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      一種荒漠植物總dna的提取方法_2

      文檔序號:9927825閱讀:來源:國知局
      -琉基乙醇的含量,使其濃度都達到了 〇.5-2%,0-琉基乙醇提供還原條件,二者協(xié)同作 用,使得多酪類物質(zhì)不易被氧化,而與PVPP充分結(jié)合形成馨合物。再通過后續(xù)的步驟抽提除 去,有效抑制了酪類物質(zhì)對DNA提取的影響。
      [0029] 試驗中使用PVPP而不用PVP,運是因為PVP是聚乙締化咯燒酬,水溶性好,可溶于各 種有機溶劑,而PVPP是交聯(lián)聚乙締化咯燒酬,是聚乙締化咯燒酬的交聯(lián)聚合物,幾乎不溶于 任何溶劑。不溶性PVPP替代可溶性的PVP,可溶性PVP與酪的抽提不兼容而干擾DNA沉淀;不 溶性PVPP既能結(jié)合多酪,又能結(jié)合多糖,從而阻止核酸與多糖多酪結(jié)合而導(dǎo)致DNA產(chǎn)量減 少,可溶性PVP粉只結(jié)合多酪而不結(jié)合多糖,從而不能去除多糖污染物;PVP粉的使用量受到 限制,緩沖液PVP粉不能超過的1%,否則DNA的產(chǎn)量會顯著地減少,而PVPP不受限制。
      [0030] 2、加入前處理緩沖溶液,溶解多糖類物質(zhì) 在第一步研磨的樣品粉末中迅速加入前處理緩沖液500-10001x1,滿旋儀上高速混勻, 離屯、機上低速90化pm離屯、5min,棄上清,取沉淀物。
      [0031] 3、抽提DNA,清除多糖類產(chǎn)物 在沉淀物中加入65°C預(yù)熱、500-10(K)山的提取裂解液中,滿旋儀上充分混勻,恒溫水浴 鍋65 °C溫浴1小時,充分震蕩混勻后高速離屯、機1200化pm離屯、IOmin。
      [0032] CTAB提取液中包含有較高濃度的CTAB(2%),化Cl (1.4M),e-琉基乙醇(0.2-0.5〇/〇) W及25mM EDTA和IOOmM Tris-HCl (pH值8.0) dCTAB是一種陽離子去污劑,能溶解細胞膜,對 植物細胞具有較好的裂解作用,而且同e-琉基乙醇共同對蛋白質(zhì)的強烈變性作用,使核酸 從蛋白-核酸復(fù)合物中徹底被釋放出來。在高離子濃度的化Cl溶液中(化C1〉0.7M),釋放出 來的核酸與較高濃度的CTAB(2%(w/v))形成可溶性的復(fù)合物,而變性蛋白質(zhì)與CTAB形成不 溶性的復(fù)合物,隨著氯仿的抽提蛋白質(zhì)被去除。同時,e-琉基乙醇不但可W作為強還原劑防 止多酪氧化,提供pH值為8.0緩沖環(huán)境,還能有效降低多酪物質(zhì)在酸性條件下被氧化的幾 率。
      [0033] 4、取上清加入新的2ml微量離屯、管,加等體積(800山乂 I純化液混勻,抽提一次,室 溫下,高速離屯、機上12000巧m離屯、5min。
      [0034] 5、取上清加入新的2ml微量離屯、管,加入1/2體積預(yù)冷的異丙醇放入冰箱冷凍室,-20°C 沉淀DNA 30-60min。
      [00對 6、取出2ml微量離屯、管,在4°C 12000rpm轉(zhuǎn)速離屯、5-lOmin,棄去液體部分,取沉淀 用75%乙醇清洗兩遍。
      [0036] 荒漠植物葉片中富含多糖,其成分W及理化性質(zhì)和核酸很接近,不容易分離,盡管 大量的多糖在DNA的抽提過程中被高鹽的前處理緩沖液已經(jīng)去除,但還是有極少量的多糖 在低溫沉淀過程中滲入到DNA水相中與DNA-起沉淀,而使抽提到的DNA中還含有極少量多 糖的污染,所W后期再用低溫預(yù)冷的異丙醇沉淀,運樣可有效徹底去除殘留多糖的干擾。并 用75%的乙醇洗涂兩次,運樣可有效去除離子的干擾。運樣,經(jīng)過對多酪、多糖、蛋白質(zhì)及離 子物質(zhì)的有效去除,獲得純凈的DNA樣品。
      [0037] 7、放入通風(fēng)廚吹干至乙醇充分揮發(fā),加入40-100iil滅菌水溶解,貼標簽放入冰箱 冷凍室凍存盒保存。
      [003引實施例1 一、荒漠植物葉片DNA提取方法具體如下: 1、 材料研磨 取0.1-0.5g荒漠植物葉片(12種,為沙米、紅砂、珍珠豬毛菜、巧條、沙冬青、油葛、沙拐 要、沙木寥、文冠果、花棒、蒙古親、霸王)置于研鉢中,在研鉢里直接撒交聯(lián)聚乙締化咯燒酬 (PVPP)粉,加入量為荒漠植物葉片質(zhì)量的1%,加入液氮與葉片一起快速研磨S次; 2、 加入前處理緩沖溶液,溶解多糖類物質(zhì) 將第一步研磨的粉末樣品迅速加入前處理緩沖液500-1000山,充分混勻后90化pm 離屯、5min,棄上清,取沉淀物。
      [0039] 3、抽提DNA,清除蛋白質(zhì)與多糖類產(chǎn)物 將上一步的沉淀物加入65°C預(yù)熱、SOO-IO(K)山的提取裂解液中,總?cè)芤簼M旋2min,65°C 溫浴1小時,之后室溫12000rpm離屯、lOmin;加等體積的苯酪/氯仿/異戊醇混合液(苯酪:氯 仿:異戊醇的體積比為25:24:1)的純化溶劑,抽提1次,室溫下,12000巧m,離屯、5min。
      [0040] 4、沉淀DNA,獲取純凈高產(chǎn)DNA 向上清中加1 /2體積預(yù)冷的異丙醇,混勻,冰浴-20°C冰箱放置30min。在4 °C 1200化pm 離屯、IOmin,倒掉上清液,用濃度為75 %乙醇溶劑漂洗二次,4°C 12000巧m離屯、5-lOmin,收集 沉淀,驚干,得純凈的DNA產(chǎn)品,溶于20-5化1無菌水中。
      [0041 ] 二、總DNA質(zhì)量和產(chǎn)量檢測階段: 1、 完整性檢測 每個樣品中取化1總DNA溶液通過凝膠電泳檢測其完整性,其它DNA樣品保存在-20°C冰 箱中。將1山5倍上樣緩沖液和化1總DNA溶液室溫混合,然后上樣到1%瓊脂糖凝膠舊加化1 漠化乙錠邸)樣孔中,在北京六一小型電泳槽中IOOV電泳中跑膠30min后,用全自動數(shù)碼凝 膠成像系統(tǒng)上海培清380C儀器拍照記錄。結(jié)果參見圖1,從左到右依次為巧條、沙米、紅砂、 珍珠豬毛菜、霸王、油葛、沙木寥、沙冬青、蒙古親、沙拐要、文冠果、花棒所提取的DNA電泳結(jié) 果。由圖1可W看出,12種荒漠植物提取的DNA完整性好。 2、 總DNA純度和產(chǎn)量檢測 取化1提取獲得的DNA溶液,用Nano化OP2000C型微量紫外分光光度計測定〇〇26日、〇〇280和 OD230處的吸光值(W無菌水為空白液調(diào)零),計算DNA產(chǎn)量及純度??侱NA產(chǎn)量計算根據(jù)公式: DNA產(chǎn)量為50 X0〇26日X樣品的體積(iil)/材料重(mg)。0魁、蛋白質(zhì)和多糖、多酪分別在OD260、 0D28日和OD23日有最大的吸光值,常用A260/230、A260/280的比值來表示DNA的純度,A260/230、 A260/280大于1.8表示DNA有較高的純度,A260/230小于1.8說明DNA有多糖、多酪污染, A260/280小于1.8說明DNA有蛋白質(zhì)污染。結(jié)果參見表1。
      [0042] 表1 12種荒漠植物葉片DNA質(zhì)量Nano化OP測定結(jié)果
      實施例2 一、荒漠植物根DNA提取方法具體如下: 1、材料研磨 取0.2g荒漠植物的根部(12種,為沙米、紅砂、珍珠豬毛菜、巧條、沙冬青、油葛、沙拐要、 沙木寥、文冠果、花棒、蒙古親、霸王)置于研鉢中,在研鉢里直接撒交聯(lián)聚乙締化咯燒酬 (PVPP)粉,加入量為荒漠植物葉片質(zhì)量的0.5%,加入液氮與葉片一起快速研磨S次; 2、加入前處理緩沖溶液,溶解多糖類物質(zhì) 將第一步研磨的粉末樣品迅速加入前處理緩沖液50化1,前處理液中0琉基乙醇的含量 為0.5%,充分混勻后90化pm離屯、5min,棄上清,取沉淀物。
      [0043] 3、抽提DNA,清除蛋白質(zhì)與多糖類產(chǎn)物 將上一步的沉淀物加入65°C預(yù)熱、SOOiil的提取裂解液中,提取裂解液中0琉基乙醇的 含量為0.2%,總?cè)芤簼M旋2min,65 °C溫浴1小時,之后室溫1200化pm離屯、1 Omin;加等體積的 苯酪/氯仿/異戊醇混合液(苯酪:氯仿:異戊醇的體積比為25:24:1)的純化溶劑,抽提1次, 室溫下,12000巧m,離屯、5min。
      [0044] 4、沉淀DNA,獲取純凈高產(chǎn)DNA 向上清中加1 /2體積預(yù)冷的異丙醇,混勻,冰浴-20°C冰箱放置30min。在4 °C 1200化pm 離屯、lOmin,倒掉上清液,用濃度為75%乙醇溶劑漂洗二次,放入通風(fēng)廚吹干至乙醇充分揮 發(fā),得純凈的DNA產(chǎn)品,溶于40iU無菌水中。
      [0045] 實施例3 一、荒漠
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