技術總結
本發(fā)明公開了一種miRNA調控蛋白質相互作用網絡的miRNA靶蛋白預測方法,包括如下步驟:首先構建三個子網絡:基于HIPPIE的人類蛋白質?蛋白質相互作用網絡、基于mirTARbase的miRNA?靶蛋白網絡和基于靶蛋白重疊構造的miRNA?miRNA網絡;然后根據蛋白質的獲得號和miRNA分子在miRbase數據庫中的ID號,合并三個子網絡,構建融合的miRNA?靶蛋白關聯關系網絡;最后基于牽連犯罪原則,表征miRNA?靶蛋白的關聯特征,使用隨機森林構建分類預測模型,預測潛在miRNA與靶蛋白相互作用關聯關系。本發(fā)明方法能更好地研究miRNA調控靶蛋白的多對多關系,具有較好的應用價值。
技術研發(fā)人員:鄒小勇;鐘文倩;李占潮;戴宗
受保護的技術使用者:廣東順德中山大學卡內基梅隆大學國際聯合研究院;中山大學;廣東藥科大學
文檔號碼:201611192397
技術研發(fā)日:2016.12.21
技術公布日:2017.03.22