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      一種基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法與流程

      文檔序號:40281453發(fā)布日期:2024-12-11 13:21閱讀:來源:國知局

      技術(shù)特征:

      1.一種基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于包括如下步驟:

      2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(4)中,kingfisher?flex實驗方法設(shè)置如下,

      3.?根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(4)中,完成kingfisher?flex參數(shù)設(shè)定后,在室溫下混勻磁珠,向beads?plate板中加入1mg磁珠,確保磁珠體積不超過150?μl;磁珠采用200?μl超純水洗滌2次;結(jié)合完蛋白的磁珠采用200?μl?80%的乙醇溶液,洗滌磁珠,去除表面活性劑等小分子。

      4.?根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(5)中,向酶解板加入100?μl的蛋白酶解溶液,將beads釋放至酶解溶液中,37℃條件下酶解3h。

      5.?根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(5)中,蛋白酶解溶液是通過向100?μl的碳酸氫銨中按照蛋白:酶=100:1的比例加入trypsin和lys?c配置而成。

      6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(6)中,除鹽流動相是由a相:0.5%乙酸和b相:80%乙腈+0.5%乙酸組成。

      7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(6)中,除鹽包括以下步驟:

      8.?根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法,其特征在于:所述步驟(7)中,使用100?μl?0.1%的fa溶液復(fù)溶上述真空濃縮后的肽段,進樣500?ng。


      技術(shù)總結(jié)
      本發(fā)明公開了一種基于自動化前處理裝置的高通量蛋白質(zhì)組學(xué)定性定量分析方法。將SP3法與自動化磁珠提取系統(tǒng)Kingfisher?Flex系統(tǒng)相結(jié)合,構(gòu)建SP3?Kingfisher?Flex磁珠純化自動化平臺。通過優(yōu)化、設(shè)置Kingfisher?Flex系統(tǒng)相應(yīng)的參數(shù),可實現(xiàn)高通量臨床樣本的蛋白前處理,最多可同時處理96個蛋白樣本,減少大隊列樣品處理造成的人為誤差,與此同時將酶切時間從過夜縮短至3h,極大節(jié)約了時間成本。通過SP3磁珠捕獲蛋白質(zhì)和肽段,有效去除影響質(zhì)譜分析的RIPA、SDS等去垢劑,純化肽段,從而提高蛋白鑒定的數(shù)據(jù)質(zhì)量。

      技術(shù)研發(fā)人員:請求不公布姓名,請求不公布姓名,請求不公布姓名,請求不公布姓名,請求不公布姓名,請求不公布姓名
      受保護的技術(shù)使用者:南京江北新區(qū)生物醫(yī)藥公共服務(wù)平臺有限公司
      技術(shù)研發(fā)日:
      技術(shù)公布日:2024/12/10
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