P_003755112. 1、YP_003896973. 1、YP_003907026. 1、YP_003912421. 1、YP_004086766. 1、 YP_004142571. 1、YP_004147141. 1、YP_004228105. 1、YP_004278247. 1、YP_004305252. 1、 YP_004356916. 1、YP_004361407. 1、YP_004378186. 1、YP_004379856. 1、YP_004390782. 1、 YP_004472442. 1、YP_004590892. 1、YP_004612414. 1、YP_004676537. 1、YP_004693233. 1、 YP_004701580. 1、YP_004701637. 1、YP_004704442. 1、YP_108931. 1、YP_110490. 1、 YP_168667. 1、YP_237931. 1、YP_260624. 1、YP_262985. 1、YP_271307. 1、YP_276987. 1、 YP_334171. 1、YP_337172. 1、YP_350660. 1、YP_351134. 1、YP_364386. 1、YP_366340. 1、 YP_369710. 1、YP_370582. 1、YP_426342. 1、YP_440141. 1、YP_442361. 1、YP_468848. 1、 YP_521636. 1、YP_554363. 1、YP_608454. 1、YP_610700. 1、YP_614980. 1、YP_622254. 1、 YP_625753. 1、YP_680590. 1、YP_751687. 1、YP_767071. 1、YP_774090. 1、YP_774932. 1、 ΥΡ_788372. 1、ΥΡ_858562. 1、ΥΡ_928515. 1、ΥΡ_983084. 1、ΥΡ_995622. 1、ΖΡ_00948889. 1、 ΖΡ_00954344. 1、ΖΡ_00959736. 1、ΖΡ_00998881. 1、ΖΡ_01011725. 1、ΖΡ_01037109. 1、 ΖΡ_01058030. 1、ΖΡ_01076707. 1、ΖΡ_01103959. 1、ΖΡ_01167926. 1、ΖΡ_01224713. 1、 ΖΡ_01442907. 1、ΖΡ_01446892. 1、ΖΡ_01550953. 1、ΖΡ_01625518. 1、ΖΡ_01745731. 1、 ΖΡ_01750280. 1、ΖΡ_01754305. 1、ΖΡ_01763880. 1、ΖΡ_01769626. 1、ΖΡ_01865961. 1、 ΖΡ_01881393. 1、ΖΡ_01901558. 1、ΖΡ_02145337. 1、ΖΡ_02151268. 1、ΖΡ_02152332. 1、 ΖΡ_02167267. 1、ΖΡ_02190082. 1、ΖΡ_02242934. 1、ΖΡ_02360937. 1、ΖΡ_02367056. 1、 ΖΡ_02385477. 1、ΖΡ_02456487. 1、ΖΡ_02883670. 1、ΖΡ_03263915. 1、ΖΡ_03263990. 1、 ΖΡ_03400081. U ΖΡ_03452573. U ΖΡ_03456092. U ΖΡ_03517291. U ΖΡ_03529055. U ΖΡ_03571515. U ΖΡ_03572809. U ΖΡ_03587785. U ΖΡ_03588560. U ΖΡ_03697266. U ΖΡ_03697962. 1、ΖΡ_04521092. 1、ΖΡ_04590693. 1、ΖΡ_04890914. 1、ZPJM891982. 1、 ΖΡ_04893793. 1、ΖΡ_04902131. 1、ΖΡ_04905327. 1、ΖΡ_04941068. 1、ZPJM944536. 1、 ΖΡ_04945255. 1、ZPJM959332. 1、ΖΡ_04964181. 1、ΖΡ_05053721. 1、ΖΡ_05063588. 1、 ΖΡ_05073059. 1、ΖΡ_05077806. 1、ΖΡ_05082750. 1、ΖΡ_05091128. 1、ΖΡ_05095488. 1、 ΖΡ_05101701. 1、ΖΡ_05116783. 1、ΖΡ_05121836. 1、ΖΡ_05127756. 1、ΖΡ_05637806. 1、 ΖΡ_05742087. 1、ΖΡ_05783548. 1、ΖΡ_05786246. 1、ΖΡ_05843149. 1、ΖΡ_05945960. 1、 ΖΡ_06459045. 1、ΖΡ_06487195. 1、ΖΡ_06492453. 1、ΖΡ_06493162. 1、ΖΡ_06703644. 1、 ΖΡ_06731146. 1、ΖΡ_06839371. 1、ΖΡ_07007312. 1、ΖΡ_07266194. 1、ΖΡ_07374050. 1、 ΖΡ_07662787. U ΖΡ_07778196. U ΖΡ_07797983. U ΖΡ_08099459. U ΖΡ_08138203. U ΖΡ_08141719. 1、ΖΡ_08142973. 1、ΖΡ_08177102. 1、ΖΡ_08185821. 1、ΖΡ_08186468. 1、 ΖΡ_08208888. U ΖΡ_08266590. U ΖΡ_08402041. U ΖΡ_08406891. U ΖΡ_08522175. U ΖΡ_08527488. 1、ΖΡ_08631252. 1、ΖΡ_08636687。
[0038] 根據(jù)本發(fā)明使用的脂肪酸還原酶、以及優(yōu)選地根據(jù)本發(fā)明使用的其它酶是重組 酶。在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本文中使用的術(shù)語"重組體"被理解為是指,編碼對應(yīng)酶的核 酸分子不存在于天然細(xì)胞中,和/或它利用基因工程方法來生產(chǎn)。在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案 中,當(dāng)相應(yīng)的多肽由重組核酸編碼時(shí),稱為重組蛋白。在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本文中使 用的重組細(xì)胞被理解為,至少含有一種重組核酸或一種重組多肽的細(xì)胞。適合用于生產(chǎn)重 組分子或細(xì)胞的方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的,例如在下述文獻(xiàn)中描述的那些:Sambrook/ Fritsch/Maniatis (1989) : Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press,第2版。優(yōu)選過表達(dá)重組酶,例如利用本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的 pET或pGEX載體體系。
[0039] 關(guān)于生物體的選擇,根據(jù)本發(fā)明可使用的全細(xì)胞催化劑沒有限制,只要它是 可培養(yǎng)的、穩(wěn)定的,并任選可以實(shí)現(xiàn)可通過基因工程引入的修飾,例如用于減弱酶活性 的方法,例如敲除。例如,所述細(xì)胞同樣可以為原核細(xì)胞或真核細(xì)胞。在真核細(xì)胞的 情況中,單細(xì)胞的真核生物是特別優(yōu)選的,特別是酵母諸如釀酒酵母( cereFisiae)、熱帶假絲酵母(6?/?t/it/a iropica/is)、白色假絲酵母(6?/?t/it/a 和巴斯德畢赤酵母(/7ZcAia pasioris)。在原核細(xì)胞的情況中,它可以是例如選自 以下的細(xì)菌:鐵gweiococciAs、iferi/Tro/i/flofe、醋桿菌屬deioAacter)、醋酸桿菌屬 iteri腫)、嗜酸菌屬(腫)、阿菲彼亞桿菌屬(不粘 柄菌屬 禮單胞菌屬(固氮根瘤菌屬(jzarAizc>/?i?)、 固氮螺菌屬(X^s^/ri77應(yīng))、芽抱桿菌屬(feci77"6〇、巴爾通體(feri<9/?(977沒 拜葉林克氏菌屬(價(jià)辦近弧狀短波單胞桿菌 6Y//?Ki/?_ri(9ii3fe6〇、布魯桿菌屬(份Y/i^77a)、柄桿菌屬(fe"7(9如cte/O、 Chelat ivorans、Citreicel la、Ci tromicrobium、複、歇菩猶奸舊[屬ii Clostridium)、場妖魯 屬(況teri腫)、/7/加玫瑰桿菌屬(況ter)、赤桿菌屬(ArjiAro/?況ter)、 Fulvimarina、智廢豫妖售[罵{ Gluconacetobacter)、Granulibacter、Hirschia、Hoeflea、 故歡級著[MQHyphomicrobiim)、革觀著[MQHyphomonas)、Ketogulonicigenium、 Labrenzia^ Loktanella^ M M M^MagnetospiriIIum)^ Maricaulis^ Maritimibacter^ 應(yīng)、甲基桿菌屬(ifecteri腫)、甲基抱囊菌屬(ifeiis)、甲基 ^W[MQMethylosinus)、^^^^^iNitrobacter)、Novosphingobium、Oceanibulbus、 Oceanicaulis、Oceanicola'^i^^售罵 i Ochrobactruni)、Octadecabacter、01 igotropha、 儀\ 豫售i MQParacoccus)、Parvibacuhm、Parvularcula、把,\、食售[糧^Pelagibaca)、 Phaeobacter^ Phenylobacterium^ Polymorphum^ Pseudo^fL ^ M( Pseudovibrio)^ If 菌屬(7&(9^/(9如以(9_/0、紅微菌屬(7&(9^/傭^_/'(9/?/訓(xùn)?)、紅假單胞菌屬(7&(9^/(9/76 ((9饑/6_9/?沒60、 紅壤售[MQRhodospirilluni)、Roseibium、散銀妖售[屬iiRoseobacter)、Roseomonas、 Roseovarius、Ruegeria、Sagittula、後妖售[罵{Silicibacter)、Sphingobium、板尋觀 ^ MiiSphingomonas)^ Sphingopyxis^ Starkeya^ Sulfitobacter^ Thalassiobium^ ? 5P 胞菌屬(辦/? ter)、發(fā)酵單胞菌屬(辦避遍9/?a60、土壤桿菌(c teri腫)、根瘤 菌屬(、大豆根瘤菌屬(、微粒孢子蟲屬(、埃里 希體屬(油r7i^Aia)、新立克次體屬(Afeoricfcitsia)、東方體屬(立克次體 屬(i tsia)、沃爾巴克體屬(、博德特菌屬(你 /? 、伯霍爾德桿菌 M ^ Burkho lderi a) ^ ^ M Cupriavidus) ^ Taiwanensis^ Lautropia^ Limnobacter^ 凡>心7?此7<9(9如以(9_/\羅爾斯通氏菌屬(7&76^(9/?仏)、色桿菌屬(^^/7遍9如以(9_/^應(yīng))、 eo/TOife/Ls*、、金氏桿菌屬(^??沢77a)、海區(qū)鳥形菌屬(Zari如cte/O、 奈瑟球菌屬(Afeissaria)、西蒙斯氏菌(5??9/?6^773)、無色桿菌屬 (XcAr傭食酸菌屬(jcit/braraz)、Aro艦應(yīng)、固氮弧菌屬 (也似_/^60、叢毛平胞菌屬(Cb艦避?脫60、遍9/?狀、代爾夫特菌屬(、加 AL § ^ M ( Gallionella)^ ^ ^ jg {HerbaspirilIum)^ Herminiimonas^ Hylemonella^ 詹森菌屬如cteri應(yīng))、纖毛菌屬(Z^teiArivT)、應(yīng)、甲基芽抱 桿菌屬況i77"60、嗜甲基菌目 ifeiAj^/(9ra/7/6\ 亞硝化單胞菌屬(Λ??Τ?λ5*6_/?^50、亞硝化螺菌屬(yVitrams^ira)、草 酸桿菌屬(^^7(9如以<9_/0、作_/^67/以(9_/'(97仏、極地單胞菌(/^7^/'(9避?/?^50、極地單胞菌 {Polaromonas) ^ Pusillimonas^ Rhodoferax^ ^ M M(^brivivax\ Sideroxydans^ Sutterella wadsworthensis、泰勒麗 MiTaylorel la)、^ -? ^ ^ jg ( Thauera)^ 硫桿菌屬(?ic^ci77"60、硫單胞菌屬貪菌屬(Kari^raraz)、 Verminephrobacter^ Anaeromyxobacter^^^^ (Bdellovibrio bacteriovorus) J% 舊 M^Bilophi la) H 礙敘舊 Desul farculus)、Desul fat ibaci I him、Desul fobacca、 你 67;7/(9如以(9_/^腫、脫硫蔥球菌屬(你 67/7/(9/^7/^60、脫硫球菌屬(你 67/7/6^(9<^"60、 DesulfohalobiumU'^V^'^M^DesulfitobacteriumyH'^i'^'WiM^Desulfomicrobium)、 /fe6Y/7/b/?atn9/?(0s77ira、/fe6Y/7/bte7<9a、脫硫弧菌屬(/fe6Y/7/bKi/?ri(9)、脫硫單胞菌屬 i Desul furomonas)、塊妖舊 MiiGeobacter)、Hal iangium、Hippea、散:床說 MiiLawsonia)、 眼點(diǎn)粘球菌屬(5^ig搬t(yī)e77a)、互營桿菌屬(5y/?tn9/?A(9/?況ter)、5y/?tn9/7to6\弓 形桿菌屬cter)、cter、彎曲桿菌屬(6?啞r7<9如cter)、螺桿菌屬 {Helicobacter)^ Nitratifractor^ Nitratiruptor^ Sulfuricurvum^ Sulfurimonas^ Sulfurospirillum、Sulfurovum、類妖 售[罵{Wolinella)、Buchnera、Blochmannia、 Handltonella、Regiella、Riesia、培魯後妖售[罵{Citrobacter)、Cronobacter、Dickeya、 愛德華菌屬(、腸桿菌屬(terete ter)、歐文氏菌屬(、埃希 氏菌屬克雷伯菌屬(Λ7<9/?6^773)、成團(tuán)泛菌屬(/如/?【6^)、果膠桿菌 屬(戶%、變形桿菌(/?*、普羅威登斯菌屬(/?*、拉恩菌屬 (7feA/?6*77a)、沙門氏菌屬(5^7ffi(9/?6*77a)、沙雷氏菌屬(ferraiia)、志賀氏菌屬(沢77沒)、 5btfe7i6\ 懦動桿菌屬(67(05*6^/^、致病桿菌屬(Ζ<9/?(9??60、耶爾森 菌屬(7ar6*i/?ia)、酸硫桿狀菌屬(如it/iiAic?如ci77"60、不動桿菌屬(如 氣奉觀舊罵{Aeromonas)、Alcanivorax、Alkalilimnicola、Allochromatium、交售 單胞菌目(j7ter_9/?atfe7(960、互生平胞菌屬(j7ter_9/?a60、應(yīng)貝日阿托 ^ MiiBeggiatoa)^ Bermanella^ Carsonella^ Ruthia^ Vesicomyosocius、j\j· If 胃 M (Cardiobacteriuni)^ 色鹽 If 菌罵 i Chromohalobacter)、ColwelIia、Congregibacter、 角兔琢 Coxiella)、Dickelobacter、Endori ftia、Enkydrobacter、Ferrimonas、% 朗西絲菌屬 iFrancisella)、Glaciecola、Hahella、嗜鹽菌屬 iHalomonas)、鹽紅螺旋 M M ^ Halorhodospira)^ 盈礙 Ψ{'舊 MiHalotkiobacillus)、Idiomarina、Kangiella、 軍團(tuán)病桿菌屬(/^^/(9/?<9773)、海桿菌屬(7^_/^/?(9如以(9_/1)、海單胞菌屬(7^_/^/?(9^9/?^50、 Methylobacter、% 基豫售[糧iUMethylococcus)、Methylomicrobium、Methylophaga、莫敬 菌屬(iforavT<977a)、嗜冷菌屬(ifori te77a)、Afe/? 況 ter、硝化球菌屬(Λ? 、 假交替單胞菌屬(遍9/?a60、嗜冷桿菌屬(cter)、/^tcA/?遍 Reinekea、克、伙 WMQ Rickettsiel la)、Saccharophagus、^\~KiJ^ 舊 Shewanel la)、 Succina timonas^ Teredinibac ter^ Thioalkalimicrobium^ Thioalkali^H. ^ jg (Thioalkalivibrio)^ Thiomicrospira^ Tolumonas^ ?j]I^ @ ( Vibrionales)^ ^M {ActinobaciIIus)^ Aggregatibacter^ Gallibacterium^ ^ ^{Haemophilus)^ 0? 組織菌屬(歷曼氏桿菌屬巴斯德菌屬固氮菌 屬(也6^(9如以<9_/〇、纖維弧菌屬(化77[//?_/^(9)、假單胞菌屬(/^饑/6_9/^60、47#[//?_/'7*(9、 6^避?/?以3、發(fā)光細(xì)菌屬(/%(9【(9如以(9_/^應(yīng))、發(fā)光細(xì)菌屬(/%(9【(9如以(9_/^應(yīng))、弧菌屬 (KiAricO、假黃單胞菌屬(/?^饑Z(0ra/?iA_9/?a60、狹長平胞屬(5?<9/?(9^η9/7Α·9/?^50、黃 單胞菌屬(心〃從(9?9/?a60、木桿菌屬(、疏螺旋體屬drrdia)、短螺旋體屬 鉤端螺旋體屬(Z^ifos^ira)、螺旋體屬(密螺旋體屬 {Treponema)、Hodgkinia、Puni ce ispiril him、Liber ibacter、Pe lagibacter、Odyssella^ 如cter,尤其是枯草芽抱桿菌(漢6Y//?ii7i60、巨大芽抱桿菌(漢?腫)、 谷氨酸棒桿菌(C 、大腸桿菌(A. coJ7)、假單胞菌屬(5/7.)、 焚光假單胞菌(/7Wore1Scefl1S)、惡臭假單胞菌(/??iit/a)、施氏 假單胞菌(5· ??izeri)、不動桿菌屬(Jci/?<9 ioAac ier sp·)、伯霍爾德桿菌屬 (Burkholderia sp. )> Burkholderia thaiIandensis^ IS ?Η IMl (cyanobacteria)> ^ 菌屬(Z/ev^sie^/a sp.)、產(chǎn)酸克雷伯菌(Z/ev^sie^/a ojyioca)、沙門氏菌屬(5^?0/7<977<3 壞>.)、根瘤菌屬5/7.)和苜蓿根瘤菌?<?h7oii)。在一個(gè)特別優(yōu)選 的實(shí)施方案中,所述細(xì)胞是腸細(xì)菌,最優(yōu)選大腸桿菌。
[0040] 當(dāng)根據(jù)本發(fā)明的全細(xì)胞催化劑除了脂肪酸還原酶、磷酸泛酰巰基乙胺基轉(zhuǎn)移酶 和轉(zhuǎn)氨酶而外還含有丙氨酸脫氫酶,以便從無機(jī)含氮分子再生在末端醛基的胺化過程 中被轉(zhuǎn)氨酶消耗掉的丙氨酸時(shí)是有利的。在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本文中使用的術(shù) 語"丙氨酸脫氫酶"被理解為是指這樣的酶:其在消耗水和NAD+的情況下催化L-丙氨 酸向丙酮酸鹽、氨和NADH的轉(zhuǎn)化和逆反應(yīng)。在一個(gè)特別優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述丙氨酸 脫氫酶選自包括以下丙氨酸脫氫酶的氨基酸