自動生成基因檢測報告的方法及裝置的制造方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及一種自動生成基因檢測報告的方法及裝置。
【背景技術(shù)】
[0002] 基因檢測是從染色體結(jié)構(gòu)、DNA序列、DNA變異位點或基因表達程度，提供給受檢 者與醫(yī)療研究人員評估一些與基因遺傳有關(guān)的疾病、體質(zhì)或個人特質(zhì)的依據(jù)。
[0003] 基因檢測報告是以可供受檢者與臨床研究人員看得懂的方式來展現(xiàn)基因檢測結(jié) 果，它不僅包括基因檢測的直接結(jié)果，還包括了對結(jié)果的解讀。其中，對結(jié)果的解讀可以提 供對患病風(fēng)險的預(yù)測和預(yù)防建議，可供受檢者和臨床醫(yī)生參考，具有很重要的實用價值。目 前，許多基因檢測機構(gòu)出具的基因檢測報告幾乎都是依靠手工錄入的方式。
[0004] 但是，手工摘錄需要耗費大量的時間，準(zhǔn)確性不能得到保證。另外，如果有新的研 究發(fā)現(xiàn)，不能及時地更新報告。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005] 本發(fā)明主要解決的技術(shù)問題是提供一種自動生成基因檢測報告的方法及裝置，能 夠節(jié)約大量時間，保證準(zhǔn)確性，及時使基因檢測報告得到更新。
[0006] 為解決上述技術(shù)問題，本發(fā)明采用的一個技術(shù)方案是：提供一種自動生成基因檢 測報告的方法，包括：獲取受檢對象的遺傳信息和樣本信息；通過所述遺傳信息查詢基因 數(shù)據(jù)庫，獲取與所述遺傳信息對應(yīng)的表征信息，所述基因數(shù)據(jù)庫中保存有所述遺傳信息與 表征信息之間的對應(yīng)關(guān)系；調(diào)用基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將所述樣本信息和與所述 遺傳信息對應(yīng)的表征信息導(dǎo)入所述標(biāo)準(zhǔn)化模板中，自動生成基因檢測報告。
[0007] 其中，所述調(diào)用基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將所述樣本信息和與所述遺傳信 息對應(yīng)的表征信息導(dǎo)入所述標(biāo)準(zhǔn)化模板中，自動生成基因檢測報告的步驟之前，包括：確定 所述基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板的格式；采用拉泰赫LaTeX源代碼編寫所述基因檢測報告 的標(biāo)準(zhǔn)化模板。
[0008] 其中，所述遺傳信息是基因分型結(jié)果，所述表征信息是疾病信息，所述基因數(shù)據(jù)庫 是疾病基因數(shù)據(jù)庫。
[0009] 其中，所述調(diào)用基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將所述樣本信息和與所述遺傳信 息對應(yīng)的表征信息導(dǎo)入所述標(biāo)準(zhǔn)化模板中，自動生成基因檢測報告的步驟，包括：調(diào)用所述 基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板；將所述樣本信息和與所述基因分型結(jié)果對應(yīng)的疾病信息導(dǎo)入 所述標(biāo)準(zhǔn)化模板中；設(shè)置與疾病相關(guān)的篩選條件；根據(jù)所述與疾病相關(guān)的篩選條件，運行 所述生成基因檢測報告的純文本文件，獲得基因檢測報告的純文本文件；將所述基因檢測 報告的純文本文件生成便攜式文件格式TOF的基因檢測報告。
[0010] 其中，所述通過所述遺傳信息查詢基因數(shù)據(jù)庫，獲取與所述遺傳信息對應(yīng)的表征 信息的步驟之前，包括：從文獻資料或數(shù)據(jù)庫中提取所需的與所述遺傳信息相關(guān)的數(shù)據(jù)信 息；確定所述數(shù)據(jù)信息的數(shù)據(jù)格式；根據(jù)所述數(shù)據(jù)信息和所述數(shù)據(jù)格式建立所述基因數(shù)據(jù) 庫。
[0011] 為解決上述技術(shù)問題，本發(fā)明采用的另一個技術(shù)方案是：提供一種自動生成基因 檢測報告的裝置，所述裝置包括：第一獲取模塊，用于獲取受檢對象的遺傳信息和樣本信 息；第二獲取模塊，用于通過所述遺傳信息查詢基因數(shù)據(jù)庫，獲取與所述遺傳信息對應(yīng)的表 征信息，所述基因數(shù)據(jù)庫中保存有所述遺傳信息與表征信息之間的對應(yīng)關(guān)系；報告生成模 塊，用于調(diào)用基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將所述樣本信息和與所述遺傳信息對應(yīng)的表 征信息導(dǎo)入所述標(biāo)準(zhǔn)化模板中，自動生成基因檢測報告。
[0012] 其中，所述裝置還包括：第一確定模塊，用于確定所述基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板 的格式；編寫模塊，用于采用拉泰赫LaTeX源代碼編寫所述基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板。
[0013] 其中，所述遺傳信息是基因分型結(jié)果，所述表征信息是疾病信息，所述基因數(shù)據(jù)庫 是疾病基因數(shù)據(jù)庫。
[0014] 其中，所述報告生成模塊包括：調(diào)用單元，用于調(diào)用所述基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模 板；導(dǎo)入單元，用于將所述樣本信息和與所述基因分型結(jié)果對應(yīng)的疾病信息導(dǎo)入所述標(biāo)準(zhǔn) 化模板中；設(shè)置單元，用于設(shè)置與疾病相關(guān)的篩選條件；運行單元，用于根據(jù)所述與疾病相 關(guān)的篩選條件，運行所述生成基因檢測報告的純文本文件，獲得基因檢測報告的純文本文 件；生成單元，用于將所述基因檢測報告的純文本文件生成便攜式文件格式roF的基因檢 測報告。
[0015] 其中，所述裝置還包括：提取模塊，用于從文獻資料或數(shù)據(jù)庫中提取所需的與所述 遺傳信息相關(guān)的數(shù)據(jù)信息；第二確定模塊，用于確定所述數(shù)據(jù)信息的數(shù)據(jù)格式；建立模塊， 用于根據(jù)所述數(shù)據(jù)信息和所述數(shù)據(jù)格式建立所述基因數(shù)據(jù)庫。
[0016] 本發(fā)明的有益效果是：區(qū)別于現(xiàn)有技術(shù)的情況，本發(fā)明獲取受檢對象的遺傳信息 和樣本信息；通過遺傳信息查詢基因數(shù)據(jù)庫，獲取與遺傳信息對應(yīng)的表征信息；調(diào)用基因 檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將樣本信息和與遺傳信息對應(yīng)的表征信息導(dǎo)入標(biāo)準(zhǔn)化模板中， 自動生成基因檢測報告。由于通過遺傳信息獲取到表征信息后，調(diào)用標(biāo)準(zhǔn)模板，將樣本信息 和表征信息導(dǎo)入標(biāo)準(zhǔn)模板后，即可自動生成基因檢測報告，因而不用手工錄入，能夠節(jié)約大 量時間，避免人為誤差，可以保證準(zhǔn)確性，而且基因數(shù)據(jù)庫可以根據(jù)新的研究發(fā)現(xiàn)及時更新 相應(yīng)信息，從而能夠及時使基因檢測報告得到更新。
【附圖說明】
[0017] 圖1是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的方法一實施方式的流程圖；
[0018] 圖2是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的方法另一實施方式的流程圖；
[0019] 圖3是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的方法又一實施方式的流程圖；
[0020] 圖4是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的方法又一實施方式的流程圖；
[0021] 圖5是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的裝置一實施方式的結(jié)構(gòu)示意圖；
[0022] 圖6是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的裝置另一實施方式的結(jié)構(gòu)示意圖；
[0023] 圖7是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的裝置又一實施方式的結(jié)構(gòu)示意圖；
[0024] 圖8是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的裝置又一實施方式的結(jié)構(gòu)示意圖。
【具體實施方式】
[0025] 參閱圖1，圖1是本發(fā)明自動生成基因檢測報告的方法一實施方式的流程圖，包 括：
[0026] 步驟S101 :獲取受檢對象的遺傳信息和樣本信息。
[0027] 遺傳信息是指生物為復(fù)制與自己相同的東西，由親代傳遞給子代、或各細(xì)胞每次 分裂時由細(xì)胞傳遞給細(xì)胞的信息，即堿基對的排列順序（或指DNA分子的脫氧核苷酸的排 列順序）。此處的遺傳信息可以是代表個體差異性的遺傳信息、DNA突變的遺傳信息、或者 與基因遺傳疾病相關(guān)的遺傳信息等等。樣本信息主要是受檢對象的基本情況信息，如姓名、 性別、年齡、樣本類型、檢測日期、檢測單位等等。
[0028] 步驟S102 :通過遺傳信息查詢基因數(shù)據(jù)庫，獲取與遺傳信息對應(yīng)的表征信息，基 因數(shù)據(jù)庫中保存有遺傳信息與表征信息之間的對應(yīng)關(guān)系。
[0029] 表征信息是指根據(jù)遺傳信息可以表征在生物體表面、可以觀察到的個體差異性的 性狀表現(xiàn)，包括但不限于長相、身高、體重、膚色、性格等。
[0030] 由于基因數(shù)據(jù)庫中保存有遺傳信息與表征信息之間的對應(yīng)關(guān)系，因此，通過遺傳 信息查詢基因數(shù)據(jù)庫，可以獲取與遺傳信息對應(yīng)的表征信息。
[0031] 步驟S103 :調(diào)用基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將樣本信息和與遺傳信息對應(yīng)的 表征信息導(dǎo)入標(biāo)準(zhǔn)化模板中，自動生成基因檢測報告。
[0032] 基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板是按照預(yù)設(shè)要求創(chuàng)建完畢的，在獲得樣本信息和表征 信息后，調(diào)用標(biāo)準(zhǔn)化模板，即可自動生成基因檢測報告。
[0033] 本發(fā)明實施方式獲取受檢對象的遺傳信息和樣本信息；通過遺傳信息查詢基因數(shù) 據(jù)庫，獲取與遺傳信息對應(yīng)的表征信息；調(diào)用基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板，并將樣本信息和 與遺傳信息對應(yīng)的表征信息導(dǎo)入標(biāo)準(zhǔn)化模板中，自動生成基因檢測報告。由于通過遺傳信 息獲取到表征信息后，調(diào)用標(biāo)準(zhǔn)模板，將樣本信息和表征信息導(dǎo)入標(biāo)準(zhǔn)模板后，即可自動生 成基因檢測報告，因而不用手工錄入，能夠節(jié)約大量時間，避免人為誤差，可以保證準(zhǔn)確性， 而且基因數(shù)據(jù)庫可以根據(jù)新的研究發(fā)現(xiàn)及時更新相應(yīng)信息，從而能夠及時使基因檢測報告 得到更新。
[0034] 參閱圖2,如果基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板事先沒有創(chuàng)建好，那么在步驟S103之 前，還包括如下內(nèi)容：
[0035] 步驟S201 :確定基因檢測報告的標(biāo)準(zhǔn)化模板的格式。
[0036] 步驟S202 :采用拉泰赫LaTeX源