箱、電泳儀、凝膠 成像系統(tǒng)、滅菌鍋、分析天平、酸度計、光照培養(yǎng)箱、恒溫振蕩器、酶標儀、蛋白成像系統(tǒng)、電 轉儀、熒光顯微鏡等;
[0041] 藥品與試劑:
[0042]NaCl、NaOH、K2HPO4?3H20、KH2PO4'MgSO4?7H20、(NH4) 2S04、CaCl2?2H20、FeSO4?7H20、 MgCl2、NaAc、KAc、EDTA、CTAB、Tris、SDS、MES、Hindlll、SpeI、2XTaqPCRMasterMix、 DNAmaker、DNaseI、乙酰丁香酮、瓊脂糖、瓊脂粉、葡萄糖、尿素、乙醇、蛋白胨、酵母提取 物、RNAout試劑盒。聚乙烯吡咯烷酮(PVP40)、磺基水楊酸、NaN3、Na2S2O3、甲醛、異丙醇、冰 醋酸、三氯乙酸、甘油、丙烯酰胺、N,N' -亞甲雙丙烯酰胺、甘氨酸/過硫酸銨、麗春紅S、考 馬斯亮藍、溴酚藍、PMSF、BCA蛋白定量試劑盒、蛋白預染Maker、脫脂奶粉、Tween-20、ECL發(fā) 光液和NC膜、Anti-6XHis-Tagantibody、羊抗兔HRP標記;
[0043] 實驗方法:
[0044] 試劑配制,
[0045]LB(LuriaBroth)培養(yǎng)基:10g蛋白胨(typtone),5g酵母提取物(yeast extract),IOgNaCl溶解于QSOmT,去離子水中,用lmol/LNaOH調節(jié)pH至 7. 0,10OOmT,容量 瓶定容,121°C,25min高壓除菌,4°C保存;
[0046]LB固體培養(yǎng)基另加瓊脂粉1. 5%,頂培養(yǎng)基即誘導培養(yǎng)基:將下述2種溶液混勻 配成工作液,4°C保存,
[0047]頂培養(yǎng)基I(900mL):NaCl0? 15g,K2HPO4 ? 3H20 2. 7g,KH2PO4I. 45g,MgSO4 ? 7H20 0? 5g,(NH4)2SO4 0? 5g,加去離子水 800mL溶解,調PH至 5. 3,加水至 900mL,121°C,25min高 壓除菌;
[0048]頂培養(yǎng)基II(IOOmL) :CaCl2 ? 2H20 0? 067g,FeSO4 ? 7H20 0? 0025g,C6H12O6 2g,MES 8. 54g,甘油0. 5g,調pH至5. 3,0. 22ym針頭式過濾器過濾除菌;
[0049] 選擇固體培養(yǎng)基:量取90mLBG-Il培養(yǎng)基,加入Ig瓊脂粉,121°C,25min高壓 除菌,待其溫度降到 60°C左右,加入 10mL10XGlu+Urea、200yL100mg/mL的Amp200yL lOOmg/mL的Cef和200yL50mg/mL的Hyg,混勻,倒入培養(yǎng)皿,待其冷卻凝固,封口膜密封, 4°C保存;
[0050] 0.lmol/LCaCl2溶液:稱取CaCl2 ? 2H20I. 47g,溶于足量的去離子水,IOOmL容量 瓶定容,0. 22ym針頭式過濾器過濾除菌;
[0051]CaCl2-MgCl2溶液(80mmol/LMgCl2、20mmol/LCaCl2):稱取I. 63g,溶于足量的去 離子水中,加入0.lmol/LCaCl2溶液20mL,IOOmL容量瓶定容,0. 22ym針頭式過濾器過濾 除囷;
[0052] 0?lmol/LCaCl2溶液:稱取CaCl2?2H20I.47g,溶于足量的去離子水,IOOmL容量 瓶定容,0. 22ym針頭式過濾器過濾除菌;
[0053] 50%甘油:量取50mL甘油,加入50mL去離子水,混勻,121°C,25min高壓除菌,4°C 保存;
[0054]5mol/LNaCl溶液:稱取29.22gNaCl,加熱溶解于足量的去離子水,IOOmL容量瓶 定容,121°C,25min高壓除菌,室溫保存;
[0055] 3mol/LNaAc(pH5. 2):稱取NaAc24. 6g,溶于80mL去離子水中,加冰醋酸調PH至 5. 2,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高壓除菌,室溫保存;
[0056]lmol/LTirs-Hcl(pH8. 0):稱取Tirs12. 114g,溶于 80mL去離子水中,加濃鹽酸 調節(jié)pH至8. 0,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高壓除菌,室溫保存;
[0057] 5mol/LKAc(pH6. 0):稱取KAc49. 07g,溶于80mL去離子水中,加冰醋酸調PH至 6. 0,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高壓除菌,室溫保存;
[0058] 10mol/L NaOH:稱取40g NaOH,溶于80mL去離子水中,IOOmL容量瓶定容,室溫保 存;
[0059] 0? 5mol/LEDTA(pH8. 0):稱取EDTA-Na2 18. 16g,加 80mL去離子水,磁力攪拌器上 攪拌,慢慢加入l〇mol/LNaOH,調節(jié)PH至8. 0,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高壓除菌, 室溫保存;
[0060] 10%SDS:稱取SDSlOg,加熱溶解于足量去離子水中,IOOmL容量瓶定容,室溫保 存;
[0061]質粒提取溶液I=C6H12O6?H20lg,lmol/LTirs-Hcl(pH8. 0)2. 5mL,0. 5mol/ LEDTA(pH8. 0) 2mL,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高壓除菌,4°C保存;
[0062]質粒提取溶液II:10%SDS100yL,lOmol/LNaOH20yL,滅菌去離子水 880yL 制成ImL質粒提取溶液II,現用現配;
[0063] 質粒提取溶液III:5mol/LKAc(PH6. 0) 60mL,冰乙酸11. 5mL,滅菌去離子水 28. 5mL,配好后裝入一個滅菌的瓶子中,4°C保存;
[0064] 0. 15mol/LNaCl溶液:稱取0. 877gNaCl,溶于足量的去離子水,IOOmL容量瓶定 容,121°C,25min高壓除菌,4°C保存;
[0065] 0? 02mol/LCaCl2溶液:取滅菌的 15mL離心管,加入 0?lmol/LCaCl2溶液 2mL,再 加入8mL滅菌去離子水,混勻,4°C保存;
[0066]lOOmmol/LAS(乙酰丁香酮):稱取196. 2mg乙酰丁香酮,溶于5mLDMS0,加去離子 水定溶于10mL,超凈臺中操作,所有器具都需滅菌,-20°C保存;CTAB提取液:稱取CTAB2g, 加入約 40mL去離子水中,加入lmol/LTirs-Hcl(PH8. 0) 10mL,0. 5mol/LEDTA(PH8. 0)4mL, 5mol/LNaCl溶液28mL,加熱使CTAB溶解,IOOmL容量瓶定容,121°C,25min高壓除菌,室溫 保存;
[0067]蛋白提取緩沖液I:10mmol/LTris-HCl(pH8. 0)加入 0? 020g/LNaN3以及 0.001g/LPMSF,
[0068]蛋白提取緩沖液2 :300mL去離子水中加入45mLlmol/LTris-HCl(pH8.0)溶液、 75mL甘油和,6g聚乙烯吡咯烷酮(PVP40)以及0. 001g/LPMSF
[0069] 30% (W/V)丙稀酰胺溶液:29g丙稀酰胺(Acrylamide)和IgN,N' -亞甲雙丙稀 酰胺溶于SOmL去離子水中,充分攪拌溶解,定容至100mL,0. 45ym膜過濾后置于棕色瓶中 4 °C保存待用;
[0070] 10% (W/V)過硫酸銨(AP) :0.Ig過硫酸銨溶于ImL去離子水中,4°C保存待用,有 效期為兩周;
[0071] 10% (W/V)SDS=IOgSDS溶于80mL去離子水,加熱溶解,定容至100mL,室溫保存;
[0072]I. 5mol/LTris-HCl(pH8. 8) :18. 17gTris溶于 80mL去離子水中,加入濃鹽酸調節(jié) PH至8. 8,定容至100mL,4°C保存待用;
[0073]lmol/LTris-HCl(pH6. 8) :12.IgTris溶于 80mL去離子水中,加入濃鹽酸調節(jié)PH 至6. 8,定容至100mL,4°C保存待用;
[0074] 5XTris-Glycinebuffer: 15.lgTris,94g甘氨酸,5gSDS,溶于HOOmT,去離子水 中,加熱并充分攪拌使其溶解,定容至lOOOmL,室溫保存;
[0075] 5XSDS-PAGELoadingbuffer:取 1.25mLlmol/LTris-HCl(pH6. 8),0.5gSDS, 25mg溴酚藍,2. 5mL甘油,加去離子水溶解并定容至5mL,0. 5mL/份分裝,室溫保存,使用前 每份加入25yLP-巰基乙醇;
[0076] 考馬斯亮藍R-250染液:稱取Ig考馬斯亮藍R-250,加入250mL異丙醇,攪拌溶解, 加入IOOmL冰醋酸和650mL去離子水,充分攪拌,室溫保存;
[0077] 考染脫色液:冰醋酸100mL,乙醇50mL,去離子水850mL,充分攪拌后,室溫保存;
[0078] 甲酸固定液:40%甲醇、0? 5mL37%甲酸,
[0079]硫代硫酸鹽顯影液:3%Na2C03、0. 0004%Na2S203、0. 5mL/L37%福爾馬林,
[0080] 半干式電轉緩沖液:48mmol/LTris,39mmol/L甘氛酸(Glycine),0? 04 %SDS, 20%甲醇;
[0081] 10X麗春紅染液:麗春紅S2g,三氯乙酸30g,磺基水楊酸30g,去離子水定容至 IOOmL,室溫保存;
[0082]TBST:lmol/LTris-HCl(pH7. 5) 10mL,加入 800mL去離子水,加入 8. 8gNaCl,加熱 攪拌溶解,定容至1000ml,最后加入使用前加入20 %TWeen20,TWeen20的終濃度為0? 05 %〇 [0083] 本發(fā)明的基因序列的優(yōu)化設計和表達載體的構建步驟為:
[0084] 1)先確定HuIFN-a2b基因序列;
[0085] 2)通過對HuIFN-a2b基因在普通小球藻中的密碼子使用頻率做一個分析,找出 小球藻使用頻率低的密碼子;
[0086]3)根據小球藻Rubisc蛋白,核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶,對應氨基酸的密碼子將 小球藻使用頻率低的密碼子替換掉;
[0087] 4)在優(yōu)化的人干擾素HuIFN-a2b基因5'端加A,使其形成AfIIII限制性酶切位 點,在其3'去掉終止密碼子,添加SpeI的限制性酶切位點;
[0088] 5)將pCAMBIA1304 通過NcoI(ClCATGG)和SpeI(AlCT