,所述凝膠電 泳包括如下步驟:
[0115] 所述凝膠電泳體系包括:
[0116] 尿素(Urea),420g ;
[0117] 5XTBE, 100mL ;
[0118] 丙烯酰胺,57g
[0119] N、N' -亞甲基雙丙烯酰胺,3g ;
[0120] ddH20,lL;
[0121] A)配制6%變性聚丙烯酰胺凝膠,Acr:Bis = 19:1 :按照上述凝膠電泳體系 取Urea、5XTBE、丙烯酰胺、Ν、Ν' -亞甲基雙丙烯酰胺和ddH20混合均勻制成膠混合液, 4°C保存,備用;向上述制備的膠混合液中加入適量質(zhì)量濃度為10%的APS(催化劑)和 TEMED(加速劑)(對(duì)于20cmxl7cm的玻璃板,除去板條尺寸,膠為16. 5cm (寬)xl5. 5cm (高) xlmm(厚),對(duì)于1板膠,膠混合液30mL,10% APS為180 μ L,TEMED為80 μ L,對(duì)于2板膠, 膠混合液60mL,10 % APS為360 μ L,TEMED為160 μ L),搖勻,灌膠,緩慢插入與膠厚度一致 的梳子,同時(shí)避免梳齒下產(chǎn)生氣泡,待膠凝固后,拔去梳子(注意不要將梳齒拔斷),并用水 稍微沖洗點(diǎn)樣孔處,玻璃板放入電泳槽,固定在電泳槽上,電泳槽中加入適量IXΤΒΕ電泳 緩沖液(緩沖液可重復(fù)使用6-7次),在電壓300V,電流約50mA-60mA條件下預(yù)電泳lh,使 凝膠預(yù)熱;
[0122] B)取步驟⑵獲得的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加入10 μ L的1 X上樣緩沖液(Loading dye) 中混合均勻,95°C變性5min,4°C冷卻,每上樣孔加入上述混合液5 μ L,于恒定電壓300V,電 流50mA-60mA下電泳lh,當(dāng)溴酚藍(lán)移動(dòng)到距離膠板下沿約lcm時(shí),停止電泳,取出膠板,用 ddH20沖洗干凈后,經(jīng)3XGelSafe核酸染液浸泡30min,將所述凝膠置于凝膠成像儀下,在 波長(zhǎng)為302nm紫外光激發(fā)下并拍照。
[0123] (4)對(duì)比上述雜交種SH363以及其親本標(biāo)準(zhǔn)種子A436和R1843的電泳圖譜,如圖 2所示,Μ為分子量標(biāo)準(zhǔn),Pp P2為食用向日葵雜交種SH363的親本標(biāo)準(zhǔn)向日葵種子A436和 R1843, F1為食用向日葵雜交種SH363,從圖中可以看到所述待測(cè)食用向日葵雜交種SH363 同時(shí)具有其雙親特征譜帶,則所述待測(cè)食用向日葵雜交種SH363為真實(shí)的。
[0124] 實(shí)施例3
[0125] 本實(shí)施例所述用于快速檢測(cè)食用向日葵雜交種SH363真實(shí)性的試劑盒,包括各自 獨(dú)立包裝的引物液、反應(yīng)液和DNA聚合酶部分,其中,
[0126] 所述引物液部分中的引物為引物SR-1067,所述SR-1067引物:
[0127] SR-1067-F: 5 ' -CGTCAACTAATGCTGTCCTGATG-3 ',
[0128] SR-1067-R: 5, -TCGGATATGATGCTGCTAAAGGT-3,。
[0129] 每支所述試劑盒的配方為:
[0130] 引物液,0·2μΜ,1μL;
[0131] Taq DNA 聚合酶,2. 5units,0· 5 μ L ;
[0132] 10 X 含 Mg2+ 擴(kuò)增緩沖液,2mM,2· 5 μ L ;
[0133] dNTPs,2. 5mM, 2 μ L ;
[0134] ddH20,17μ L〇
[0135] 利用所述試劑盒快速鑒定食用向日葵雜交種SH363真實(shí)性的方法,包括如下步 驟:
[0136] (1)采用改良的CTAB方法提取由食用向日葵雜交種SH363及其親本標(biāo)準(zhǔn)向日葵種 子A436和R1843種植得到的向日葵的基因組DNA,所述步驟具體如下,
[0137] a)取所述食用向日葵真葉10mg (約lcm2)置于裝有研磨株的2mL離心管中,置于 液氮中預(yù)冷凍,并將預(yù)冷凍過(guò)的離心管置于研磨器中在30Hz條件下研磨30s,隨后迅速轉(zhuǎn) 移所述離心管于液氮中待用;
[0138] b)取出步驟a)的離心管并加入1000 μ L預(yù)熱過(guò)的由體積比為20:1的CTAB緩沖 液和巰基乙醇構(gòu)成的混合液,震蕩混勻,然后65°C下水浴反應(yīng)50min,每lOmin取出所述離 心管上下顛倒混勻一次;
[0139] c)將步驟b)反應(yīng)后的離心管放入4°C離心機(jī)中,于12000rpm下離心10min后,吸 取上清600 μ L并加入等體積的由體積比為1:1的三氯甲烷和Tris飽和酚構(gòu)成的混合液, 震蕩混勻,放入4°C離心機(jī)中,于12000rpm離心15min后,吸取上清500 μ L至2mL離心管 中,備用;
[0140] d)向步驟c)中的所述離心管中加入等體積三氯甲烷混勻,靜置3min后,放入4°C 離心機(jī),12000rpm離心10min,吸取上清300 μ L至1. 5mL離心管中,備用;
[0141] e)向步驟d)中的所述離心管中加入等體積異丙醇,震蕩混勻并靜置3min,放入 4°C離心機(jī),7500rpm離心7min,棄去上清液,并向剩余沉淀中加入lmL質(zhì)量濃度為75 %的乙 醇,搖晃離心管,充分洗滌所述沉淀,然后放入4°C離心機(jī),7500rpm離心7min,棄去上清液, 晾干沉淀;
[0142] f)向步驟e)中棄去上清液后的沉淀中加入30 μ L的無(wú)菌ddH20溶解DNA,再加入 1 μ L的RNase A,37°C水浴30min,在4°C或-20°C條件下保存溶液,即得;
[0143] 將上述步驟f)提取得到的基因組DNA進(jìn)行定量檢測(cè)和/或質(zhì)量檢測(cè):
[0144] 所述定量檢測(cè)步驟具體包括:取DNA樣品2 μ L用ddH20稀釋400倍,用紫外分光 光度儀測(cè)定0D26Q、0D2S。,并計(jì)算0D 26Q/0D2S。的比值;若所述比值在范圍1. 7-1. 9內(nèi),則DNA純 且可用;若超出上述比值范圍,則DNA含雜質(zhì)多不可用;
[0145] 所述質(zhì)量檢測(cè)步驟具體包括:取1 μ L樣品DNA,在濃度為0. 7%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行 電泳30min,用lOOOOXGelSafe染液染色并凝膠成像,若電泳條帶呈一致密亮,則DNA純且 可用;若無(wú)帶出現(xiàn),帶型彌散,則表明DNA已降解不可用;
[0146] (2)取步驟⑴的基因組DNA為模板,利用所述的試劑盒分別對(duì)各所述基因組DNA 進(jìn)行PCR擴(kuò)增,
[0147] PCR擴(kuò)增程序如下:95°C預(yù)變性2min,94°C變性30s,64°C退火30s,72°C延伸30s, 之后每個(gè)循環(huán)退火溫度下降rc,直至54°C,94°C變性30s,54退火30s,72°C延伸30s,進(jìn)行 30個(gè)循環(huán),最終72°C延伸20min,獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物4°C保存,備用;
[0148] (3)將步驟(2)獲得的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行6%變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,得到所述 食用向日葵雜交種SH363及其親本標(biāo)準(zhǔn)向日葵種子A436和R1843的電泳圖譜,所述凝膠電 泳包括如下步驟:
[0149] 所述凝膠電泳體系包括:
[0150] 尿素(Urea),420g ;
[0151] 5 X TBE, 100mL ;
[0152] 丙烯酰胺,57g
[0153] N、N' -亞甲基雙丙烯酰胺,3g ;
[0154] ddH20,lL;
[0155] A)配制6%變性聚丙烯酰胺凝膠,Acr:Bis = 19:1 :按照上述凝膠電泳體系 取Urea、5XTBE、丙烯酰胺、Ν、Ν' -亞甲基雙丙烯酰胺和ddH20混合均勻制成膠混合液, 4°C保存,備用;向上述制備的膠混合液中加入適量質(zhì)量濃度為10 %的APS (催化劑)和 TEMED(加速劑)(對(duì)于20cmxl7cm的玻璃板,除去板條尺寸,膠為16. 5cm (寬)xl5. 5cm (高) xlmm(厚),對(duì)于1板膠,膠混合液30mL,10% APS為180 μ L,TEMED為80 μ L,對(duì)于2板膠, 膠混合液60mL,10 % APS為360 μ L,TEMED為160 μ L),搖勻,灌膠,緩慢插入與膠厚度一致 的梳子,同時(shí)避免梳齒下產(chǎn)生氣泡,待膠凝固后,拔去梳子(注意不要將梳齒拔斷),并用水 稍微沖洗點(diǎn)樣孔處,玻璃板放入電泳槽,固定在電泳槽上,電泳槽中加入適量1ΧΤΒΕ電泳 緩沖液(緩沖液可重復(fù)使用6-7次),在電壓300V,電流約50mA-60mA條件下預(yù)電泳lh,使 凝膠預(yù)熱;
[0156] B)取步驟⑵獲得的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物加入10 μ L的1 X上樣緩沖液(Loading dye) 中混合均勻,95°C變性5min,4°C冷卻,每上樣孔加入上述混合液5 μ L,于恒定電壓300V,電 流50mA-60mA下電泳lh,當(dāng)溴酚藍(lán)移動(dòng)到距離膠板下沿約lcm時(shí),停止電泳,取出膠板,用 ddH20沖洗干凈后,經(jīng)3XGelSafe核酸染液浸泡30min,將所述凝膠置于凝膠成像儀下,在 波長(zhǎng)為302nm紫外光激發(fā)下并拍照。
[0157] (4)對(duì)比上述雜交種SH363以及其親本標(biāo)準(zhǔn)種子A436和R1843的電泳圖譜,如圖 3所示,Μ為分子量標(biāo)準(zhǔn),Pp P2為食用向日葵雜交種SH363的親本標(biāo)準(zhǔn)向日葵種子A436和 R1843, F1為食用向日葵雜交種SH363,從圖中可以看到所述待測(cè)食用向日葵雜交種SH363 同時(shí)具有其雙親特征譜帶,則所述待測(cè)食用向日葵雜交種SH363為真實(shí)的。
[0158] 實(shí)施例4
[0159] 本實(shí)施例所述用于快速檢測(cè)食用向日葵雜交種SH363真實(shí)性的試劑盒,包括各自 獨(dú)立包裝的引物液、反應(yīng)液和DNA聚合酶部分,其中,
[0160] 所述引物液部分中的引物為引物SR-1079,所述SR-1079引物:
[0161] SR-1079-F: 5 ' -TACGACTGACGATTCCATTTCTC-3 ',
[0162] SR-1079-R: 5' -AACTGGATTTCACAGGGAGTGTT-3'。
[0163] 每支所述試劑盒的配方為:
[0164] 引物液,0·2μΜ,1μL;
[0165] Taq DNA 聚合酶,2. 5units,0· 5 μ L ;
[0166] 10Χ 含 Mg2+ 擴(kuò)增緩沖液,2mM,2· 5 μ L ;
[0167] dNTPs, 2. 5mM, 2 μ L ;
[0168] ddH20,17μ L〇
[0169] 利用所述試劑盒快速鑒定食用向日葵雜交種SH363真實(shí)性的方法,包括如下步 驟:
[0170] (1)采用改良的CTAB方法提取由食用向日葵雜交種SH363及其親本標(biāo)準(zhǔn)向日葵種 子A436和R1843種植得到的向日葵的基因組DNA,所述步驟具體如下,
[0171] a)取所述食用向日葵真葉10mg (約lcm2)置于裝有研磨株的2mL離心管中,置于 液氮中預(yù)冷凍,并將預(yù)冷凍過(guò)的離心管置于研磨器中在30Hz條件下研磨30s,隨后迅速轉(zhuǎn) 移所述離心管于液氮中待用;
[0172] b)取出步驟a)的離心管并加入1000 μ L預(yù)熱過(guò)的由體積比為20:1的CTAB緩沖 液和巰基乙醇構(gòu)成的混合液,震蕩混勻,然后65°C下水浴反應(yīng)50min,每lOmin取出所述離 心管上下顛倒混勻一次;
[0173] c)將步驟b)反應(yīng)后的離心管放入4°C離心機(jī)中,于12000rpm下離心10min后,吸 取上清600 μ L并加入等體積的由體積比為1:1的三氯甲烷和Tris飽和酚構(gòu)成的混合液, 震蕩混勻,放入4°C離心機(jī)中,于12000rpm離心15min后,吸取上清500 μ L至2mL離心管 中,備用;
[0174] d)向步驟c)中的所述離心管中加入等體積三氯甲烷混勻,靜置3min后,放入4°C 離心機(jī),12000rpm離心10min,吸取上清300 μ L至1. 5mL離心管中,備用;
[0175] e)