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      一種病毒RNA的提取試劑盒和提取方法與流程

      文檔序號:12411810閱讀:739來源:國知局
      本發(fā)明涉及分子生物學(xué)檢測
      技術(shù)領(lǐng)域
      ,更具體地,涉及一種病毒RNA的提取試劑盒和提取方法。
      背景技術(shù)
      :核酸提取是核酸檢測整個技術(shù)流程的第一步,也是分子生物學(xué)中最關(guān)鍵的方法之一。它是下游核酸檢測和科學(xué)研究的基礎(chǔ),抽提的核酸的質(zhì)量及其完整性會直接影響臨床研究或診斷的結(jié)果。一般的核酸提取過程包括兩大步驟:樣品的裂解和純化。裂解指使樣品中的核酸釋放到反應(yīng)體系中,純化則是指使核酸與反應(yīng)體系中的其它成分,如蛋白質(zhì)、鹽類以及其他雜質(zhì)徹底地分離。常用的RNA的提取方法有TRIZOL法、異硫氰酸胍法、CTAB-LiCl法及國內(nèi)外各生物公司的總RNA提取試劑盒等。RNA提取的經(jīng)典方法是TRIZOL法,它是一種基于異硫氰酸肌/苯酚/氯仿抽提原理的方法,該法適用范圍廣,動植物都適用,提取的RNA基本無基因組DNA的污染,但是該法操作步驟繁瑣,提取試劑中使用了苯酚、氯仿等有毒試劑,而且該法不適用于富含多糖多酚材料RNA的提取。CTAB-LiCl法常被用來提取植物組織RNA,但是由于CTAB本身是一個與SDS功能相類似的試劑,盡管它可和RNA以及DNA形成不溶的復(fù)合物,但CTAB法通常要結(jié)合其它操作,如再經(jīng)LiCl沉淀等步驟,使得該法操作繁瑣,并且在抽提時使用有毒試劑氯仿。傳統(tǒng)的提取試劑,由于提取得率相對較低,且步驟較為繁雜,給提取工作帶來一定影響,因此難以得到合格的RNA樣品。磁珠法是近幾年才發(fā)展起來的核酸提取方法。磁珠的直徑為幾十納米至數(shù)微米,在磁場下表現(xiàn)出磁性,由無機(jī)/有機(jī)或者無機(jī)/無機(jī)材料組成的外形呈現(xiàn)為球狀的復(fù)合粒子。磁珠法提取核酸不需要苯酚和氯仿等毒性大的有機(jī)溶劑,提取的核酸純度高、產(chǎn)量大。專利號為201010281633.6、201510023368.4等公開了提取病毒DNA或RNA的方法,但這些方法都是基于Chaotropic鹽(鹽酸胍、異硫氰酸胍、高氯酸鈉等)下裂解和吸附DNA或RNA,接著用一定比例的乙醇進(jìn)行洗滌,最后再將核酸釋放到洗脫液中。其中Chaotropic鹽是一種破壞分子力(氫鍵)穩(wěn)定性的一種鹽,它可使疏水性的蛋白質(zhì)更易溶于水,不能在低鹽干擾分子間的由非共價(jià)鍵(力)形成的相互作用,在Chaotropic鹽中磁珠吸附核酸的能力會有所增強(qiáng),目前國內(nèi)已公開的專利中提取RNA基本上都是在此基礎(chǔ)上衍生出來的?,F(xiàn)有技術(shù)很少有不基于Chaotropic鹽的提取RNA的方法。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是克服現(xiàn)有技術(shù)存在的上述缺陷,提供一種病毒RNA的提取試劑盒。本發(fā)明的第二個目的是提供一種利用上述RNA提取試劑盒對病毒RNA進(jìn)行核酸提取的方法。本發(fā)明的目的是通過以下技術(shù)方案予以實(shí)現(xiàn)的:一種病毒RNA的提取試劑盒,包括裂解結(jié)合液A、洗滌液B、洗脫液C和消解液D,所述裂解結(jié)合液A含有20~50mM蔗糖,20~50mM硫酸銨,10~50mMTris-HCl,1~5%(V/V)Brij-58,0.2~0.5mg/mL磁珠;pH值為4.5~5.5,所述洗滌液B含有1~5%(V/V)Brij-58,5~25mMTris-HCl,0.5~1mg/mL蛋白酶K,pH值為6~7。本發(fā)明試劑盒的工作原理:在消解液D的作用下,病毒的外殼被破壞掉,病毒核酸RNA被釋放出來,同時在裂解結(jié)合液A的作用下,使RNA可以結(jié)合到磁珠上,然后再通過洗滌液B對磁珠上的RNA進(jìn)行清洗,去除多余的鹽分及蛋白分子,最后通過洗脫液C使磁珠上的RNA洗脫下來。這里裂解結(jié)合液A的pH值保證在4.5~5.5,可保證RNA不被溶解,同時低PH值的環(huán)境利于磁珠吸附核酸,可以使核酸最大程度地結(jié)合在磁珠上面。優(yōu)選地,所述洗脫液C含有10~20mMTris-HCl,0.5mMEDTA,pH值為8.5。優(yōu)選地,所述消解液D含有20mg/mL蛋白酶K。優(yōu)選地,所述磁珠的粒徑為0.5~1μm。本發(fā)明還提供一種利用所述試劑盒進(jìn)行核酸提取的方法,包括以下步驟:S1.取樣本,加入消解液D和裂解結(jié)合液A,混勻離心后,吸棄上清液;S2.加入洗滌液B,混勻10min離心后,再次吸棄上清液;S3.加入洗滌液B,混勻1min離心后,再次吸棄上清液;S4.加入洗脫液C,溫浴一段時間,溫浴期間震蕩混勻,離心后,吸取上清液至新的離心管即得核酸。優(yōu)選地,S1所述樣本和裂解結(jié)合液A的混合體積比為1:3。優(yōu)選地,S4所述溫浴的條件為56~75℃,洗脫液C的加入體積為50~100μL。優(yōu)選地,S2和S3所述洗滌液B的加入體積為300~600μL。作為一種具體的實(shí)施方案,本發(fā)明所述進(jìn)行核酸提取的方法包括以下步驟:S1.將200μL新鮮血漿或血清樣本加入到1.5ml離心管內(nèi),向離心管內(nèi)加入20μ1消解液D和600μ1裂解結(jié)合液A,室溫混勻15分鐘,再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸棄上清;S2.向離心管中加入500μ1洗滌液B,室溫混勻10分鐘,再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸棄上清;S3.向離心管中加入500μ1洗滌液B,室溫混勻1分鐘,再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸棄上清;S4.向離心管中加入100μ1洗脫液C,溫浴6分鐘(期間需不停震蕩混勻),瞬時離心后再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸取上清至新的離心管中即可。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:本發(fā)明提供了一種病毒RNA的提取試劑盒,包括裂解結(jié)合液A、洗滌液B、洗脫液C和消解液D,所述裂解結(jié)合液A含有20~50mM蔗糖,20~50mM硫酸銨,10~50mMTris-HCl,1~5%(V/V)Brij-58,0.2~0.5mg/mL磁珠;pH值為4.5~5.5,所述洗滌液B含有1~5%(V/V)Brij-58,5~25mMTris-HCl,0.5~1mg/mL蛋白酶K,pH值為6~7;利用該試劑盒進(jìn)行RNA的提取,該方法不依賴傳統(tǒng)的Chaotropic鹽,在低鹽離子環(huán)境下即可裂解、吸附和洗滌RNA,同時洗滌液中不含醇類物質(zhì)(乙醇)即可去除相關(guān)的鹽分和雜質(zhì)。本發(fā)明的方法簡單可行,成本低廉且不含任何污染環(huán)境的成分。具體實(shí)施方式下面結(jié)合具體實(shí)施例進(jìn)一步闡述本發(fā)明。這些實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下例實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照本領(lǐng)域常規(guī)條件或按照制造廠商建議的條件。除非另行定義,文中所使用的所有專業(yè)與科學(xué)用語與本領(lǐng)域技術(shù)人員熟悉的意義相同。實(shí)施例1一種病毒RNA的提取試劑盒,包括裂解結(jié)合液A、洗滌液B、洗脫液C、消解液D(這里指20mg/mL蛋白酶K)。裂解結(jié)合液A組成為:20mM蔗糖,50mM硫酸銨,10mMTris-HCl(pH4.0),1%(V/V)Brij-58,0.5mg/ml磁珠,溶劑為高壓滅菌水,裂解結(jié)合液A的終pH為4.5。洗滌液B的組成為:1%(V/V)Brij-58,5mMTris-HCl(pH6.6),1mg/ml蛋白酶K,溶劑為高壓滅菌水,洗滌液B的終pH為6.6。洗脫液C的組成為:10mMTris-HCl,0.5mMEDTA水溶液,洗脫液C的終pH為8.5。采用上述試劑盒提取HIV-1血漿或血清樣本RNA,包括以下步驟:(1)將200μL新鮮HIV-1血漿或血清樣本加入到1.5ml離心管內(nèi),向離心管內(nèi)加入20μL消解液D和600μL裂解結(jié)合液A,室溫混勻15分鐘,再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸棄上清;(2)向離心管中加入500μL洗滌液B,室溫混勻10分鐘,再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸棄上清;(3)向離心管中加入500μL洗滌液B,室溫混勻1分鐘,再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸棄上清;(4)向離心管中加入100μ1洗脫液C,溫浴6分鐘(期間需不停震蕩混勻),瞬時離心后再將離心管置于磁力架上,磁力分離1min,吸取上清至新的離心管中。對照試劑選用QIAampViralRNAMiniKit提取的樣本量為200μl,洗脫體積為100μl。提取完成后,取上述核酸RNA提取液20μl作為模板,應(yīng)用達(dá)安基因的人類免疫缺陷綜合征病毒1型核酸檢測試劑盒(PCR熒光探針法)進(jìn)行檢測,檢測結(jié)果見下表1。表1不同樣本CT值比較樣本編號本發(fā)明檢測結(jié)果(CT值)Qiagen試劑檢測結(jié)果(CT值)124.2124.35235.9835.32330.4731.05427.1227.31532.3432.67636.21.36.01結(jié)果表明,利用本發(fā)明實(shí)施例1所述試劑盒提取核酸的效率與現(xiàn)有的核酸提取試劑的提取效率處于同一水平,因此,本發(fā)明在HIV-1RNA核酸提取應(yīng)用方面具有明顯優(yōu)勢。實(shí)施例2一種病毒RNA的提取試劑盒,包括裂解結(jié)合液A、洗滌液B、洗脫液C、消解液D(這里指20mg/mL蛋白酶K)。裂解結(jié)合液A組成為:30mM蔗糖,30mM硫酸銨,30mMTris-HCl(pH4.0),3%(V/V)Brij-58,0.4mg/ml磁珠,溶劑為高壓滅菌水,裂解結(jié)合液A的終pH為5.0。洗滌液B的組成為:3%(V/V)Brij-58,18mMTris-HCl(pH6.6),0.8mg/ml蛋白酶K,溶劑為高壓滅菌水,洗滌液B的終pH為6.0。洗脫液C的組成為:15mMTris-HCl,0.5mMEDTA水溶液,洗脫液C的終pH為8.5。實(shí)施例3一種病毒RNA的提取試劑盒,包括裂解結(jié)合液A、洗滌液B、洗脫液C、消解液D(這里指20mg/mL蛋白酶K)。裂解結(jié)合液A組成為:50mM蔗糖,20mM硫酸銨,50mMTris-HCl(pH4.0),5%(V/V)Brij-58,0.5mg/ml磁珠,溶劑為高壓滅菌水,裂解結(jié)合液A的終pH為5.5。洗滌液B的組成為:5%(V/V)Brij-58,25mMTris-HCl(pH6.6),0.5mg/ml蛋白酶K,溶劑為高壓滅菌水,洗滌液B的終pH為7.0。洗脫液C的組成為:20mMTris-HCl,0.5mMEDTA水溶液,洗脫液C的終pH為8.5。對比例1該對比例所用的RNA試劑盒同實(shí)施例一所述RNA試劑盒,唯一不同的是,裂解結(jié)合液A的pH值為7.0,利用實(shí)施例1所述方法進(jìn)行檢測,其結(jié)果表現(xiàn)為:對比例1的結(jié)果明顯差于實(shí)施例1,低濃度樣本無檢測結(jié)果。檢測結(jié)果如表2。表2不同樣本CT值比較樣本編號實(shí)施例1結(jié)果(CT值)對比例1檢測結(jié)果(CT值)124.5828.98235.12-330.0638.05427.3232.14532.5438.37636.83-對比例2該對比例所用的RNA試劑盒同實(shí)施例一所述RNA試劑盒,唯一不同的是,裂解液中Brij-58的濃度為(V/V)10%,利用實(shí)施例1所述方法進(jìn)行檢測,其結(jié)果表現(xiàn)為:對比例2的結(jié)果明顯差于實(shí)施例1,證明提取效率沒有達(dá)到最優(yōu)。檢測結(jié)果如表3。表3不同樣本CT值比較樣本編號實(shí)施例1結(jié)果(CT值)對比例2檢測結(jié)果(CT值)124.5827.17235.1238.72330.0632.15427.3229.52532.5434.37636.8338.85當(dāng)前第1頁1 2 3 
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