器101、存儲(chǔ)控制器102、處理器103、外設(shè)接口104以及輸入輸出單元105各元件相互之間直接或間接地電性連接，以實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的傳輸或交互。例如，這些元件相互之間可通過(guò)一條或多條通訊總線或信號(hào)線實(shí)現(xiàn)電性連接。所述腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置200包括至少一個(gè)可以軟件或固件(firmware)的形式存儲(chǔ)于所述存儲(chǔ)器101中或固化在所述計(jì)算機(jī)100的操作系統(tǒng)(operating system，OS)中的軟件功能模塊。所述處理器103用于執(zhí)行存儲(chǔ)器101中存儲(chǔ)的可執(zhí)行模塊，例如所述腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置200包括的軟件功能模塊或計(jì)算機(jī)程序。

其中，存儲(chǔ)器101可以是，但不限于，隨機(jī)存取存儲(chǔ)器(Random Access Memory，RAM)，只讀存儲(chǔ)器(Read Only Memory，ROM)，可編程只讀存儲(chǔ)器(Programmable Read-Only Memory，PROM)，可擦除只讀存儲(chǔ)器(Erasable Programmable Read-Only Memory，EPROM)，電可擦除只讀存儲(chǔ)器(Electric Erasable Programmable Read-Only Memory，EEPROM)等。其中，存儲(chǔ)器101用于存儲(chǔ)程序，所述處理器103在接收到執(zhí)行指令后，執(zhí)行所述程序，前述本申請(qǐng)實(shí)施例任一實(shí)施例揭示的流過(guò)程定義的計(jì)算機(jī)100所執(zhí)行的方法可以應(yīng)用于處理器103中，或者由處理器103實(shí)現(xiàn)。

處理器103可能是一種集成電路芯片，具有信號(hào)的處理能力。上述的處理器103可以是通用處理器，包括中央處理器(Central Processing Unit，簡(jiǎn)稱CPU)、網(wǎng)絡(luò)處理器(Network Processor，簡(jiǎn)稱NP)等；還可以是數(shù)字信號(hào)處理器(DSP)、專用集成電路(ASIC)、現(xiàn)成可編程門陣列(FPGA)或者其他可編程邏輯器件、分立門或者晶體管邏輯器件、分立硬件組件。可以實(shí)現(xiàn)或者執(zhí)行本申請(qǐng)實(shí)施例中的公開的各方法、步驟及邏輯框圖。通用處理器可以是微處理器或者該處理器103也可以是任何常規(guī)的處理器等。

所述外設(shè)接口104將各種輸入/輸出裝置耦合至處理器103以及存儲(chǔ)器101。在一些實(shí)施例中，外設(shè)接口104，處理器103以及存儲(chǔ)控制器102可以在單個(gè)芯片中實(shí)現(xiàn)。在其他一些實(shí)例中，他們可以分別由獨(dú)立的芯片實(shí)現(xiàn)。

輸入輸出單元105用于提供給用戶輸入數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)用戶與所述計(jì)算機(jī)的交互。所述輸入輸出單元可以是，但不限于，數(shù)據(jù)讀取裝置、鼠標(biāo)和鍵盤等。

可以理解的，圖1所示的結(jié)構(gòu)僅為示意，計(jì)算機(jī)100還可以包括比圖1中所示更多或更少的組件，或者具有與圖1所示不同的配置。圖1中所示的各組件可以采用硬件、軟件或其組合實(shí)現(xiàn)。

第一實(shí)施例

本申請(qǐng)實(shí)施例提供了一種腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法，用于獲取待測(cè)基因中與腫瘤相關(guān)的基因的變異位點(diǎn)的堿基突變情況。請(qǐng)參見(jiàn)圖2，該方法包括：

步驟S110：將待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)，獲得待測(cè)基因的初步變異位點(diǎn)信息，所述初步變異位點(diǎn)信息中包括多個(gè)初步變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)初步變異位點(diǎn)的位置信息。

首先，獲取待測(cè)基因的多個(gè)短序列，該短序列可以是通過(guò)第二代測(cè)序平臺(tái)輸出。將待測(cè)基因的短序列與參考基因組進(jìn)行比對(duì)。如，若待測(cè)基因?yàn)槿祟惢?，該參考基因組則為人類參考基因組。

當(dāng)然，該比對(duì)過(guò)程可以包括多次比對(duì)以及去重等過(guò)程，得到比對(duì)后的包括多個(gè)變異位點(diǎn)的初步變異位點(diǎn)信息。

具體的，如圖3所示，在本實(shí)施例中，本步驟中的數(shù)據(jù)比對(duì)以獲取初步變異位點(diǎn)信息的過(guò)程可以包括：

步驟S111：將所述待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行首次比對(duì)，獲得SAM格式的比對(duì)結(jié)果。

將待測(cè)基因的短序列與參考基因組進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)，該比對(duì)過(guò)程可以利用現(xiàn)有的比對(duì)軟件進(jìn)行，如Bowtie2，可以獲得SAM格式的比對(duì)結(jié)果，該SAM格式的比對(duì)結(jié)果中存儲(chǔ)有比對(duì)后獲得的比對(duì)信息。可以理解的，在該SAM格式的比對(duì)結(jié)果中，包括了待測(cè)基因中各個(gè)堿基的信息，如位置信息。

當(dāng)然，具體使用的比對(duì)軟件以及比對(duì)結(jié)果的表示方式在本實(shí)施例中并不作為限制，以能將待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行比對(duì)并獲得表示比對(duì)結(jié)果的比對(duì)信息為宜。

步驟S112：對(duì)所述比對(duì)結(jié)果進(jìn)行去重，使對(duì)比到參考基因組的一個(gè)位置的短序列個(gè)數(shù)小于或等于1。

步驟S111獲得的比對(duì)結(jié)果中，有一定比例的重復(fù)序列和結(jié)果，例如，對(duì)比到參考基因組的同一位置可能有多個(gè)短序列，于是，在本步驟中，將比對(duì)結(jié)果進(jìn)行去重。

在本實(shí)施例中，可以利用軟件Picard進(jìn)行去重工作。具體的，利用的可以是Picard的MarkDuplicate工具去重，獲得bam格式的去重結(jié)果。

步驟S113：對(duì)去重后的對(duì)比結(jié)果進(jìn)行本地重比對(duì)(local multiple alignment)。

由于獲得的與參考基因組進(jìn)行比對(duì)的短序列很難精確的比對(duì)到高度相似的重復(fù)區(qū)域，于是在基因組的重復(fù)區(qū)域很容易得到假陽(yáng)性的變異位點(diǎn)，如假陽(yáng)性的SNPs。可以理解的，假陽(yáng)性的變異位點(diǎn)即為比對(duì)結(jié)果錯(cuò)誤的變異位點(diǎn)。為了降低假陽(yáng)性變異位點(diǎn)的數(shù)量和比例，在本實(shí)施例中，對(duì)去重后的對(duì)比結(jié)果進(jìn)行本地重比對(duì)。

具體的，該本地重比對(duì)(local multiple alignment)可以使用GATK中IndelRealigner進(jìn)行，獲得bam格式的重比對(duì)后的比對(duì)結(jié)果。該比對(duì)過(guò)程一般有三個(gè)步驟，a.檢測(cè)到可疑的，需要進(jìn)行重比對(duì)的區(qū)域；b.對(duì)這些可疑的區(qū)域進(jìn)行重比對(duì)；c.修復(fù)在重比對(duì)過(guò)程中丟失的mate pairing信息。

步驟S114：重新計(jì)算本地重比對(duì)后的比對(duì)結(jié)果中的堿基質(zhì)量分?jǐn)?shù)。

在前述處理過(guò)程中的步驟S111中，每個(gè)單一的堿基都會(huì)在數(shù)據(jù)處理過(guò)程中被賦予一個(gè)質(zhì)量分?jǐn)?shù)(Quality scores)，用于反映相應(yīng)的堿基被觀察到的核苷酸的可信度。

由于前述處理過(guò)程中獲得的質(zhì)量分?jǐn)?shù)沒(méi)有較好地和錯(cuò)誤的分型結(jié)果可能性聯(lián)系起來(lái)，同時(shí)單一堿基的質(zhì)量分?jǐn)?shù)，沒(méi)有和其他參數(shù)相例子聯(lián)系，比如在同一個(gè)樣品中不同測(cè)序平臺(tái)，不同測(cè)序循環(huán)，不同文庫(kù)等進(jìn)行聯(lián)系。

因此，在本步驟中S114中，將每個(gè)堿基的質(zhì)量分?jǐn)?shù)與測(cè)序過(guò)程中的各個(gè)因子相聯(lián)系，對(duì)每個(gè)堿基的質(zhì)量分?jǐn)?shù)進(jìn)行重新計(jì)算，生成新的質(zhì)量分?jǐn)?shù)，以用于判斷每個(gè)堿基是否可信。

具體的，在本實(shí)施例中，可以使用GATK進(jìn)行empirical quality score recalibration，獲得bam格式的結(jié)果。

步驟S115：根據(jù)所述堿基質(zhì)量分?jǐn)?shù)，對(duì)本地重比對(duì)后的對(duì)比結(jié)果進(jìn)行SNP和indel分析，獲得初步變異位點(diǎn)信息。

根據(jù)重新計(jì)算獲得的堿基質(zhì)量分?jǐn)?shù)，對(duì)本地重比對(duì)獲得的比對(duì)結(jié)果進(jìn)行SNP和indel的初步判讀，對(duì)其進(jìn)行SNP和indel分型，以獲得包括多個(gè)變異位點(diǎn)的變異位點(diǎn)信息，該變異位點(diǎn)信息作為初步變異位點(diǎn)信息，該包括的多個(gè)變異位點(diǎn)作為初步變異位點(diǎn)?？梢岳斫獾模谠摮醪阶儺愇稽c(diǎn)信息中，包括了多個(gè)初步變異位點(diǎn)的突變堿基，以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置。在本實(shí)施例中，變異位點(diǎn)為SNP和indel，優(yōu)選的，在本實(shí)施例中，變異位點(diǎn)僅為SNP。

具體的，在本步驟中，可以是利用GATK的Unified Genotyper進(jìn)行分析。因?yàn)樵谕瓿蒘NPs的分型后，采用了很多數(shù)據(jù)過(guò)濾參數(shù)對(duì)數(shù)據(jù)再次進(jìn)行過(guò)濾，以進(jìn)一步控制數(shù)據(jù)質(zhì)量，所以在本步驟中將standard minimum confidence thresholds都設(shè)置為零?？梢岳斫獾?，SNPs表示SNP的復(fù)數(shù)形式。

當(dāng)然，該SNP和indel的初步判讀過(guò)程也可以用其他方式進(jìn)行，在本實(shí)施例中并不作為限制，也可以是其他，如GATK的HaplotypeCaller進(jìn)行。

在該步驟中，可以獲得包括初步變異位點(diǎn)信息的vcf文件，該vcf文件中的初步變異位點(diǎn)信息中包括在步驟S110中獲得的各個(gè)變異位點(diǎn)以及每個(gè)變異位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的位置信息，當(dāng)然，還包括其他，在此不加贅述。

步驟S120：根據(jù)所述初步變異位點(diǎn)信息，將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中不滿足預(yù)設(shè)保留條件的變異位點(diǎn)刪除，將刪除后獲得的所述待測(cè)基因中的變異位點(diǎn)作為待檢位點(diǎn)。

在步驟S110中，獲得的初步變異位點(diǎn)信息中的初步變異位點(diǎn)中，仍可能存在假陽(yáng)性的變異位點(diǎn)，于是，本步驟對(duì)初步變異位點(diǎn)進(jìn)行進(jìn)一步過(guò)濾，刪除其中假陽(yáng)性可能性較高的變異位點(diǎn)，以刪除后的結(jié)果中的變異位點(diǎn)作為該待測(cè)基因中的變異位點(diǎn)，使最后獲得的變異位點(diǎn)更加準(zhǔn)確?？梢岳斫獾模瑒h除后的結(jié)果中還包括了每個(gè)變異位點(diǎn)的位置信息以及其他信息，在此不做贅述。

具體的，在本步驟中，可以包括如下一種或多種刪除不滿足預(yù)設(shè)保留條件的變異位點(diǎn)的方式：

方式一：去除所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，等位基因的個(gè)數(shù)大于預(yù)設(shè)閾值的變異位點(diǎn)。

等位基因大于預(yù)設(shè)閾值的變異位點(diǎn)，是假陽(yáng)性變異位點(diǎn)的可能性較高，對(duì)其進(jìn)行去除。在本實(shí)施例中，該預(yù)設(shè)閾值可以根據(jù)實(shí)際需要取值，由于包含大于1個(gè)以上等位基因的位點(diǎn)就具有較高的基因分型錯(cuò)誤，優(yōu)選的，該預(yù)設(shè)閾值的取值可以為1。

當(dāng)預(yù)設(shè)閾值取值為1，即去除獲得的多個(gè)初步變異位點(diǎn)中具有1個(gè)以上等位基因的變異位點(diǎn)。

方式二：刪除所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，位于每個(gè)插入缺失(indel)的上游范圍或者下游范圍內(nèi)的所有變異位點(diǎn)，所述上游范圍和下游范圍包括的堿基個(gè)數(shù)為預(yù)設(shè)個(gè)數(shù)。

由于用于數(shù)據(jù)比對(duì)的短序列常由二代測(cè)向平臺(tái)輸出，而二代測(cè)序平臺(tái)的短序列在靠近插入缺失(indel)的區(qū)域更容易產(chǎn)生錯(cuò)誤的比對(duì)，而上述處理過(guò)程中的本地重比對(duì)不能完全消除這一錯(cuò)誤。于是，將插入缺失上游范圍或者下游范圍內(nèi)的所有變異位點(diǎn)刪除，以降低假陽(yáng)性結(jié)果的可能性。

該上游范圍和下游范圍包括的堿基個(gè)數(shù)為預(yù)設(shè)個(gè)數(shù)，該預(yù)設(shè)個(gè)數(shù)可以由用戶根據(jù)實(shí)際需求確定，在本實(shí)施例中并不作限制，并且，上游范圍以及下游范圍的預(yù)設(shè)個(gè)數(shù)可以相同或者不同。

在本實(shí)施例中，上有范圍包括的堿基個(gè)數(shù)優(yōu)選為5個(gè)，下游范圍包括的堿基個(gè)數(shù)優(yōu)選為5個(gè)。即，確定初步變異位點(diǎn)中的所有indel，針對(duì)每一個(gè)indel，將其上游5bp(5個(gè)堿基)之內(nèi)的所有變異位點(diǎn)刪除，或者將其下游5bp之內(nèi)的所有變異位點(diǎn)刪除。

當(dāng)然，在本實(shí)施例中，可以只刪除indel的上游范圍內(nèi)的變異位點(diǎn)或者下游范圍內(nèi)的變異位點(diǎn)，也可以將indel的上游范圍內(nèi)的變異位點(diǎn)以及下游范圍內(nèi)的變異位點(diǎn)都刪除。

優(yōu)選的，在本實(shí)施例中，刪除的為插入缺失(indel)的上游范圍或者下游范圍內(nèi)的所有SNPs。

方式三：將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，彼此之間間隔預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)的變異位點(diǎn)刪除。

在本步驟中，將彼此靠近的變異位點(diǎn)刪除，即將彼此之間距離小于一定值的變異位點(diǎn)刪除。

在本實(shí)施例中，該預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)并不作為限制，可以根據(jù)實(shí)際需要設(shè)定。

優(yōu)選的，該預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)為4個(gè)，若存在彼此之間間隔的堿基個(gè)數(shù)小于4個(gè)的變異位點(diǎn)，將其刪除。也就是說(shuō)，刪除在彼此上游或下游5bp之內(nèi)的變異位點(diǎn)。

優(yōu)選的，該步驟中，刪除的為彼此之間間隔預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)的SNPs。

方式四：將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，對(duì)應(yīng)的GQ(Genotype quality)值小于預(yù)設(shè)GQ閾值的變異位點(diǎn)刪除。

GQ(Genotype quality)是一個(gè)后驗(yàn)概率(the phred-scaled probabilities)值，對(duì)于每一個(gè)位點(diǎn)，GQ值用以表示當(dāng)前獲得的基因分型結(jié)果中該位點(diǎn)不是真實(shí)情況的可能性，即表示獲得的在該位點(diǎn)該基因型存在的可能性。計(jì)算方式為：

GQ值＝-10*log10(P[error])，其中，P[error]表示相應(yīng)的位點(diǎn)不是真實(shí)情況的概率。

優(yōu)選的，在本實(shí)施例中，預(yù)設(shè)GQ閾值為20。經(jīng)驗(yàn)證，當(dāng)GQ閾值為20時(shí)，理論上的錯(cuò)誤率為1％。

方式五：將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，對(duì)應(yīng)的MQ(Mapping quality)值小于預(yù)設(shè)MQ閾值的變異位點(diǎn)刪除。

MQ表示在比對(duì)序列時(shí)的專一性(uniqueness)。當(dāng)同一個(gè)短序列可以比對(duì)到同一個(gè)基因組不同區(qū)域時(shí)，第一最好比對(duì)區(qū)域(the first best alignment)的比對(duì)分?jǐn)?shù)(alignment's score)與第二最好比對(duì)區(qū)域(the second best alignment)的比對(duì)分?jǐn)?shù)，兩者差異越大，表明比對(duì)的專一性越好，MQ的值就越高。

在本實(shí)施例中，認(rèn)為MQ值小于預(yù)設(shè)MQ閾值的變異位點(diǎn)具有較高的可能性為假陽(yáng)性，將其刪除。

優(yōu)選的，在本實(shí)施例中，預(yù)設(shè)MQ閾值取值為30。經(jīng)驗(yàn)證，MQ取值為30時(shí)，P[error]＝0.001，即相對(duì)于比對(duì)到當(dāng)前位置，比對(duì)到另一個(gè)位置的可能性最高為0.1％。

在本發(fā)明實(shí)施例中，方式一至方式五為可選的執(zhí)行方式，即在本步驟中，可采用其中的某一種方式、某幾種方式或者所有的方式。當(dāng)使用多種方式進(jìn)行不滿足預(yù)留條件的變異位點(diǎn)的刪除時(shí)，該多種方式之間的執(zhí)行順序并不作為限制。當(dāng)然，該多種方式也可以并行執(zhí)行。

另外，該步驟120中，當(dāng)有多種方式被順序執(zhí)行時(shí)，后續(xù)的步驟可以在前續(xù)步驟的基礎(chǔ)上執(zhí)行。例如，若執(zhí)行方式一的去除所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中等位基因的個(gè)數(shù)大于預(yù)設(shè)閾值的變異位點(diǎn)，以及方式三中的，將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中彼此之間間隔預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)的變異位點(diǎn)刪除，且先執(zhí)行方式一，再執(zhí)行方式三。則在方式三中，刪除的可以是方式一處理后的變異位點(diǎn)中彼此之間間隔預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)的變異位點(diǎn)。

步驟S120對(duì)初步變異位點(diǎn)進(jìn)行刪除過(guò)濾后，獲得的最終結(jié)果中的變異位點(diǎn)作為待測(cè)基因的待檢位點(diǎn)，可以以vcf格式文件表示。

步驟S130：將所述待檢位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，所述腫瘤基因庫(kù)中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置。

在本發(fā)明實(shí)施例中，首先建立腫瘤基因庫(kù)，該腫瘤基因庫(kù)中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置。

該腫瘤基因庫(kù)在步驟S130的比較之前建立。具體的，該建立過(guò)程可以是，獲取COSMIC基因數(shù)據(jù)庫(kù)、NCBI的clivar數(shù)據(jù)庫(kù)、其他國(guó)際國(guó)內(nèi)各大權(quán)威學(xué)術(shù)期刊雜志、基因檢測(cè)公司以及政府有關(guān)部門公布的基因數(shù)據(jù)庫(kù)中，與腫瘤相關(guān)的基因位點(diǎn)信息。主要獲取的為包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的堿基突變情況以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置的所述基因位點(diǎn)信息。

當(dāng)然，獲取基因位點(diǎn)信息的數(shù)據(jù)來(lái)源也可以是其他，在本實(shí)施例中并不作為限制。

進(jìn)一步的，獲取的基因位點(diǎn)信息中還可以包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的每種突變堿基對(duì)蛋白質(zhì)功能的影響，即獲取到某個(gè)變異位點(diǎn)的堿基由正常堿基突變到當(dāng)前的突變堿基，會(huì)對(duì)相應(yīng)的蛋白質(zhì)的功能產(chǎn)生何種影響。

當(dāng)然，在本實(shí)施例中，獲取的基因位點(diǎn)信息中還可以包括：每個(gè)突變位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因名字簡(jiǎn)寫、基因名字全稱、此位點(diǎn)在人類基因組中的坐標(biāo)、對(duì)應(yīng)的組織器官類型、基因突變類型、正常基因在此位點(diǎn)的堿基、臨床研究此位點(diǎn)的此種突變是否致病、原始突變發(fā)現(xiàn)的人群、原始突變攜帶者病人的性別、原始突變攜帶者病人的年紀(jì)、原始突變記錄的來(lái)源中的一種或多種。

再將所述基因位點(diǎn)信息中可信度低于預(yù)設(shè)標(biāo)準(zhǔn)的以及錯(cuò)誤的基因位點(diǎn)信息刪除，獲得的基因位點(diǎn)信息形成所述腫瘤基因庫(kù)。

在本實(shí)施例中，低于預(yù)設(shè)標(biāo)準(zhǔn)的基因位點(diǎn)信息包括以下至少一種：

1)從非SCI期刊或在業(yè)內(nèi)聲譽(yù)很差的期刊獲取到的基因位點(diǎn)信息，該業(yè)內(nèi)聲譽(yù)很差的期刊可以是影響因子低于一定值的期刊或其他評(píng)判標(biāo)準(zhǔn)下不滿足要求的期刊；2)記載該基因位點(diǎn)信息的原始文獻(xiàn)中所用的樣品數(shù)量低于一定值以至于不足以得出科學(xué)的結(jié)論的；3)在記載該基因位點(diǎn)的原始文獻(xiàn)中，該基因位點(diǎn)并不是文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)的最重要基因位點(diǎn)，該最重要的基因位點(diǎn)可以是獲取到的結(jié)果中前10％的位點(diǎn)。

錯(cuò)誤的基因位點(diǎn)信息包括以下至少一種：1)獲取的數(shù)據(jù)庫(kù)中記載該基因位點(diǎn)信息的原始文獻(xiàn)在實(shí)質(zhì)上并沒(méi)有報(bào)道此位點(diǎn)；2)記載該基因位點(diǎn)的原始文獻(xiàn)中，該基因位點(diǎn)的結(jié)果在統(tǒng)計(jì)學(xué)上為非顯著。

當(dāng)然，預(yù)設(shè)標(biāo)準(zhǔn)以及基因位點(diǎn)信息錯(cuò)誤的判定標(biāo)準(zhǔn)，在本實(shí)施例中并不作為限制，可以根據(jù)實(shí)際情況確定。

進(jìn)一步的，由于對(duì)腫瘤相關(guān)的基因研究不斷進(jìn)行，與腫瘤相關(guān)的基因的變異位點(diǎn)的突變情況會(huì)處于更新中，且在當(dāng)前的腫瘤基因庫(kù)中并不一定存在所有腫瘤的相關(guān)基因的變異位點(diǎn)突變情況，于是，在本發(fā)明實(shí)施例中，還包括每隔預(yù)設(shè)時(shí)間段對(duì)所述腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行更新。

具體的更新過(guò)程可以是，每隔預(yù)設(shè)時(shí)間段，獲取最新發(fā)表在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)雜志，如Nature，Nature Genetics等上發(fā)表的與腫瘤相關(guān)的研究論文，將獲得的研究論文中最新的與腫瘤相關(guān)的基因位點(diǎn)信息，刪除其中可信度低于預(yù)設(shè)標(biāo)準(zhǔn)的以及錯(cuò)誤的基因位點(diǎn)信息，加入到腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中以實(shí)現(xiàn)更新。

獲得腫瘤基因庫(kù)后，將待檢位點(diǎn)與腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較。

在本實(shí)施例中，該比較過(guò)程可以是在步驟S120的獲得待檢位點(diǎn)后直接進(jìn)行，也可以是由用戶觸發(fā)進(jìn)行。即在接收到用戶觸發(fā)的查詢請(qǐng)求后，執(zhí)行該步驟S130中的比較。

另外，也可以是，用戶輸入步驟S120中獲得的待檢位點(diǎn)中的一個(gè)或多個(gè)，步驟S130中將用戶輸入的待檢位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較。

另外，也可以是，用戶直接從腫瘤基因庫(kù)中獲取腫瘤相關(guān)的變異位點(diǎn)。具體的，用戶通過(guò)輸入輸出單元輸入基因名字、位點(diǎn)在基因組的坐標(biāo)等信息。在接收到用戶輸入的信息后，根據(jù)用戶輸入的信息在腫瘤基因庫(kù)中進(jìn)行查找，將查找結(jié)果，如基因名字、位點(diǎn)坐標(biāo)、堿基突變類型等各種信息進(jìn)行顯示。若腫瘤基因庫(kù)中查找到用戶輸入的信息，則證明該輸入信息對(duì)應(yīng)的基因位點(diǎn)與腫瘤相關(guān)，且存在堿基突變?？梢岳斫獾?，位點(diǎn)在基因組的坐標(biāo)即為位點(diǎn)的位置。

步驟S140：當(dāng)所述待檢位點(diǎn)中存在與所述腫瘤基因庫(kù)中位置相同且突變堿基相同的變異位點(diǎn)，獲得所述待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況。

當(dāng)比較結(jié)果為，待檢位點(diǎn)中存在與腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中相同的變異位點(diǎn)，則可以根據(jù)腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中該相同的變異位點(diǎn)確定該待測(cè)基因中有腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變，且突變情況與腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中該相同的變異位點(diǎn)一致。于是，可以獲得待測(cè)基因中有哪些與腫瘤相關(guān)的基因的變異位點(diǎn)以及每個(gè)與腫瘤相關(guān)的變異位點(diǎn)的具體突變情況，該突變情況包括在哪個(gè)位置的哪一個(gè)堿基突變?yōu)槟囊粋€(gè)堿基。

可以理解的，相同的變異位點(diǎn)指變異位點(diǎn)的位置相同且堿基突變情況相同，即在同一個(gè)位置具有相同的突變堿基，認(rèn)為是待檢位點(diǎn)中與腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中相同的變異位點(diǎn)。腫瘤對(duì)應(yīng)的基因即與腫瘤相關(guān)的基因。

于是，相關(guān)人員可以根據(jù)獲得的待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況，以及其他信息，如腫瘤相關(guān)基因的每種突變情況下可能的患病情況，確定該待測(cè)基因?qū)?yīng)的對(duì)象的腫瘤患病情況。

進(jìn)一步的，在本實(shí)施例中，還可以根據(jù)所述待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況，以及腫瘤數(shù)據(jù)庫(kù)中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的每種突變堿基對(duì)蛋白質(zhì)功能的影響，確定所述待測(cè)基因中每個(gè)變異位點(diǎn)的突變對(duì)蛋白質(zhì)功能的影響，從而可以確定待測(cè)基因?qū)?yīng)的對(duì)象(如對(duì)應(yīng)的人)的哪些與腫瘤相關(guān)的蛋白質(zhì)功能受到了影響，受到了哪些影響。以使相關(guān)專業(yè)人員可以根據(jù)蛋白質(zhì)功能的影響，結(jié)合其他信息，如蛋白質(zhì)功能改變與器官具體功能的作用關(guān)系等，判斷該待測(cè)基因?qū)?yīng)的對(duì)象的腫瘤疾病患病幾率以及可能患哪些腫瘤疾病。

當(dāng)然，在本發(fā)明實(shí)施例中，也可以是直接包括每種變異位點(diǎn)的突變情況對(duì)腫瘤疾病的致病情況，如某種腫瘤疾病的影響可能包括致病、可能致病、危險(xiǎn)因素、不確定、有沖突的研究結(jié)果、良性，其中某個(gè)位置某種突變堿基的致病情況為危險(xiǎn)因素，表明該位置有該種突變堿基的對(duì)象患該種腫瘤疾病的幾率非常高，需要注意預(yù)防。

第二實(shí)施例

本實(shí)施例提供了一種腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取裝置200，請(qǐng)參見(jiàn)圖4，該裝置200包括：

比對(duì)模塊210，用于將待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)，獲得待測(cè)基因的初步變異位點(diǎn)信息，所述初步變異位點(diǎn)信息中包括多個(gè)初步變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)初步變異位點(diǎn)的位置信息。

過(guò)濾模塊220，用于根據(jù)所述初步變異位點(diǎn)信息，將多個(gè)初步變異位點(diǎn)中不滿足預(yù)設(shè)保留條件的變異位點(diǎn)刪除，將刪除后獲得的所述待測(cè)基因中的變異位點(diǎn)作為待檢位點(diǎn)。

比較模塊230，用于將所述待檢位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，所述腫瘤基因庫(kù)中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置。

突變獲取模塊240，當(dāng)所述待檢位點(diǎn)中存在與所述腫瘤基因庫(kù)中位置相同且突變堿基相同的變異位點(diǎn)，用于獲得所述待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況。

進(jìn)一步的，腫瘤基因庫(kù)中還包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的每種突變堿基對(duì)蛋白質(zhì)功能的影響，本實(shí)施例中的突變獲取模塊240還用于根據(jù)所述待測(cè)基因中腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的位點(diǎn)突變情況，確定所述待測(cè)基因中每個(gè)變異位點(diǎn)的突變對(duì)蛋白質(zhì)功能的影響。

進(jìn)一步的，本實(shí)施例中，如圖4所示，還包括基因庫(kù)建立模塊250，用于建立腫瘤基因庫(kù)，所述基因庫(kù)建立模塊250包括：數(shù)據(jù)獲取單元251，用于獲取COSMIC基因數(shù)據(jù)庫(kù)、NCBI的clivar數(shù)據(jù)庫(kù)中與腫瘤相關(guān)的基因位點(diǎn)信息，所述基因位點(diǎn)信息中包括腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的每個(gè)變異位點(diǎn)的突變堿基以及每個(gè)變異位點(diǎn)所在位置。數(shù)據(jù)刪除單元252，用于將所述基因位點(diǎn)信息中可信度低于預(yù)設(shè)標(biāo)準(zhǔn)的以及錯(cuò)誤的基因位點(diǎn)信息刪除，獲得的基因位點(diǎn)信息形成所述腫瘤基因庫(kù)。

進(jìn)一步的，如圖5所示，該基因庫(kù)建立模塊250還包括更新單元253，用于每隔預(yù)設(shè)時(shí)間段對(duì)所述腫瘤基因庫(kù)進(jìn)行更新。

進(jìn)一步的，如圖6所示，在本實(shí)施例中，過(guò)濾模塊220包括以下一種或多種：第一刪除單元221，用于去除所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，等位基因的個(gè)數(shù)大于預(yù)設(shè)閾值的變異位點(diǎn)。第二刪除單元222，用于刪除所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，位于每個(gè)插入缺失的上游范圍或者下游范圍內(nèi)的所有變異位點(diǎn)，所述上游范圍和下游范圍包括的堿基個(gè)數(shù)為預(yù)設(shè)個(gè)數(shù)。第三刪除單元223，用于將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，彼此之間間隔預(yù)設(shè)堿基個(gè)數(shù)的變異位點(diǎn)刪除。第四刪除單元224，用于將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，對(duì)應(yīng)的GQ值小于預(yù)設(shè)GQ閾值的變異位點(diǎn)刪除。第五刪除單元225，用于將所述多個(gè)初步變異位點(diǎn)中，對(duì)應(yīng)的MQ值小于預(yù)設(shè)MQ閾值的變異位點(diǎn)刪除。

在本實(shí)例中，請(qǐng)參見(jiàn)圖7，比對(duì)模塊210可以包括：比對(duì)單元211，用于將所述待測(cè)基因的多個(gè)短序列與參考基因組進(jìn)行首次比對(duì)，獲得SAM格式的比對(duì)結(jié)果；去重單元212，用于對(duì)所述比對(duì)結(jié)果進(jìn)行去重，使對(duì)比到參考基因組的一個(gè)位置的短序列個(gè)數(shù)小于或等于1；重比對(duì)單元213，用于對(duì)去重后的對(duì)比結(jié)果進(jìn)行本地重比對(duì)；計(jì)算單元214，用于重新計(jì)算本地重比對(duì)后的比對(duì)結(jié)果中的堿基質(zhì)量分?jǐn)?shù)；初判單元215，用于根據(jù)所述堿基質(zhì)量分?jǐn)?shù)，對(duì)本地重比對(duì)后的對(duì)比結(jié)果進(jìn)行SNP和indel分析，獲得初步變異位點(diǎn)信息。

綜上所述，本發(fā)明實(shí)施例提供的腫瘤對(duì)應(yīng)的基因的突變位點(diǎn)的獲取方法及裝置，在獲得待測(cè)基因的待測(cè)位點(diǎn)后，將待測(cè)位點(diǎn)與腫瘤基因庫(kù)中對(duì)應(yīng)的基因的多個(gè)變異位點(diǎn)進(jìn)行比較，從而可以獲得該待測(cè)基因中的變異位點(diǎn)中與腫瘤相關(guān)的多個(gè)變異位點(diǎn)的突變情況，以用于輔助腫瘤疾病的可能患病情況的判斷。

需要說(shuō)明的是，本說(shuō)明書中的各個(gè)實(shí)施例均采用遞進(jìn)的方式描述，每個(gè)實(shí)施例重點(diǎn)說(shuō)明的都是與其他實(shí)施例的不同之處，各個(gè)實(shí)施例之間相同相似的部分互相參見(jiàn)即可。對(duì)于裝置類實(shí)施例而言，由于其與方法實(shí)施例基本相似，所以描述的比較簡(jiǎn)單，相關(guān)之處參見(jiàn)方法實(shí)施例的部分說(shuō)明即可。

在本申請(qǐng)所提供的幾個(gè)實(shí)施例中，應(yīng)該理解到，所揭露的裝置和方法，也可以通過(guò)其它的方式實(shí)現(xiàn)。以上所描述的裝置實(shí)施例僅僅是示意性的，例如，附圖中的流程圖和框圖顯示了根據(jù)本申請(qǐng)的多個(gè)實(shí)施例的裝置、方法和計(jì)算機(jī)程序產(chǎn)品的可能實(shí)現(xiàn)的體系架構(gòu)、功能和操作。在這點(diǎn)上，流程圖或框圖中的每個(gè)方框可以代表一個(gè)模塊、程序段或代碼的一部分，所述模塊、程序段或代碼的一部分包含一個(gè)或多個(gè)用于實(shí)現(xiàn)規(guī)定的邏輯功能的可執(zhí)行指令。也應(yīng)當(dāng)注意，在有些作為替換的實(shí)現(xiàn)方式中，方框中所標(biāo)注的功能也可以以不同于附圖中所標(biāo)注的順序發(fā)生。例如，兩個(gè)連續(xù)的方框?qū)嶋H上可以基本并行地執(zhí)行，它們有時(shí)也可以按相反的順序執(zhí)行，這依所涉及的功能而定。也要注意的是，框圖和/或流程圖中的每個(gè)方框、以及框圖和/或流程圖中的方框的組合，可以用執(zhí)行規(guī)定的功能或動(dòng)作的專用的基于硬件的系統(tǒng)來(lái)實(shí)現(xiàn)，或者可以用專用硬件與計(jì)算機(jī)指令的組合來(lái)實(shí)現(xiàn)。

另外，在本申請(qǐng)各個(gè)實(shí)施例中的各功能模塊可以集成在一起形成一個(gè)獨(dú)立的部分，也可以是各個(gè)模塊單獨(dú)存在，也可以兩個(gè)或兩個(gè)以上模塊集成形成一個(gè)獨(dú)立的部分。

所述功能如果以軟件功能模塊的形式實(shí)現(xiàn)并作為獨(dú)立的產(chǎn)品銷售或使用時(shí)，可以存儲(chǔ)在一個(gè)計(jì)算機(jī)可讀取存儲(chǔ)介質(zhì)中。基于這樣的理解，本申請(qǐng)的技術(shù)方案本質(zhì)上或者說(shuō)對(duì)現(xiàn)有技術(shù)做出貢獻(xiàn)的部分或者該技術(shù)方案的部分可以以軟件產(chǎn)品的形式體現(xiàn)出來(lái)，該計(jì)算機(jī)軟件產(chǎn)品存儲(chǔ)在一個(gè)存儲(chǔ)介質(zhì)中，包括若干指令用以使得一臺(tái)計(jì)算機(jī)設(shè)備(可以是個(gè)人計(jì)算機(jī)，服務(wù)器100，或者網(wǎng)絡(luò)設(shè)備等)執(zhí)行本申請(qǐng)各個(gè)實(shí)施例所述方法的全部或部分步驟。而前述的存儲(chǔ)介質(zhì)包括：U盤、移動(dòng)硬盤、只讀存儲(chǔ)器(ROM，Read-Only Memory)、隨機(jī)存取存儲(chǔ)器(RAM，Random Access Memory)、磁碟或者光盤等各種可以存儲(chǔ)程序代碼的介質(zhì)。需要說(shuō)明的是，在本文中，諸如第一和第二、另一等之類的關(guān)系術(shù)語(yǔ)僅僅用來(lái)將一個(gè)實(shí)體或者操作與另一個(gè)實(shí)體或操作區(qū)分開來(lái)，而不一定要求或者暗示這些實(shí)體或操作之間存在任何這種實(shí)際的關(guān)系或者順序。而且，術(shù)語(yǔ)“包括”、“包含”或者其任何其他變體意在涵蓋非排他性的包含，從而使得包括一系列要素的過(guò)程、方法、物品或者設(shè)備不僅包括那些要素，而且還包括沒(méi)有明確列出的其他要素，或者是還包括為這種過(guò)程、方法、物品或者設(shè)備所固有的要素。在沒(méi)有更多限制的情況下，由語(yǔ)句“包括一個(gè)……”限定的要素，并不排除在包括所述要素的過(guò)程、方法、物品或者設(shè)備中還存在另外的相同要素。

以上所述僅為本申請(qǐng)的優(yōu)選實(shí)施例而已，并不用于限制本申請(qǐng)，對(duì)于本領(lǐng)域的技術(shù)人員來(lái)說(shuō)，本申請(qǐng)可以有各種更改和變化。凡在本申請(qǐng)的精神和原則之內(nèi)，所作的任何修改、等同替換、改進(jìn)等，均應(yīng)包含在本申請(qǐng)的保護(hù)范圍之內(nèi)。應(yīng)注意到：相似的標(biāo)號(hào)和字母在下面的附圖中表示類似項(xiàng)，因此，一旦某一項(xiàng)在一個(gè)附圖中被定義，則在隨后的附圖中不需要對(duì)其進(jìn)行進(jìn)一步定義和解釋。

以上所述，僅為本申請(qǐng)的具體實(shí)施方式，但本申請(qǐng)的保護(hù)范圍并不局限于此，任何熟悉本技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員在本申請(qǐng)揭露的技術(shù)范圍內(nèi)，可輕易想到變化或替換，都應(yīng)涵蓋在本申請(qǐng)的保護(hù)范圍之內(nèi)。因此，本申請(qǐng)的保護(hù)范圍應(yīng)所述以權(quán)利要求的保護(hù)范圍為準(zhǔn)。