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      重組大腸桿菌及其生產(chǎn)L-甲硫氨酸的方法

      文檔序號:40357899發(fā)布日期:2024-12-18 13:35閱讀:21來源:國知局
      重組大腸桿菌及其生產(chǎn)L-甲硫氨酸的方法

      本發(fā)明涉及合成生物學(xué)領(lǐng)域,尤其涉及重組大腸桿菌及其生產(chǎn)l-甲硫氨酸的方法。


      背景技術(shù):

      1、l-甲硫氨酸(l-met),又名l-蛋氨酸,系統(tǒng)命名為(s)-2-氨基-4-甲硫基丁酸,屬于天冬氨酸家族氨基酸,也是8種必需氨基酸中唯一的含硫氨基酸。l-甲硫氨酸參與細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)甲基作用,在蛋白質(zhì)合成、免疫、抗氧化和脂質(zhì)代謝等方面發(fā)揮重要的作用,具有重要的生理功能。而且l-甲硫氨酸是家禽類飼料的第一限制性氨基酸,豬類飼料的第二限制性氨基酸,其作為飼料添加劑是最大的消費市場,在國內(nèi)的需求量也大幅度增加,另外,l-甲硫氨酸在食品添加劑、醫(yī)藥和化妝品等領(lǐng)域的需求也呈增長趨勢。

      2、l-甲硫氨酸的合成方法主要包括化學(xué)合成法、生物酶催化法與微生物發(fā)酵法。通過化學(xué)法合成l-甲硫氨酸時,所用原料及中間產(chǎn)物如甲硫醇、氰化物等對環(huán)境不友好,并且生成的產(chǎn)物多為d,l-甲硫氨酸,還需進一步的消旋處理才能得到目標(biāo)產(chǎn)物,操作比較繁瑣。生物酶催化法是先利用微生物發(fā)酵法生產(chǎn)l-高絲氨酸琥珀酸酯,再加入甲硫醇,通過酶法生產(chǎn)l-甲硫氨酸,具有成本較高、生產(chǎn)調(diào)控過程復(fù)雜等缺點,不利于大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn)。

      3、微生物發(fā)酵法是利用生物質(zhì)為原料高效合成l-甲硫氨酸,具有反應(yīng)條件溫和、對環(huán)境友好等優(yōu)點。如申請公布號為cn?118109378?a的發(fā)明專利,公開了一種高產(chǎn)l-甲硫氨酸的大腸桿菌工程菌及其全發(fā)酵法生產(chǎn)l-甲硫氨酸的方法,所述工程菌株以重組菌株m2/pam為出發(fā)菌株,在基因組上用強啟動子ptrc替換cyspuwam基因簇、cysh基因、trxb基因、trxc基因中一種或多種的原啟動子。最終得到的高產(chǎn)l-甲硫氨酸的大腸桿菌工程菌菌株,產(chǎn)量為3.21g/l。但是其在合成l-甲硫氨酸的過程中,依然存在著發(fā)酵培養(yǎng)基中硫源利用效率不高的問題,不利于l-甲硫氨酸產(chǎn)量的提升。


      技術(shù)實現(xiàn)思路

      1、為解決上述問題,第一方面,本發(fā)明重構(gòu)了質(zhì)粒以及導(dǎo)入了該質(zhì)粒的重組大腸桿菌,所述重組大腸桿菌能夠通過發(fā)酵培養(yǎng)生產(chǎn)l-甲硫氨酸。

      2、本發(fā)明解決上述問題的技術(shù)方案如下:

      3、本發(fā)明提供了一種質(zhì)粒,所述質(zhì)粒為pamz,其是在pam質(zhì)粒上過表達編碼o-琥珀酰高絲氨酸巰基化酶的metz基因得到,所述metz基因來源于銅綠假單胞菌pao1;所述質(zhì)粒pam是以ptrc99a質(zhì)粒為基礎(chǔ)增強metafbr、yjeh、serafbr的質(zhì)粒;所述metz基因的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。

      4、seq?id?no.1:

      5、atgactcaagactgggatgcaggtcgtcttgactctgacctggaaggcgctgcgttcgacaccttggcggttcgtgcaggtcagcgtcgtactccagaaggtgaacacggtgaagcgctgttcaccaccagctcttacgtgttccgtaccgcagctgatgctgctgctcgtttcgcaggtgaagttccgggtaacgtttactctcgttacaccaatccgaccgttcgtacctttgaagaacgtatcgcagcgctggaaggtgctgaacaggcggttgctaccgcttctggtatgtctgcaattctggcgctggttatgtctctgtgctcttctggtgatcacgttctggttagccgttctgtgttcggttccaccatctctctgttcgacaagtacttcaaacgtttcggtatccaggttgactatccgccgctgtctgacctggcagcatgggaagctgcgtgcaaaccgaacaccaaactgttcttcgttgaatctccgagcaatccgctggctgaactggttgacatcgcagcactggcagaaatcgctcacgctaaaggtgcgctgctggcggttgataactgcttctgcactccagcactgcaacagccgctgaaactgggtgctgatgttgtgatccactccgcgaccaaatacatcgacggtcagggccgtggtatgggtggtgtagtggcaggccgtggtgaacagatgaaagaagtggttggctttctgcgtaccgctggtccgaccttgtctccgttcaacgcttggctgtttctgaaaggcctggaaactctgcgtatccgtatgcaggcacactccgcatctgcgctggcattggcggaatggctggaacgtcagccaggtatcgaacgtgtttactacgctggtttgccatctcacccgcagcacgaactggcgcgtcgtcagcagtccggtttcggtgcggttgtttctttcgacgttaaaggtggtcgtgacgcagcttggcgtttcatcgacgcgactcgtatggttagcatcaccaccaaccttggcgatactaagaccactatcgcacatccagcgaccacctctcacggtcgtctgtctccagaagatcgtgcacgtgcaggtatcggtgattctctgatccgtgttgcagtaggtctggaagatttggacgacctgaaagcagacatggcacgtggtctggcagctctgtaa

      6、本發(fā)明還提供了一種質(zhì)粒,所述質(zhì)粒為pamzk,其是在所述的pamz質(zhì)粒上過表達編碼nad+激酶的ppnk基因獲得;所述ppnk基因來源于谷氨酸棒狀桿菌scgg2,所述ppnk基因的核苷酸序列如seq?id?no.2所示。

      7、seq?id?no.2:

      8、atgactgcgccaactaacgcaggtgaactgcgtcgtgttctgctggttccacacactgg?tcgtagctctaacatcgaatctgcgatcttggcggctaaactgctggatgacgcgggtatcgatgttcgtgttctgatcaacgatgcggatgatccaatcgctgaacatccggtattgggccgtttcactcacgttcgtcacgcggcagacgctgcggaaggtgctgaactggttctcgttctgggtggtgatggtacgtttctgcgtgcggcagacatggcgcacgctgttgacctgccggtgctgggtatcaacctgggtcacgttggctttctggctgaatgggaatctgactctctggaagaagctctgaaacgtgttatcgaccgtgactaccgtatcgaagatcgtatgaccttgaccgttgttgttctggacggtggtggtgaagaaatcggtcgtggttgggcgctgaacgaagtgtctatcgagaacctgaaccgtcgtggtgttctggatgctactctggaagttgatgctcgtccggttgcaagtttcggttgcgacggcgttctgatctctactccgactggttctactgcttacgcattcagcgcaggtggtccggttctgtggccagaactggatgcgattctggtagttccgaacaacgcacacgctctgttcaccaaaccgctggtggttagtccgaaatctactgttgctgttgaatctaactctgatacctctgctgctatggctgttatggacggtttccgtccgattccaatgccgccgggtagccgtgttgaagttactcgtggtgaacgtccggttcgttgggttcgtctggactcttccccattcaccgatcgtctggtttccaaactgcgtctgccagttaccggctggcgtggtccgcagaaacaggcggagaacaaagatccgcgtagcgcgggttaa

      9、本發(fā)明還提供了一種重組大腸桿菌,所述重組大腸桿菌通過將上述的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到底盤菌株中得到。

      10、作為優(yōu)選,所述底盤菌株為m2/pam;所述m2/pam的基因型為e.coliw3110δmetjδmetiδlysa?trc-meth?trc-metf?trc-cyse?trc-serb?trc-serc/pam。

      11、作為優(yōu)選,所述重組大腸桿菌為m2/pamz,其是以m2/pam為底盤菌株,在pam質(zhì)粒上過表達上述的metz基因得到。

      12、作為優(yōu)選,所述重組大腸桿菌是m2/pamzk,其是以上述的重組大腸桿菌m2/pamz為底盤菌株,在pamz質(zhì)粒上過表達上述的ppnk基因得到。

      13、作為優(yōu)選,所述底盤菌株為m2-hpbc/pam;所述m2-hpbc/pam的基因型為e.coliw3110δmetjδmetiδlysa?trc-meth?trc-metf?trc-cyse?trc-serb?trc-serc?trc-cysptrc-cysh?trc-trxb?trc-trxc/pam。

      14、底盤菌株m2-hpbc已在申請公布號為cn?118109378?a的發(fā)明專利中公開。

      15、作為優(yōu)選,所述重組大腸桿菌為m2-hpbc/pamz,其是以m2-hpbc/pam為底盤菌株,在pam質(zhì)粒上過表達上述的metz基因得到。

      16、作為優(yōu)選,所述重組大腸桿菌為m2-hpbc/pamzk,其是以上述的m2-hpbc/pamz為底盤菌株,在pamz質(zhì)粒上過表達上述的ppnk基因得到。

      17、上述重組大腸桿菌m2/pamz、m2/pamzk按如下步驟構(gòu)建:

      18、s1、以菌株m2/pam為底盤菌株,在質(zhì)粒上過表達經(jīng)過密碼子優(yōu)化的來源于銅綠假單胞菌pao1的o-琥珀酰高絲氨酸巰基化酶metz基因:以pam質(zhì)粒為模板,pam-x-f/pam-x-r引物獲得線性化質(zhì)粒pam;將線性化質(zhì)粒pam與seq?id?no.1所示密碼子優(yōu)化metz基因片段通過同源重組技術(shù)連接構(gòu)建質(zhì)粒pamz,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到菌株m2/pam感受態(tài)細(xì)胞中得到工程菌m2/pamz,即為能夠高產(chǎn)l-甲硫氨酸的重組大腸桿菌m2/pamz;

      19、s2、以菌株m2/pamz為底盤菌株,在質(zhì)粒上過表達經(jīng)過密碼子優(yōu)化的來源于谷氨酸棒狀桿菌scgg2的nad+激酶ppnk基因:以pamz質(zhì)粒為模板,pamz-x-f/pamz-x-r引物獲得線性化質(zhì)粒pamzk;將線性化質(zhì)粒pamz與seq?id?no.2所示密碼子優(yōu)化ppnk基因片段通過同源重組技術(shù)連接構(gòu)建質(zhì)粒pamzk,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到菌株m2/pamz感受態(tài)細(xì)胞中得到工程菌m2/pamzk,即為能夠高產(chǎn)l-甲硫氨酸的重組大腸桿菌m2/pamzk。

      20、第二方面,本發(fā)明還提供了上述的重組大腸桿菌生產(chǎn)l-甲硫氨酸的方法,將所述重組大腸桿菌接種至含有卡那霉素的lb培養(yǎng)基中,于35~39℃、180~220rpm的搖床上過夜培養(yǎng)12~14h,再將培養(yǎng)液以體積濃度3~8%接種量接種到硫源培養(yǎng)基中,發(fā)酵結(jié)束后,獲得含l-甲硫氨酸的發(fā)酵液;所述lb培養(yǎng)基包括:蛋白胨9~11g/l、酵母粉4~6g/l、氯化鈉9~11g/l,溶劑為去離子水。

      21、作為優(yōu)選,所述硫源培養(yǎng)基包括基礎(chǔ)培養(yǎng)基和硫源,基礎(chǔ)培養(yǎng)基(g/l)包括以下質(zhì)量份的組分:

      22、葡萄糖25.0~35.0、kh2po40.5~1.5、mgcl20.1~0.3、酵母粉1.5~2.5、feso4·7h2o?0.003~0.007、mnso4·8h2o?0.003~0.007、znso40.003~0.007,溶劑為去離子水,ph自然;

      23、所述硫源(g/l)選自以下質(zhì)量份組分的組合中的至少一種:

      24、(nh4)2so415.0~17.0和na2so41.0~3.0的組合、

      25、(nh4)2so415.0~17.0和na2s2o31.0~3.0的組合、

      26、(nh4)2so415.0~17.0和na2s2o30.5~1.5和na2so40.5~1.5的組合、

      27、(nh4)2so415.0~17.0和na2s2o30.5~1.5和(nh4)2s2o30.5~1.5的組合。

      28、作為優(yōu)選,所述硫源培養(yǎng)基(g/l)包括以下質(zhì)量份的組分:

      29、葡萄糖25.0~35.0、kh2po40.5~1.5、mgcl20.1~0.3、酵母粉1.5~2.5、feso4·7h2o?0.003~0.007、mnso4·8h2o?0.003~0.007、znso40.003~0.007、(nh4)2so412.0~20.0、na2s2o31.0~10,溶劑為去離子水,ph自然。

      30、作為優(yōu)選,所述硫源培養(yǎng)基中硫酸根與硫代硫酸根的質(zhì)量比為(2~10):(1~2)。

      31、作為優(yōu)選,所述硫源培養(yǎng)基中的發(fā)酵培養(yǎng)條件為:27~33℃、180r~220pm條件下發(fā)酵培養(yǎng)40~56h。

      32、l-甲硫氨酸,系統(tǒng)命名為(s)-2-氨基-4-甲硫基丁酸,在硫源培養(yǎng)基中,硫酸銨作為氮源和硫源,且硫代硫酸鈉與硫酸銨組合是適合生產(chǎn)l-甲硫氨酸的硫源組合,硫源物質(zhì)的利用率高。但培養(yǎng)基中含有硫代硫酸鈉時,會產(chǎn)生硫化氫,對重組大腸桿菌的生長造成傷害。

      33、通過查閱文獻發(fā)現(xiàn),其他微生物可以利用硫化氫合成l-甲硫氨酸,稱作直接巰基化途徑:即o-琥珀酰高絲氨酸巰基化酶以o-琥珀酰高絲氨酸作為底物,硫化氫作為硫供體,一步合成同型半胱氨酸,再通過甲基化生成l-甲硫氨酸。

      34、本發(fā)明在pam質(zhì)粒上過表達編碼o-琥珀酰高絲氨酸巰基化酶的metz基因得到pamz;并以m2/pam為底盤菌株,得到重組大腸桿菌m2/pamz,以m2-hpbc/pam為底盤菌株,得到重組大腸桿菌m2-hpbc/pamz。

      35、大腸桿菌合成l-甲硫氨酸需要消耗大量的輔因子,合成1mol?l-甲硫氨酸需要消耗8mol?nadph(還原型輔酶ⅱ),為提高胞內(nèi)nadph水平,因此引入谷氨酸棒狀桿菌scgg2編碼nad+激酶的ppnk基因。

      36、所以本發(fā)明在pamz質(zhì)粒上過表達編碼nad+激酶的ppnk基因獲得pamzk;并以m2/pamz為底盤菌株,得到重組大腸桿菌m2/pamzk,以m2-hpbc/pamz為底盤菌株,得到重組大腸桿菌m2-hpbc/pamzk。

      37、使用上述四種大腸桿菌在硫源培養(yǎng)基中通過發(fā)酵培養(yǎng)生產(chǎn)l-甲硫氨酸時,能夠減少硫化氫對細(xì)胞的毒害作用,有利于大腸桿菌生長和l-甲硫氨酸的合成。

      38、本發(fā)明具有以下有益效果:

      39、本發(fā)明通過重組大腸桿菌發(fā)酵培養(yǎng)生產(chǎn)l-甲硫氨酸,通過對發(fā)酵培養(yǎng)時使用的硫源培養(yǎng)基進行硫源優(yōu)化,提升硫源利用效率,進而提升l-甲硫氨酸產(chǎn)量;

      40、在優(yōu)化過程中利用醋酸鉛試紙檢測到培養(yǎng)基中有硫化氫的產(chǎn)生,因此在質(zhì)粒pam中引入表達編碼o-琥珀酰高絲氨酸巰基化酶的metz基因,得到質(zhì)粒pamz,并將其導(dǎo)入到菌株m2/pam、m2-hpbc/pam中,得到重組大腸桿菌m2/pamz和m2-hpbc/pamz,減少硫化氫對細(xì)胞的毒害作用,有利于提升l-甲硫氨酸產(chǎn)量,其中m2/pamz菌株的l-甲硫氨酸的產(chǎn)量在搖瓶水平上達到2.80g/l,m2-hpbc/pamz菌株的l-甲硫氨酸的產(chǎn)量在搖瓶水平上達到3.42g/l;

      41、進一步在質(zhì)粒pamz中引入表達編碼nad+激酶的ppnk基因,并將其導(dǎo)入到菌株m2/pamz、m2-hpbc/pamz中,得到重組大腸桿菌m2/pamzk和m2-hpbc/pamzk,提高胞內(nèi)nadph水平,進一步提升l-甲硫氨酸產(chǎn)量,其中,m2/pamzk菌株的l-甲硫氨酸的產(chǎn)量在搖瓶水平上達到3.05g/l,m2-hpbc/pamzk菌株的l-甲硫氨酸的產(chǎn)量在搖瓶水平上達到3.47g/l。

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