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      具有增強(qiáng)的ms信號(hào)的聚糖和其它生物分子的快速熒光標(biāo)記的制作方法_3

      文檔序號(hào):9659848閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

      [0117] X = CgScN;
      [0118] R1獨(dú)立地選自0 =C=N-、
      [0119] R2獨(dú)立地選自-H、-CfCs烷基、-CfCs環(huán)烷基、鹵素、二烷基氨基、CH2_二烷基氨基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但不是C1或0 =C=N-;且
      [0120] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán),但在R1是0 =C=N-時(shí)除外。
      [0121] 具有結(jié)構(gòu)式V的化合物以鹽形式提供如下:
      [0123] 其中
      [0124] m= 0-9 ;
      [0125] η= 0-9 ;
      [0126] X=CgScN;
      [0127] R1獨(dú)立地選自
      [0128] R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0129] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0130] R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外;
      [0131] R7獨(dú)立地選自-H或甲基;且
      [0132] Y是平衡離子。
      [0133] 本發(fā)明進(jìn)一步包含具有結(jié)構(gòu)式V-A的化合物:
      [0134]
      [0135] 或其鹽或溶劑化物,其中
      [0136] m= 0-9 ;
      [0137] η= 0-9 ;
      [0138] X=CgScN;
      [0139] R1是 0 =C=N-、S=C=N-、
      [0140] R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0141] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0142] R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外。
      [0143] 本發(fā)明還包括具有結(jié)構(gòu)式V-B的化合物:
      [0144]
      [0145] 或其鹽或溶劑化物,其中
      [0146] m= 0-9 ;
      [0147] η= 0-9 ;
      [0148] X=CgScN;
      [0149] R1 獨(dú)立地選自 0 =C=N-、S=C=N-
      [0150] R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0151] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0152] R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外。
      [0153] 本文額外提供具有結(jié)構(gòu)式¥1、¥11、¥111、¥1114、¥111-8、以、以4和以-8的化合 物,其可用于聚糖的快速熒光標(biāo)記以及隨后的液相色譜和質(zhì)譜分析并且在下方立即示出。 此外,本文記載的式IV、IV-A、IV-B、V、ν-Α、ν-Β、VIII、VIII-A、VIII-B、IX、IX-A和IX-B可 以全部被超過(guò)一個(gè)的其中定義的R2基團(tuán)取代。
      [0154] 式VI:
      [0155]
      [0158]R2獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、_C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但不是C1或0 =C=N-;且
      [0159]R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán),但在R1是0 =C=N-時(shí)除外。
      [0160] 式VII:
      [0161]
      [0162] 其中
      [0163] m= 0-9 ;
      [0164] η= 0-9 ;
      [0165]R1 獨(dú)立地選自 0 =C=N-、S=C=Ν-、
      [0166]R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0167]R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0168]R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外。
      [0169] 式VIII:
      [0170]
      [0171] 其中
      [0172] X=CgScN;
      [0173] R1獨(dú)立地選自0 =C=N-、
      [0174] R2獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、_C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但不是C1或0 =C=N-;且
      [0175] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基 氨基、烷基膦酸、或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的 5-至8-元飽和或部分不飽和環(huán),但在R1是0 =C=N-時(shí)除外。
      [0176] 式VIII-A:
      [0177]
      [0178] 其中
      [0179] X=CgScN;
      [0180] R1獨(dú)立地選自0 =C=N-、
      [0181] R2獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但不是C1或0 =C=N-;且
      [0182] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán),但在R1是0 =C=N-時(shí)除外。
      [0183] 式VIII-B:
      [0184]
      [0185] 其中
      [0186] X=CgScN;
      [0187] R1獨(dú)立地選自0 =C=N-、
      [0188] R2獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、_C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但不是C1或0 =C=N-;且
      [0189] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán),但在R1是0 =C=N-時(shí)除外。
      [0190] 式IX:
      [0191]
      [0192] 其中
      [0193] m= 0-9 ;
      [0194] η= 0-9 ;
      [0195] X = CgScN;
      [0196] R1 獨(dú)立地選自 0 =C=N-、S=C=N-、
      [0197] R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0198] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0199] R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外。
      [0200] 式IX-A:
      [0201]
      [0202] 其中
      [0203] m= 0-9 ;
      [0204] η= 0-9 ;
      [0205] X=C或N;
      [0206] R1 獨(dú)立地選自 0 =C=N-、S=C=N-、
      [0207] R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0208] R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基氨 基、烷基膦酸或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的5-至 8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0209] R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外。
      [0210] 式IX-B:
      [0211]
      [0212] 其中
      [0213] m= 0-9 ;
      [0214] η= 0-9 ;
      [0215] X=CgScN;
      [0216] R1 獨(dú)立地選自 0 =C=N-、S=C=N-、
      [0217] R2獨(dú)立地選自亞甲基、取代氮、氧、羰基、酰胺、酯、硫、亞砜或砜;
      [0218]R3和R4獨(dú)立地選自-H、烷基、烷基氨基、烷基磺酸、烷基膦酸,其中R3或R4為烷基 氨基、烷基膦酸、或烷基磺酸,以及其中R3和R4可與它們所連接的氮一起形成任選取代的 5-至8-元飽和或部分不飽和環(huán);且
      [0219] R5獨(dú)立地選自-H、_CfC8烷基、-C廠心環(huán)烷基、鹵素、二烷基氛基、CH2_二烷基氛基、 氨基羰基、烷氧基羰基、或烷氧基,但C1或0 =C=N-除外、且R1是S=C=N時(shí)除外。
      [0220] 下列方案I、II、III和IV可用于實(shí)現(xiàn)本發(fā)明并制備本文記載的化合物。
      [0221] 方案I
      [0222]
      [0223] 制備(2-((2-(二乙基氨基)乙基)氨基甲?;┼?6-基)氨基甲酸2, 5-二 氧代啦略燒_1_基酯
      [0224] 在裝有攪拌棒的10mL燒瓶中將40mgB溶解于2. 5mL1 : 4的二甲基甲酰胺:二 氯甲烷的混合物中并用N2吹掃。然后在燒瓶中加入1. 7mg二甲基氨基吡啶和181μL二環(huán) 己基碳二亞胺。攪拌lOmin之后,在燒瓶中加入含有2-(二乙基氨基)乙胺(57mg)的3mL 二氯甲烷。然后在室溫?cái)嚢?0小時(shí)。之后,將3mL水加入反應(yīng)燒瓶中。分離有機(jī)層,并且 用2mL二氯甲烷萃取水層。將有機(jī)層合并、干燥、隨后蒸發(fā)至干得到粗品。對(duì)其使用標(biāo)準(zhǔn)的 有機(jī)化學(xué)純化技術(shù),得到目標(biāo)物C,純度> 95 %。
      [0225] 1. 8gC溶解于5. 3g三氟乙酸與30mL二氯甲烷的混合物中。反應(yīng)混合物在室溫?cái)?拌48小時(shí)。減壓除去溶劑后,將粗品溶于30mL的0. 5NHC1中。用50mL等份的乙酸乙酯萃 取該混合物。將有機(jī)相合并、干燥、并蒸發(fā)至干,得到1.2克粗產(chǎn)品。對(duì)其使用標(biāo)準(zhǔn)有機(jī)化 學(xué)純化技術(shù),得到目標(biāo)物D,純度> 98 %。
      [0226] 在裝有攪拌棒的10mL干燥錐形燒瓶(Erlenmeyerflask)中將425mgD加入6mL 干燥乙腈中并使其溶解。在分開(kāi)的配有10mL滴液漏斗和攪拌棒的25mL燒瓶中將380mgN、 N-二琥珀酰亞胺基碳酸酯(DSC)溶于6mL干燥乙腈中,并用N2吹掃該系統(tǒng)。然后將D的溶 液轉(zhuǎn)移至滴液漏斗,并用lOmin的過(guò)程滴入DSC溶液中。然后將該溶液攪拌4小時(shí)。此時(shí), 除去溶劑,并在室溫在高度真空條件下干燥目標(biāo)產(chǎn)品E。
      [0227]方案II
      [0229] 制備(4-((2-(二乙基氨基)乙基)氨基甲酰基)苯基)氨基甲酸2, 5-二氧代吡 咯烷-1-基酯
      [0230] 方法一,在配有攪拌棒的干燥的100mL錐形燒瓶(Erlenmeyerflask)中,將2. 6g 普魯卡因胺A加入47g干燥乙腈中并使其溶解。在分開(kāi)的配有滴液漏斗和攪拌棒的1L燒 瓶中,將3. 2gN、N-二琥珀酰亞胺基碳酸酯(DSC)B溶于417g干燥乙腈中,并用N2吹掃該 系統(tǒng)。然后將普魯卡因胺溶液轉(zhuǎn)移至滴液漏斗中,并經(jīng)至少1小時(shí)滴加入DSC溶液中。然 后將該溶液攪拌4小時(shí)。此時(shí),除去溶劑,并在室溫、高度真空條件下干燥(4-((2-(二乙基 氨基)乙基)氨基甲?;┍交┌被姿?, 5-二氧代吡咯烷-1-基酯C。
      [0231] 方法二,在配有攪拌棒的干燥的100mL錐形燒瓶中,將8. 2g普魯卡因胺加入50mL 干燥二氯甲烷中并使其溶解。在分開(kāi)
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