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      一種基于納米金的分子信標及其制備與應(yīng)用_2

      文檔序號:8407750閱讀:來源:國知局
      ,納米金表面探針數(shù)量可調(diào)控,探針能保 持直立構(gòu)象,利于后續(xù)雜交。
      [0050] 本發(fā)明的有益效果為:
      [0051] (1)分子信標探針設(shè)計:傳統(tǒng)的分子信標設(shè)計方案,通常是分子信標的環(huán)狀部位 與靶基因互補配對,實現(xiàn)雜交。但針對納米金連接的分子信標而言,該種雜交方式雜交效率 差。故在設(shè)計分子信標序列時,讓莖部的部分序列也與靶基因互補配對,既保持了分子信標 的莖環(huán)結(jié)構(gòu),又保證檢測的特異性,提高雜交效率。
      [0052] (2)分子信標探針與納米金的偶聯(lián):在偶聯(lián)過程中,由于DNA沒有完全覆蓋納米金 表面,使得納米金在鹽溶液中極易聚沉變色,故應(yīng)確定組裝條件,避免納米金聚沉。在傳統(tǒng) 的DNA-AuNPs偶聯(lián)物制備方法中,通常需要將DNA作特殊修飾,如巰基(-SH)修飾,然后再 Au-S鍵的作用下,將DNA組裝到AuNPs表面。但這樣的偶聯(lián)方法,成本太高。同時研宄發(fā) 現(xiàn):通過SH修飾的納米金探針,在雜交效率和雜交動力學上表現(xiàn)不佳。在制備三明治結(jié)構(gòu) 的納米金探針時,往往就需要過夜雜交。故本發(fā)明合成一段多聚A(p 〇ly A)的DNA序列,首 次實現(xiàn)了免標記DNA序列在納米金表面的組裝。該方法更簡單,成本更低。同時,還具有SH 組裝無法達到的效果:組裝密度可控,雜交效率及動力學提高。
      [0053] (3)本發(fā)明以納米金為分子信標淬滅基團,可連接帶有不同熒光基團的探針組 裝成多色納米分子信標,用于同時檢測多種目標分子。方法簡單,且納米金與熒光探針用 PolyA連接,合成成本大大降低。
      【附圖說明】
      [0054] 圖1:本發(fā)明檢測原理圖。
      [0055] 圖2 :本發(fā)明實施例1制備的納米金表征圖。
      [0056] 圖3 :對實施例2形成的分子信標與待測目標分子miR155進行雜交前后的焚光 進行檢測,獲得對應(yīng)的熒光圖譜:由上到下,上面一條曲線為分子信標未與待測目標分子 miR155進行雜交時的焚光曲線,下面一條曲線為分子信標未與待測目標分子miR155進行 雜交后的熒光曲線,可以發(fā)現(xiàn),雜交后的熒光曲線反而比雜交前的熒光曲線熒光值低,說明 采用短的T序列和PolyA連接納米金和熒光探針這種方式不成功。
      [0057] 圖4 :對形成的分子信標3-1和3-2進行紫外檢測,獲得對應(yīng)的紫外圖譜,由上 到下,最上面一條為單純的AuNPs紫外曲線;中間一條為PolyA20+Au形成的分子信標 3-2的紫外曲線,最高峰值A(chǔ)523 = 0.412,分子信標3-2的濃度為1.53nM;最下面一條為 PolyAlO+Au形成的分子信標3-1的紫外曲線,最高峰值A(chǔ)523 = 0. 385,分子信標3-1的濃 度為 I. 43nM。
      [0058] 圖5 :分子信標3-1所對應(yīng)焚光探針的標準曲線。
      [0059] 圖6 :分子信標3-2所對應(yīng)焚光探針的標準曲線。
      [0060] 圖7 :分子信標3-1所對應(yīng)熒光探針以及分子信標3-1經(jīng)MCH取代后所獲得的熒 光曲線圖,從上到下,第一條曲線表示濃度為IOOuM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線;第二條 曲線表示濃度為80uM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線;第三條曲線表示濃度為60uM的熒光 探針所對應(yīng)的熒光曲線;第四條曲線表示濃度為40uM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線;第 五條曲線表示經(jīng)MCH取代后分子信標3-1上連接的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線,其最高峰 (520nm處)對應(yīng)的熒光值為1873593 ;第六條曲線表示濃度為20uM的熒光探針所對應(yīng)的熒 光曲線;第七條曲線表示濃度為IOuM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線。
      [0061] 圖8 :分子信標3-2所對應(yīng)熒光探針以及分子信標3-2經(jīng)MCH取代后所獲得的熒 光曲線圖,由上到下,第一條曲線表示濃度為IOOuM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線;第二條 曲線表示濃度為80uM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線;第三條曲線表示濃度為60uM的熒光 探針所對應(yīng)的熒光曲線;第四條曲線表示濃度為40uM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線;第 五條曲線表示經(jīng)MCH取代后分子信標3-2上連接的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線,其最高峰 (520nm處)對應(yīng)的熒光值為1425361. 5 ;第六條曲線表示濃度為20uM的熒光探針所對應(yīng)的 熒光曲線;第七條曲線表示濃度為IOuM的熒光探針所對應(yīng)的熒光曲線。
      [0062] 圖9 :對分子信標3-1和分子信標3-2分別與待測目標分子miR155進行雜交后進 行熒光檢測,獲得對應(yīng)的熒光圖譜,由上到下,第一條曲線表示分子信標3-1與miR155雜交 后所得的熒光曲線,第二條曲線表示分子信標3-2與miR155雜交后所得的熒光曲線。說明: 兩條曲線均已扣除了未雜交時的背景熒光值。可以看出,連有P〇lyA20的分子信標3-2熒 光值更高。
      [0063] 圖10 :新設(shè)計的分子信標4-1與案例3中分子信標3-2的焚光圖譜進行比較,由上 到下,第一條曲線是分子信標4-1與miR155進行雜交所得的熒光曲線;第二條曲線是分子 信標3-2與miR155進行雜交所得的熒光曲線。說明:待測靶miRNA 155濃度均用200nM, 兩條曲線均已扣除未雜交時背景熒光值??梢钥闯?,新改良后的分子信標4-1熒光值明顯 升高(大約2倍)。證明新設(shè)計的分子信標4-1探針有效。
      [0064] 圖11 :由上到下,第一條曲線代表快速組裝調(diào)PH法所制備的分子信標與待測目標 分子miR155雜交后所得的熒光圖普,第二條曲線表示加鹽老化法所制備的分子信標與待 測目標分子miR155雜交后所得的熒光圖譜。
      [0065] 圖12 :圖a)表示原始分子信標3-2即只有環(huán)部序列與靶序列雜交,以及改進后 的分子信標4-1即莖環(huán)部同時與靶序列雜交所得的熒光圖;b)表示沒有A5共組裝獲得的 4-1,及有A5共組裝獲得的4-2的熒光值。
      [0066] 圖13 :對分子信標ΜΒ-1、ΜΒ-2、ΜΒ-3進行TEM表征,可看出連接了熒光探針的 AuNPs顆粒分散性良好,大小均一,說明連接熒光探針與納米金顆粒連接成功。
      [0067] 圖14 :對分子信標MB-1、MB-2、MB-3進行紫外表征,其中,曲線1表示未連接熒光 探針前的AuNPs顆粒紫外圖譜(最大吸收峰518nm),曲線2表示連接熒光探針形成了分子 信標后的紫外圖譜(紅移至525nm);可以看出兩條線稍有紅移,證明AuNPs顆粒與熒光探 針連接成功。
      [0068] 圖15 :圖a)為分子信標MB-I焚光探針標準曲線;圖b)為分子信標MB-2焚光探 針標準曲線;圖c)為分子信標MB-3熒光探針標準曲線。
      [0069] 圖16 :圖a)中,曲線1表不分子信標MB-I與Target DNAl雜交后的焚光曲線;曲 線2表不分子信標MB-I與Target DNA 1'雜交后的焚光曲線;曲線3表不未與任何物質(zhì) 雜交的分子信標MB-I自身的本底熒光曲線;圖b)中,曲線1表示分子信標MB-2與Target DNA2雜交后的熒光曲線;曲線2表示分子信標MB-2與Target DNA 2'雜交后的熒光曲線; 曲線3表示未與任何物質(zhì)雜交的分子信標MB-2自身的本底熒光曲線;圖c)中,曲線1表 不分子信標MB-3與Target DNA3雜交后的焚光曲線;曲線2表不分子信標MB-3與Target DNA 3'雜交后的熒光曲線;曲線3表示未與任何物質(zhì)雜交的分子信標MB-3自身的本底熒 光曲線。
      [0070] 圖17 :為米用分子信標檢測不同濃度革巴miR ΝΑ(0, 0· 01,0· 05, 0· 1,0· 5, 1,10, 50, 100, 150 及 200nM)所對應(yīng)的熒光值;圖 a)為采用分子 信標MB-I檢測Target miRNAl (miRNA155 segment)所得熒光曲線圖;圖b)為采用分子信 標MB-2檢測Target miRNA2(miRNA196a segment)所得熒光曲線圖;圖c)為采用分子信標 MB-3 檢測 Target miRNA3(miRNA210 segment)所得焚光曲線圖。
      【具體實施方式】
      [0071] 在進一步描述本發(fā)明【具體實施方式】之前,應(yīng)理解,本發(fā)明的保護范圍不局限于下 述特定的具體實施方案;還應(yīng)當理解,本發(fā)明實施例中使用的術(shù)語是為了描述特定的具體 實施方案,而不是為了限制本發(fā)明的保護范圍。
      [0072] 當實施例給出數(shù)值范圍時,應(yīng)理解,除非本發(fā)明另有說明,每個數(shù)值范圍的兩個端 點以及兩個端點之間任何一個數(shù)值均可選用。除非另外定義,本發(fā)明中使用的所有技術(shù)和 科學術(shù)語與本技術(shù)領(lǐng)域技術(shù)人員通常理解的意義相同。除實施例中使用的具體方法、設(shè)備、 材料外,根據(jù)本技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員對現(xiàn)有技術(shù)的掌握及本發(fā)明的記載,還可以使用與本 發(fā)明實施例中所述的方法、設(shè)備、材料相似或等同的現(xiàn)有技術(shù)的任何方法、設(shè)備和材料來實 現(xiàn)本發(fā)明。
      [0073] 除非另外說明,本發(fā)明中所公開的實驗方法、檢測方法、制備方法均采用本技術(shù) 領(lǐng)域常規(guī)的分子生物學、生物化學、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和分析、分析化學、細胞培養(yǎng)、重組DNA技 術(shù)及相關(guān)領(lǐng)域的常規(guī)技術(shù)。這些技術(shù)在現(xiàn)有文獻中已有完善說明,具體可參見Sambrook 等 MOLECULAR CLONING :A LABORATORY MANUAL,Second edition,Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989 and Third edition,2001;Ausubel 等,CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John ffiley&Sons, New York,1987 and periodic updates; the series METHODS IN ENZYM0L0GY, Academic Press, San Diego ;ffolffe, CHROMATIN STRUCTURE AND FUNCTION, Third edition, Academic Press, San Diego,1998 ;METH0DS IN ENZYM0L0GY, Vol. 304, Chromatin(P. M. Wassarman and A. P. ffolffe, eds.), Academic Press,San Diego,1999;和 METHODS IN MOLECULAR BI0L0GY,Vol.119, Chr
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