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      與番茄果實(shí)重量相關(guān)的KASP分子標(biāo)記及其應(yīng)用

      文檔序號(hào):40279921發(fā)布日期:2024-12-11 13:17閱讀:來源:國知局

      技術(shù)特征:

      1.單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)作為檢測(cè)靶點(diǎn)在篩選或鑒定番茄果實(shí)重量中的應(yīng)用,其特征在于,所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)為番茄基因組第9號(hào)染色體全長序列的第336003位,存在t>c的多態(tài)性;所述番茄基因組序列號(hào)為gcf_000188115.5。

      2.與番茄果實(shí)重量相關(guān)的kasp分子標(biāo)記,其特征在于,擴(kuò)增所述kasp分子標(biāo)記的引物組用于特異性檢測(cè)番茄基因組中第9號(hào)染色體全長序列的第336003位的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)存在t>c的多態(tài)性;所述番茄基因組序列號(hào)為gcf_000188115.5。

      3.如權(quán)利要求2所述的與番茄果實(shí)重量相關(guān)的kasp分子標(biāo)記,其特征在于,所述kasp分子標(biāo)記為以所述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)為坐標(biāo),截取上下游各40-100bp的核苷酸序列。

      4.如權(quán)利要求3所述的與番茄果實(shí)重量相關(guān)的kasp分子標(biāo)記,其特征在于,所述kasp分子標(biāo)記的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。

      5.一種篩選或鑒定番茄果實(shí)重量的檢測(cè)試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括用于特異性擴(kuò)增如權(quán)利要求2-4任一項(xiàng)所述的kasp分子標(biāo)記的引物組。

      6.如權(quán)利要求5所述的篩選或鑒定番茄果實(shí)重量的檢測(cè)試劑盒,其特征在于,擴(kuò)增所述kasp分子標(biāo)記的引物組包括特異性正向引物1、特異性正向引物2和通用反向引物,特異性正向引物1的核苷酸序列如seq?id?no.2所示,特異性正向引物2的核苷酸序列如seq?idno.3所示,通用反向引物的核苷酸序列如seq?id?no.4所示。

      7.如權(quán)利要求6所述的篩選或鑒定番茄果實(shí)重量的檢測(cè)試劑盒,其特征在于,特異性正向引物1和特異性正向引物2的5’端分別連接兩個(gè)不同的熒光標(biāo)簽序列。

      8.如權(quán)利要求7所述的篩選或鑒定番茄果實(shí)重量的檢測(cè)試劑盒,其特征在于,兩條特異性正向引物的5’端分別標(biāo)記fam基團(tuán)、hex基團(tuán)。

      9.一種篩選或鑒定不同番茄品種果實(shí)重量的方法,其特征在于,包括以下步驟:

      10.如權(quán)利要求9所述的篩選或鑒定不同番茄品種果實(shí)重量的方法,其特征在于,步驟(2)中,采用核苷酸序列如seq?id?no.2-4所示的引物組進(jìn)行pcr擴(kuò)增;步驟(3)中,當(dāng)鑒定基因分型為cc時(shí),判斷番茄果實(shí)重量較?。划?dāng)鑒定基因分型為tt時(shí),判斷番茄果實(shí)重量較大。


      技術(shù)總結(jié)
      本發(fā)明公開了與番茄果實(shí)重量相關(guān)的KASP分子標(biāo)記及其應(yīng)用,屬于包含核酸的測(cè)定方法技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明運(yùn)用全基因組關(guān)聯(lián)分析法獲得了與番茄果實(shí)重量相關(guān)的SNP位點(diǎn),為番茄基因組第9號(hào)染色體全長序列的第336003位,存在T>C的多態(tài)性,進(jìn)一步開發(fā)了相關(guān)的KASP分子標(biāo)記和KASP引物用于番茄果實(shí)重量的分型,在番茄群體中驗(yàn)證獲得了高度一致且界限清晰的群體分型效果。在選育過程中,根據(jù)其基因型判斷果實(shí)重量的等位變異,可在苗期便快速選擇出符合育種目標(biāo)大小的優(yōu)良群體,實(shí)現(xiàn)育種群體的早期篩選,加速番茄品種的分子育種進(jìn)程。

      技術(shù)研發(fā)人員:劉晨旭,程遠(yuǎn),萬紅建,王榮青,姚祝平,阮美穎,葉青靜,周國治,李志邈,洪幼芝
      受保護(hù)的技術(shù)使用者:浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
      技術(shù)研發(fā)日:
      技術(shù)公布日:2024/12/10
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