本發(fā)明涉及影像醫(yī)學(xué),尤其涉及一種基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法及系統(tǒng)。
背景技術(shù):
1、ct是急性缺血性卒中,國(guó)際指南推薦的首選影像學(xué)檢查工具,但早期缺血病灶與正常腦組織差異極小,發(fā)病8小時(shí)內(nèi)肉眼往往難以鑒別,而溶栓治療的最佳時(shí)間窗只有4.5小時(shí),錯(cuò)過(guò)時(shí)間窗會(huì)導(dǎo)致不可逆的腦損傷。磁共振作為金標(biāo)準(zhǔn),數(shù)分鐘內(nèi)即可顯示明顯的病灶,但因其檢查時(shí)間長(zhǎng)、檢查費(fèi)用貴和金屬禁忌癥等缺陷,不適合用于急診?,F(xiàn)有方法有策略解決該問(wèn)題:
2、(1)以mri為金標(biāo)準(zhǔn)對(duì)ct進(jìn)行缺血病灶進(jìn)行分割標(biāo)注,通過(guò)cnn、transformer網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建ai模型,實(shí)現(xiàn)基于ct的缺血灶自動(dòng)分割。但由于早期病灶不可見(jiàn),ai模型給出結(jié)論后,醫(yī)生很難進(jìn)行判斷是否接受該結(jié)果;
3、(2)以ct生成虛擬的mri,但其他人的研究?jī)H僅能對(duì)存在病灶的ct切面(疑似急性缺血性卒中患者的頭部ct,包含約30個(gè)切面,急性期僅有幾個(gè)切面存在缺血病灶),進(jìn)行mri切面的生成。使用該ai模型,需要用醫(yī)生先判斷切面是否包含缺血灶,對(duì)于實(shí)際臨床應(yīng)用困難。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是針對(duì)上述現(xiàn)有技術(shù)的不足,提供一種基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法及系統(tǒng)。
2、本發(fā)明解決上述技術(shù)問(wèn)題的技術(shù)方案如下:一種基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法,包括如下步驟:
3、獲取腦部的ct圖像和dwi圖像并進(jìn)行配對(duì),將配對(duì)的ct圖像和dwi圖像進(jìn)行預(yù)處理,并生成樣本集;
4、構(gòu)建用于根據(jù)ct圖像生成虛擬dwi圖像的轉(zhuǎn)換模型,并將所述樣本集中預(yù)處理后的ct圖像和dwi圖像輸入至所述轉(zhuǎn)換模型進(jìn)行訓(xùn)練;
5、將預(yù)處理后的目標(biāo)ct圖像輸入至訓(xùn)練后的轉(zhuǎn)換模型中,得到目標(biāo)虛擬dwi圖像。
6、本發(fā)明的有益效果是:本發(fā)明的基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法,通過(guò)將配對(duì)ct圖像和dwi圖像進(jìn)行預(yù)處理,并對(duì)構(gòu)建基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的轉(zhuǎn)換模型進(jìn)行訓(xùn)練,通過(guò)轉(zhuǎn)換模型的編碼器提取目標(biāo)ct圖像的不同尺度特征圖,并對(duì)其進(jìn)行特征轉(zhuǎn)換處理,在解碼過(guò)程中,轉(zhuǎn)換后的特征圖與解碼器的特征圖逐層拼接,經(jīng)過(guò)迭代,得到目標(biāo)虛擬dwi圖像,可以精確捕捉到ct圖像中的病灶信息,從而生成更為精確的dwi圖像,并且對(duì)噪聲不敏感。
7、在上述技術(shù)方案的基礎(chǔ)上,本發(fā)明還可以做如下改進(jìn):
8、進(jìn)一步:所述將配對(duì)的ct圖像和dwi圖像進(jìn)行預(yù)處理具體包括如下步驟:
9、對(duì)配對(duì)的ct三維圖像和dwi三維圖像進(jìn)行切片處理,得到ct二維圖像和dwi二維圖像;
10、根據(jù)預(yù)設(shè)像素閾值范圍對(duì)所述ct二維圖像的像素值進(jìn)行裁剪,并將裁剪后的ct二維圖像與dwi二維圖像進(jìn)行歸一化處理;
11、利用大津算法計(jì)算歸一化后的所述dwi二維圖像的掩碼圖像,利用最大連通域去除所述掩碼圖像中小于預(yù)設(shè)像素點(diǎn)閾值的離散區(qū)域,并將所述掩碼圖像分別與歸一化后的所述ct二維圖像和dwi二維圖像相乘,得到預(yù)處理后的ct二維圖像和dwi二維圖像;
12、根據(jù)預(yù)處理后的ct二維圖像和dwi二維圖像生成樣本集。
13、上述進(jìn)一步方案的有益效果是:通過(guò)對(duì)配對(duì)的所述ct三維圖像和dwi三維圖像進(jìn)行切片處理,即可得到對(duì)應(yīng)的ct二維圖像和dwi二維圖像,然后進(jìn)行像素值進(jìn)行裁剪,并將所述ct二維圖像與dwi二維圖像進(jìn)行歸一化處理,以便在不同的掃描圖像中獲得一直的灰度值范圍,便于圖像比較和分析,通過(guò)去噪處理,可以避免ct二維圖像的顱骨和其它噪聲對(duì)模型訓(xùn)練時(shí)造成影響。
14、進(jìn)一步:所述將所述樣本集中預(yù)處理后的ct圖像和dwi圖像輸入至所述轉(zhuǎn)換模型進(jìn)行訓(xùn)練具體包括如下步驟:
15、所述轉(zhuǎn)換模型利用編碼器對(duì)輸入的樣本集中預(yù)處理后的ct二維圖像進(jìn)行不同尺度的特征圖提取,得到不同尺度的特征圖,特征圖提取公式如下:
16、e1=lrelu(in(con4×4(x)))
17、e2=lrelu(in(con4×4(e1)))
18、e3=lrelu(in(con4×4(e2)))
19、e4=lrelu(in(con4×4(e3)))
20、其中,x為輸入的ct二維圖像,con4×4表示4×4的卷積操作,in表示編碼器的instancenorm2d層,lrelu表示leaky?relu激活函數(shù),e1表示編碼器第一層的輸出特征圖,e2表示編碼器第二層的輸出特征圖;e3表示編碼器第三層的輸出特征圖,e4表示編碼器第四層的輸出特征圖;
21、對(duì)不同尺度的所述特征圖分別進(jìn)行特征轉(zhuǎn)換處理,得到對(duì)應(yīng)的特征轉(zhuǎn)換圖;
22、將所述特征轉(zhuǎn)換圖進(jìn)行解碼,在解碼過(guò)程中,特征轉(zhuǎn)換后的特征圖與解碼特征逐層拼接,經(jīng)過(guò)迭代,得到虛擬dwi圖像;
23、構(gòu)建損失函數(shù),利用所述損失函數(shù)計(jì)算所述虛擬dwi圖像與預(yù)處理后的dwi二維圖像之間的損失值,并將損失值最小的模型參數(shù)作為所述轉(zhuǎn)換模型的參數(shù),完成訓(xùn)練。
24、上述進(jìn)一步方案的有益效果是:通過(guò)對(duì)預(yù)處理后的ct二維圖像進(jìn)行不同尺度的特征圖提取,得到不同尺度的特征圖,進(jìn)而可以對(duì)不同尺度的特征圖進(jìn)行特征轉(zhuǎn)換處理,得到特征轉(zhuǎn)換圖,然后進(jìn)行解碼迭代拼接處理,最終即可得到虛擬dwi圖像,然后根據(jù)虛擬dwi圖像與預(yù)處理后的dwi二維圖像之間的損失值來(lái)選擇最后的參數(shù)作為轉(zhuǎn)換模型的識(shí)別參數(shù),使得轉(zhuǎn)換模型具備較高精度的識(shí)別功能。
25、進(jìn)一步:所述對(duì)不同尺度的所述特征圖分別進(jìn)行特征轉(zhuǎn)換處理,得到對(duì)應(yīng)的特征轉(zhuǎn)換圖具體包括如下步驟:
26、分別將所述轉(zhuǎn)換模型的編碼器第一層輸出的特征圖e1和第二層輸出的特征圖e2進(jìn)行第一特征轉(zhuǎn)換處理,得到轉(zhuǎn)換特征圖e1′和e2′,第一特征轉(zhuǎn)換公式如下:
27、e1′=(relu(con3×3(e1)))5
28、e2′=(relu(con3×3(e2)))5
29、其中,con3×3表示3×3的卷積操作,relu表示relu激活函數(shù),(·)5表示進(jìn)行五次3×3卷積操作和relu激活,e1′和e2′分別表示編碼器第一層和第二層輸出特征圖經(jīng)過(guò)第一特征轉(zhuǎn)換的轉(zhuǎn)換特征圖;
30、分別將所述轉(zhuǎn)換模型的編碼器第三層輸出的特征圖e3和第四層輸出的特征圖e4進(jìn)行第二特征轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)處理,得到轉(zhuǎn)換特征圖e3″′和e4″′,第二特征轉(zhuǎn)換公式如下:
31、e3′=flatten(e3)
32、e3″=(relu(linear(e3′))))5
33、e3″′=reshape(e3″,(b1,c1,h1,w1))
34、e4′=flatten(e4)
35、e4″=(relu(linear(e4′))))5
36、e4″′=reshape(e4″,(b2,c2,h2,w2))
37、其中,flatten表示將輸入的特征圖e3展平為一維向量,linear表示全連接層,relu表示relu激活函數(shù),(·)5表示進(jìn)行五次全連接操作和relu激活,reshape表示將一維向量重新整形為指定的多維張量形狀,e3′和e4′方便表示所述轉(zhuǎn)換模型中編碼器第三層輸出特征圖和第四層輸出特征圖經(jīng)過(guò)展平操作后的一維向量,e3″和e4″分別表示經(jīng)過(guò)第二特征轉(zhuǎn)換后的第三層輸出特征圖和第四層輸出特征圖對(duì)應(yīng)的一維向量;(b1,c1,h1,w1)和(b2,c2,h2,w2)分別表示編碼器第三層和第四層輸出的特征圖的批量大小、通道數(shù)、高度、寬度,e3″′和e4″′表示經(jīng)過(guò)整形后的轉(zhuǎn)換特征圖。
38、上述進(jìn)一步方案的有益效果是:通過(guò)將所述轉(zhuǎn)換模型的編碼器第一層輸出的特征圖e1和第二層輸出的特征圖e2與第三層輸出的特征圖e3和第四層輸出的特征圖e4分別進(jìn)行不同的特征轉(zhuǎn)換處理,得到對(duì)應(yīng)的特征轉(zhuǎn)換圖,作為后續(xù)拼接還原虛擬dwi的基礎(chǔ)。
39、進(jìn)一步:所述將所述特征轉(zhuǎn)換圖與所述轉(zhuǎn)換模型的解碼器解碼的特征圖進(jìn)行拼接處理,得到虛擬dwi圖像具體包括如下步驟:
40、所述轉(zhuǎn)換模型的解碼器對(duì)所述轉(zhuǎn)換特征圖e3″′、e4″′、e1′和e2′進(jìn)行解碼,并將解碼后的轉(zhuǎn)換特征圖進(jìn)行迭代拼接處理,得到虛擬dwi圖像,拼接公式如下:
41、
42、d4=tanh(up(con4×4(d3)))
43、其中,cont4×4表示4×4的轉(zhuǎn)置卷積操作,con4×4表示4×4的卷積操作,in表示instancenorm2d層,relu表示relu激活函數(shù),up表示上采樣操作,表示兩個(gè)特征圖在通道維度進(jìn)行拼接操作,tanh表示tanh激活函數(shù)、d1、d2和d3分別表示所述轉(zhuǎn)換模型的解碼器第一層,第二層和第三層的輸出特征圖,d4為最終生成的虛擬dwi圖像。
44、上述進(jìn)一步方案的有益效果是:通過(guò)將所述解碼器對(duì)所述轉(zhuǎn)換特征圖e3″′、e4″′、e1′和e2′進(jìn)行解碼,然后進(jìn)行迭代拼接處理,可以非常精確地還原出虛擬dwi圖像,作為臨床醫(yī)護(hù)人員的參考,以便于在沒(méi)有mri圖像的情況下快速根據(jù)ct圖像得到虛擬dwi圖像,從而快速準(zhǔn)確地作出診斷,最大限度地拯救患者。
45、進(jìn)一步:所述的基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法還包括如下步驟:
46、計(jì)算所述虛擬dwi圖像與所述樣本集中配對(duì)的真實(shí)dwi圖像的結(jié)構(gòu)相似性值,并根據(jù)所述結(jié)構(gòu)相似性值對(duì)所述虛擬dwi圖像進(jìn)行評(píng)估。
47、進(jìn)一步:所述結(jié)構(gòu)相似性值的計(jì)算公式為:
48、
49、其中,x為虛擬dwi圖像,y為真實(shí)dwi圖像,μx和μy表示虛擬dwi圖像和真實(shí)dwi圖像的均值,δx和δy表示虛擬dwi圖像和真實(shí)dwi圖像的方差,c1和c2為常數(shù)。
50、上述進(jìn)一步方案的有益效果是:通過(guò)計(jì)算虛擬dwi圖像與所述樣本集中配對(duì)的真實(shí)dwi圖像的結(jié)構(gòu)相似性值,可以評(píng)價(jià)二者圖像的相似度,從而可以更好地模擬對(duì)圖像的感知。
51、本發(fā)明還提供了一種基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成系統(tǒng),包括預(yù)處理模塊、構(gòu)建模塊和訓(xùn)練轉(zhuǎn)換模塊,
52、所述預(yù)處理模塊,用于獲取腦部的ct圖像和dwi圖像并進(jìn)行配對(duì),將配對(duì)的ct圖像和dwi圖像進(jìn)行預(yù)處理,并生成樣本集;
53、所述構(gòu)建模塊,構(gòu)建用于根據(jù)ct圖像生成虛擬dwi圖像的轉(zhuǎn)換模型,并將所述樣本集中預(yù)處理后的ct圖像和dwi圖像輸入至所述轉(zhuǎn)換模型進(jìn)行訓(xùn)練;
54、所述訓(xùn)練轉(zhuǎn)換模塊,將預(yù)處理后的目標(biāo)ct圖像輸入至訓(xùn)練后的轉(zhuǎn)換模型中,得到目標(biāo)虛擬dwi圖像。
55、本發(fā)明還提供了一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,所述計(jì)算機(jī)程序被處理器執(zhí)行時(shí),實(shí)現(xiàn)所述的基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法。
56、本發(fā)明還提供了一種基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成設(shè)備,包括通信接口、存儲(chǔ)器、通信總線(xiàn)和處理器,其中,所述處理器、通信接口和存儲(chǔ)器通過(guò)所述通信總線(xiàn)完成相互間的通信;
57、所述存儲(chǔ)器,用于存放計(jì)算機(jī)程序;
58、所述處理器,用于執(zhí)行所述存儲(chǔ)器上所存放的程序時(shí),實(shí)現(xiàn)所述的基于多尺度特征轉(zhuǎn)換的腦卒中虛擬dwi圖像的生成方法的步驟。